# Biopackathon 2024 #2 `@千葉`

## Info

[website](https://sites.google.com/view/biopackathon/biopackathon20242)

[COC](https://biopackathon.github.io/BioPCoC/)

## 「2024年2月版 LLM情報アップデート」

久米慧嗣 Satoshi Kume (@skume)

[OpenAI to release Text to Video generative AI](https://community.openai.com/t/introducing-sora-our-text-to-video-model/630289)

## 「最短で習得するPythonパッケージ開発入門」

露崎弘毅

[Biopackathon Tutorial](https://github.com/biopackathon/python-packaging-exercise)

- [Release Please](https://github.com/googleapis/release-please)
- Tool for documenting release versions from commit message

## 「エージェント・ベース・モデル、ポケモン、DAO など」（招待講演）

長田悠生 Yuki Osada (@Y)

筑波大

### Pokemon

<https://pokemon-ga-api.yukiosada.work/docs>

<https://pokemon-ga-document.yukiosada.work/>

### DAO

### WebAssembly

- [webr tool for running R code in browser](https://docs.r-wasm.org/webr/latest/)
- [repo](https://github.com/r-wasm/webr)

## 「研究・金融・OSS」（招待講演）

宮本丈 Joe Miyamoto (@joemphillips)

[Could Gambling Save Science](https://mason.gmu.edu/~rhanson/gamble.html)

# Lightning talks

## 露崎弘毅「PyTorchで行列分解をするPythonパッケージPyTorchDecompの開発」

## 久米慧嗣「chatAI4Rパッケージファミリーの拡張とその他諸々」

https://github.com/kumeS/chatAI4R

## 西田孝三「なぜパッケージング作業を行うのか?」

## 坂本七海「マススペクトルにおける脂質クラス分類モデル予測用Pythonパッケージの実装」

## 岡昂輝「リピドミクスデータをCytoscape上の代謝パスウェイに投影するRパッケージの開発」

https://cytoscape.org/

https://app.tappas.org/

## 長田悠生「Libraries.io の紹介など」

https://libraries.io/

https://business-card.yukiosada.work/

## Wrap-up

### [{dovetail}](https://github.com/joelnitta/dovetail)

- `use_crowdin_yml()`を[追加しました](https://github.com/joelnitta/dovetail/pull/21)

- カーペントリーズ本部と連絡をとって、徐々にcrowdinによる翻訳方法を普及している
- [翻訳ガイド](https://hackmd.io/@joelnitta/SkCSC6ZNT)を更新しました

- rsyncの依存によって{dovetail}がwindowsで動かないことを[発見しました](https://github.com/joelnitta/dovetail/issues/22)

### [{mtgr}](https://joelnitta.github.io/mtgr/)

- {arrow}でデータを読み込む方法についての[vignetteを書きました](https://joelnitta.github.io/mtgr/articles/arrow.html)

### その他

- [webr tool for running R code in browser](https://docs.r-wasm.org/webr/latest/)を知りました（@Y）

- 生成AIの最新情報をゲットしました（@skume）

- ニュースとかリリースをコミットによって自動的に作ってくれる[Release Please](https://github.com/googleapis/release-please)を知りました（@koki）
- example: https://github.com/chiba-ai-med/PyTorchDecomp/blob/main/.github/workflows/release-please.yml

- .command file extension on mac (@skume)

- SWCについて紹介させていただいて、認識度を少し上げました（？）