Le programme et informations:
http://community.oscedays.org/t/rennes-osce-days-june-2017/5861
Et
Et
Documentation existante de ByodIT
Starter kit :
Principe
Ce protocole de la colonne a été développé parce qu'en partant du principe que le fonctionnement de la microflore ne devait pas être envisagé comme la somme d’activités individuelles mais considéré comme un ensemble d’activités microbiennes, un collectif « auto-régulable ».
Le but de la manipulation est de recréer dans chaque colonne un "mini-écosystème" centré sur le cycle du soufre : des hétérotrophes anaérobies utilisant la cellulose produisent des acides gras. Ces derniers constituent une source de carbone pour des bactéries sulfatoréductrices qui utilisent les sulfates comme accepteurs d'électrons et les réduisent en sulfure d'hydrogène.
ByodIT
├─Colonne de Winogradsky
│ ├─7 couches de Terre
│ │ ├─répetoire des zones de prélèvements
│ │ ├─ Vulgariser la descrit° de la colonne
│ │ └─flécher les BDD utilisées
│ ├─Faire une carte OSM ByodIT
│ │ ├─zones de prélèvements
│ │ ├─Spot récupérations du "Matos"
│ │ └─img des prélèvement
│ └─Assemblage de la colonne
│
├─Dispositif Arduino
│ ├─captation donnée T°
│ ├─captation donnée Humidité
│ ├─Captation de donné de luminosité
│ ├─Autres données ? à définir
│ └─Convertion des données en langage (Son / lumière?)
│
├─Dispositif Raspberry
│ ├─Objet communicant
│ │ ├─Data set disponible
│ │ └─Autres ByodIT
│ ├─Chaine Locale
│ │ ├─Ethereum ou #G1
│ │ ├─Voir avec Daise.org
│ │ └─smart contract
│ └─Chaine
└─Assemblage du Totem ByodIT
Les personnes présentes :
Erwan Rabenevanana : entrepreneur Franco Malgache dans le secteur des micro-algues, Equitalgue
Xavier Coadic, biologiste, entrepreneur, co fondateur du Biome HackLab
Aurore Jamet:a connu l’évènement par bouche à oreille, “je découvre le groupe, le sujet, c’est un éveil à une nouvelle notion pour ma part grande découverte que je creuserais de mon côté”.
Matthieu Brient :
facilitateur @lasophiste @labfabfr @museomixouest …
Je viens pour :
– rencontrer (vous, d’autres curieux.se.s)
– apprendre (biologie, développement, documentation … )
– partager et contribuer
Roland Delicado :
Etudie MSC “management de projets créatifs, culture et designer”.
J’ai découvert le hackathon par le partage sur Linkedin via 15 marches. Je participerai par intermittence. Je suis intéressé par la traduction des données bio en langage sensible et par l’utilisation du kit Aliapur.
Anne-Bérengère Siroen :
Diplômée EME master spécialisée en économie circulaire.
Intéressée par le côté collectif du projet, intelligence collective de l’idée de l’Open Source.
Mise en oeuvre opérationnelle du biomimétisme. `
Jacques Le Letty :
Chargé de mission environnement à la MCE.
Appui ponctuel (OSM, naturaliste) et description wiki.
Erwan Rabenevanana :
Entreprenneur social dans les micros-algues. D'une culture familiale en biologie, biomimétisme, et la nature m'ont toujours passionné. Je viens pour de nouvelles rencontres et pour apprendre à construire une colonne de Winogradsky.
Didier Nicot :
naturaliste amateur. J'ai entendu parlé de vernadsky mais pas encore de Winogradsky
Identification d'un support permettant de stabiliser le marqueur par une 1ère personne et à la fois de stabiliser la bouteille pour lui faire effectuer un mouvement rotatif uniforme, par une 2ème personne. Utilisation d'un fut keykeg 30 litres, d'une chaise et d'un mur comme appui Cf. photo ci-dessous pour visualiser :
Photo 1/2 : stabilisation des éléments
Photo 2/2 : résultat
Présents :
On trouvera ci-dessous un tableau faisant le bilan des diverses bactéries susceptibles de se développer dans la colonne avec leurs exigences nutritionnelles.
Genre principal | Source d'énergie | Source de carbone | Type nutritionnel | Dépendance au dioxygène |
---|---|---|---|---|
Clostridium | Oxydation de substances organiques | Substances organiques | Hétérotrophe | Anaérobie |
Desulfovibrio | Oxydation de l'hydrogène organique ou minéral | Substances organiques ou dioxyde de carbone | Hétérotrophe ou chimiolithotrophe | Anaérobie aérotolérant |
Chlorobium | Lumière | Dioxyde de carbone | Photolithotrophe | Anaérobie |
Chromatium | Lumière | Dioxyde de carbone | Photolithotrophe | Anaérobie |
Rhodospirillum | Lumière | Substances organiques | Photorganotrophe | Anaérobie |
Beggiatoa | Oxydation du sulfure d'hydrogène | Dioxyde de carbone | Chimiolithotrophe | Anaérobie facultatif |
Thiobacillus | Oxydation du sulfure d'hydrogène | Dioxyde de carbone | Chimiolithotrophe | Aérobie |
Rhodospirillum | Lumière | Substances organiques | Photorganotrophe | Anaérobie |
Beggiatoa | Oxydation du sulfure d'hydrogène | Dioxyde de carbone | Chimiolithotrophe | Anaérobie facultatif |
Thiobacillus | Oxydation du sulfure d'hydrogène | Dioxyde de carbone | Chimiolithotrophe | Aérobieulgarisa |
Ou tourbe, composant principal pour amorcer un colonne de Winogradsky et les processus bacterien associés.
