# 2016q3 Homework 3 ( compute-pi ) contributed by <`ierosodin`> ## 開發環境 作業系統 : CentOS 7 `$ lscpu` Architecture: x86_64 CPU op-mode(s): 32-bit, 64-bit Byte Order: Little Endian CPU(s): 12 On-line CPU(s) list: 0-11 Thread(s) per core: 2 Core(s) per socket: 6 Socket(s): 1 NUMA node(s): 1 Vendor ID: GenuineIntel CPU family: 6 Model: 45 Model name: Genuine Intel(R) CPU @ 3.30GHz Stepping: 5 CPU MHz: 1277.976 BogoMIPS: 6600.19 Virtualization: VT-x L1d cache: 32K L1i cache: 32K L2 cache: 256K L3 cache: 15360K NUMA node0 CPU(s): 0-11 ## 軟體安裝 ``` $ git clone https://github.com/sysprog21/compute-pi $ cd compute-pi $ make check $ make gencsv ``` ## 重現實驗 `$ time ./time_test_baseline` ``` N = 400000000 , pi = 3.141593 real 0m6.979s user 0m6.978s sys 0m0.001s ``` `$ time ./time_test_openmp_2` ``` N = 400000000 , pi = 3.141593 real 0m3.568s user 0m7.131s sys 0m0.002s ``` `$ time ./time_test_openmp_4` ``` N = 400000000 , pi = 3.141593 real 0m1.886s user 0m7.536s sys 0m0.001s ``` `$ time ./time_test_avx` ``` N = 400000000 , pi = 3.141593 real 0m3.340s user 0m3.331s sys 0m0.003s ``` `$ time ./time_test_avxunroll` ``` N = 400000000 , pi = 3.141593 real 0m2.030s user 0m2.028s sys 0m0.002s ``` ## 折線圖 嘗試利用result_clock_gettime.csv畫折線圖, 卻發現25000次所花費的時間有點長, 進入benckmark_clock_gettime.c才發現, 時間是25次的, 為了得到一次的時間, 先將loop次數改成1. ![](https://i.imgur.com/iaRY63t.png) ``` set title 'compute-pi' set xlabel "N" set ylabel "time(sec)" set xrange [100:25000] set terminal png set output 'output_plot.png' plot "result_clock_gettime.csv" using 1:2 w lp pt 7 lc 1 title 'baseline', "result_clock_gettime.csv" using 1:3 w lp pt 7 lc 2 title 'openmp_2', "result_clock_gettime.csv" using 1:4 w lp pt 7 lc 3 title 'openmp_4', "result_clock_gettime.csv" using 1:5 w lp pt 7 lc 4 title 'avx', "result_clock_gettime.csv" using 1:6 w lp pt 7 lc 5 title 'avxunroll' ``` ※ 寫成`gnuplot.gp` 執行`$ gnuplot gnuplot.gp` 發現data似乎在飄動, 嘗試增加data的資料數量: 修該Makefile中的 ``` for i in `seq 100 100 25000`; do \ printf "%d " $$i;\ ./benchmark_clock_gettime $$i; \ done > result_clock_gettime.csv ``` 詳細用法 : `$ man seq` ![](https://i.imgur.com/bgbGcsZ.png) 可以觀察出時間與分割的大小呈線性關係, 但折線圖仍不完美, 有許多不適用的data, 嘗試利用95%信賴區間重寫程式. ## 95%信賴區間 重寫benchmark_clock_gettime.c中的程式碼, 取樣100次後找出95%的信賴區間, 再刪除不適當的資料後取平均. ![](https://i.imgur.com/ZkHzbKK.png) 結果似乎沒有很明顯的差異, 將取樣次數拉到10000次: 10000次: ![](https://i.imgur.com/VkI74st.png) 不過10000次需要消耗相當多的時間, 於是嘗試平行化這部份 ### 平行化程式 ``` #pragma omp parallel default (shared) private(j) num_threads(12) reduction(+:suma, sumb) #pragma omp for schedule(static) ``` #### 平行化結果 (前面數字代表第i個迴圈) (begin為迴圈開始時間, last為結束時間, data為時間差) 未平行化的前幾筆結果 ``` 0 begin:23899.487297 0 last:23899.513484 0 data:0.026187 1 begin:23899.513515 1 last:23899.533334 1 data:0.019819 2 begin:23899.533366 2 last:23899.553033 2 data:0.019668 3 begin:23899.553059 3 last:23899.572796 3 data:0.019737 4 begin:23899.572828 4 last:23899.592506 4 data:0.019678 ``` 平行化後前幾筆結果 ``` 92 begin:23956.224151 0 begin:23956.224150 44 begin:23956.224157 52 begin:23956.224152 9 begin:23956.224151 68 begin:23956.224155 27 begin:23956.224154 36 begin:23956.224152 84 begin:23956.224148 60 begin:23956.224149 18 begin:23956.224153 76 begin:23956.224149 0 last:23956.256244 0 data:0.032094 1 begin:23956.256301 18 last:23956.260785 18 data:0.036632 ``` 解讀:整體速度變快了, 但資料的正確性有待商榷. #### 提出的疑惑 發現平行化後, 雖然整體執行速度很快, 但單個迴圈的時間變長了(data值變大了) 如平行化後第i = 0的迴圈, data為0.032094 然而未平行化前的迴圈時間僅0.026187 ##### 猜想一:誤差小, 可能是合理範圍 但經過100次迴圈後得到的結果, 未平行化得到的平均data值為0.019701, 而平行化後的平均值為0.030313, 差距似乎無法忽略 ##### 猜想二:是否在平行化的過程, 資料有相依的問題 每個迴圈的時間應該都是獨立的, 不會有資料相依的問題. ##### 猜想三:檢查assembly 還在解讀Q ## OPENMP threads = 12 嘗試將效能開到硬體的最大 ![](https://i.imgur.com/KJ2KewD.png) ![](https://i.imgur.com/OAFihX2.png) 發現openmp_12比avx_unroll還要快, 但嘗試在avx_unroll中的for迴圈加入omp, 卻沒有得到理想的結果 ## OPENMP Threads數量對效能影響 當Thread數 = Thread(s) per Core * Core(s) per Socket時, 效能最好 (N = 400000000) ![](https://i.imgur.com/V4RydLo.png) Threads 12 vs 16 (N = 100~25000) ![](https://i.imgur.com/MUfqYbU.png) ## ERROR 為了檢視五個function所得出的結果是否正確, 多新增了error.c, 比對實驗值與標準值的差異 >>參考[王紹華的共筆](https://hackmd.io/KYQwjARgZgTArAZgLQgJwAYpICyoMYAmSAHJiEggGzzqQEIDsqYQA===#) ![](https://i.imgur.com/PLSE8je.png) 發現其中四條曲線重疊, 唯獨avxunroll會不斷的飄動(擺動週期為N = 16), 原因為avxunroll中每一次for迴圈為16筆資料, 然而實驗的N並非16的倍數, 因此會產生數值錯誤的問題(餘數的部份不會算到). 例如N = 100, 在avxunroll中就只會算x = 0 ~ 95 ### 修正: 分別在avx與avxunroll之中, 增加了檢查N並非4的倍數與16的倍數, 並加以修正, 得到以下的結果圖. ![](https://i.imgur.com/0rqFZmT.png) ## 參考資料 [王紹華的共筆](https://hackmd.io/KYQwjARgZgTArAZgLQgJwAYpICyoMYAmSAHJiEggGzzqQEIDsqYQA===#) [信賴區間與信心水準的解讀](http://web.cc.ntnu.edu.tw/~494402345/CI/CI.pdf)