Les eaux stagnantes ou eaux dormantes sont, en écologie et en hydrologie, des étendues d'eau douce où l'eau ne circule pas ou très peu. Il peut s'agir de flaques, de trous d'eau, de petites mares, de chenaux ou de petits bras morts fermés, et plus rarement d'étangs, de lacs ou de marais avec eau libre puisque ces-derniers sont généralement animés de courants créés par le vent.
En Bretagne, plutôt eaux acides.
(http://educatif.eau-et-rivieres.asso.fr/pdf/livret-zones-humides.pdf)
Plus d'informations sur la formation des tourbières :
http://www.vdsciences.com/medias/files/tourbiresvo-sud.pdf
http://www.pole-tourbieres.org/a-la-decouverte-des-tourbieres/article/comment-se-forment-les-tourbieres
Fiche description des prélèvements à réaliser sur site
Démarche à suivre
Qualification des ressources naturelles prélevées :
Répartir un échantillon de terre dans 2 récipients.
Dans l'un verser du vinaigre blanc. Si le vinaigre réagit (bulles), le sol est alcalin. Dans l'autre, verser du bicarbonate, qui devrait pétiller, signifiant que le sol est acide.
source : http://fr.wikihow.com/tester-le-pH-de-votre-sol
Mode opératoire :
sur la zone identifiée, enlever la couche superficielle (5cm) de terre puis remplir les contenants à terre avec la terre issue du trou
Quantification des ressources à prélever :
Soit 2/3 de terre et 1/3 d'eau, soit l'inverse.
Dans le cas d'un mélange avec 2/3 d'eau et 1/3 de terre la réaction sera plus longue qu'avec 2/3 de terre et 1/3 d'eau.
En fonction du nombre et de la contenance des colonnes, mesurer la quantité de liquide et de terre à prélever.
Matériels
Quantité à préléver
Nous prevoyons de faire 5 colonnes, 4 en bouteille d'1,5 l et un bidon de 30 l, soit 36 l au total.
Sur chaque "naturel":
Sur le site "friche urbaine"
Intégrer une demi cuillère à café de 2,5 mL de la solution tampon pour une colonne de Winogradsky de 1,5 L.
Pour réaliser ce tampon pH :
Pour une colonne d'1,5l :
Pour une colonne d'1,5 L
Voir la carte
Une carte open source, open data, et collaborative sur le projets ByodIT et les différentes installations un peu partout.
Une carte volontairement "dark" pour y insérer des zones de vert dans les villes :
L'objectif est de prolonger l'intérrogation que provoque la colonne par un "verdissement" carto-numériquedes espaces urbains. En objectif également, relier les différentes installation byodIT et uatres dispostifs connectés avec leaflet par exemple.
2 litres de terre
1 litre d'eau
20 litres de terre
10 litre d'eau
le petit bassin en question
Test au papier pH
Test au vinaigre puis au bicarbonate de calcium
Observation d'un échantilloon au microscope polarisant, grossissement ×
Prairie Saint-Martin :
Eau + terre noire (supposée riche en fer)
Etagne d'Apigné, ruisseau la planche:
Eau + Tourbe
Résultats :
///////// à revoir pour mieux expliciter la démarche de connectivité
L'idée est de pouvoir récupérer les données de luminosités reçue par la colonne de Winogradsky. Ces données participent à la comréhension du développement de biomes bactériens spécifiques.
Dasn un deuxième temps, un dispositif amélioré sera intégré à l'intérieur de la colonne pour des relevés de données intra colonne.
/////////
Matériels :
Sans wifi à la MCE, la connectivité s'exécute dans cette expérimentation via un shield Arduino Ethernet vers Dweet.io : https://dweet.io/get/latest/dweet/for/ByodIT-light-sensor
Datavisualisation en temps réel sur ce lien : https://freeboard.io/board/r7fGnO
Code source "ByodIT light sensor" : https://github.com/LeBiome/Hackathons/blob/master/oscedays/ByodIT-light-sensor-code
TODO Dev :
Pour chaque site de prélèvenemts, faire :
Nous avons fait 2 petites colones avec le prélèvements de la prairie St Martin, deux recettes :
Mode facile
Mode intermédaire
Pour la collone de 30 litres, avec les prélèments du ruisseau de la planche, nous avons fait :
Présents :
Ouverture de la prépartion d'une "local blockchain (using Parity client) utilisant une application BydIT sur raspberry 3 pour échanger das contrats de données entre différents dispositfs ByodIT et d'autres dispositifs apparentés. Voir le (github/wiki](https://github.com/LeBiome/Proto_et_Projets/wiki/2.-Ethereum)