47th Workflow Meetup (2021-12-01 Wed)

# 47th Workflow Meetup (2021-12-01 Wed) ================================ [20211201 · workflow\-meetup\-jp/workflow\-meetup Wiki](https://github.com/workflow-meetup-jp/workflow-meetup/wiki/20211201) 2021-12-01(Wed) 13:00 - 19:00 まで。完全リモートのため、全世界どこからでも参加可能。 # 事前計画 ## 全体 - 海外のRSE普及活動に倣ってworkflow meetupが目指すところを具現化する - https://rse-asia.github.io/RSE_Asia/ - GHCRのコンテナ容量問題が解決したかを、みなさんにたずねる。 - 2021年12月1日、GHCRのコンテナ容量問題は特に顕在化してきていないので、また次回まで観察 - docker hub ライセンスについて - ９月１日くらいの時点では pull の数に制限があるのではないか？ - https://www.docker.com/pricing > Anonymous Users 100 pulls per 6 hours - 2021年12月1日、publicならGHCRで問題がない感じがある。 - [Jupyterlabのコラボのハンズオン](https://github.com/workflow-meetup-jp/handson/tree/main/20210602) - CWL User Guideを動かす - スクラッチからどれくらいで準備ができるか - dockerはつかえなさそうだがどうなんだろう。 - udockerをいれればよいではないか？ - `rootless docker` ? - binderは、OSはUbuntuの18.04です - binderとngrokがあれば、Galaxyをたてられるんではないか？ - グラフの書き換えがみんなにわかるとよいだろう - y=2xのグラフをy=3xにしたら、全員の画面がかわればそれはそれで便利そう。 - Advent Calendarを作る - 作った - [Common Workflow Language \(CWL\) Advent Calendar 2021 \- Adventar](https://adventar.org/calendars/7131) ## 石井 - 次回１月１２日水曜日 - 2021年度は、月の第一週の水曜日13時スタートの方向。ただし、月曜日など他の日になるかもしれないです。 ## 西田 - いったんワークフロー技術のノウハウの情報共有から離れようと思っています。 - 海外のRSEコミュニティの運営方法を学び、日本でそれを広めるための方策と実行をここで検討します。 - 「海外のRSEコミュニティ」とこのコミュニティのメンバーが持つ性質が似ているため - このコミュニティの目標をより明確にするため ## 丹生 - [schema-salad-d](https://github.com/tom-tan/schema-salad-d) いじり ## 末竹 # こうなりました ## 全体 ### RSE - Research Software Engineers - [Research Software Engineers \| Research Software Engineers International](http://researchsoftware.org/) - [RSE Asia Associationさん \(@RSE\_Asia\) / Twitter](https://twitter.com/RSE_Asia) - 参考: 学会誌コンピュータソフトウェア - 通常の研究論文と異なり、ソフトウェアの完成度などが評価尺度の論文カテゴリがある - https://www.jssst.or.jp/edit/detail/software_papers.html ### JupyterLabのgithubサイトを作る ## 石井 - 今回の案内をし忘れているところがあったので、次回の案内の設定をおこなっている。 - 次回は2022年1月12日 - sparqlをパースしようとしたら、S式がでてきた。まぁそうなるよね。という感じではある。 ## 西田 - とにかくカーペントリーズ日本語チームの活動を進める - このコミュニティとは別に日本のRSEコミュニティを作る ## 丹生 - [schema-salad-d](https://github.com/tom-tan/schema-salad-d) 実装のために [Salad](https://www.commonwl.org/v1.2/SchemaSalad.html) いじり - schema-salad-tool の[仕様に記述がない挙動を報告](https://github.com/common-workflow-language/schema_salad/issues/478) - 既に各所で使われているので直らなさそう… - [Implied context](https://www.commonwl.org/v1.2/SchemaSalad.html#Implied_context) でも [Explicit context](https://www.commonwl.org/v1.2/SchemaSalad.html#Explicit_context) でもない[謎の salad document](https://github.com/common-workflow-language/schema_salad/blob/main/schema_salad/metaschema/field_name.yml) が [import できてしまう](https://github.com/common-workflow-language/schema_salad/blob/e90a5574519c29b6887a962ec4d408ccb00eb526/schema_salad/metaschema/metaschema.yml#L16)問題 - 仕様に色々記述が少ないせいで、どう報告したものか途方に暮れている - そもそも implied context と explicit context 以外で書かれた salad document が valid なのか否か - salad document とはそもそもなんなのか > A Salad document must consist only of either a single root object or an array of objects. - なんもわからん… - [CWL AC](https://adventar.org/calendars/7131) の[初日の記事](https://zenn.dev/tom_tan/articles/c28db83721a98e)を書いた - ほぼ昨年度と同じ ## 末竹 ## 池田 ## Joel Nitta (石井記述) - [ワークフローmeetup 2021-12-01](https://hackmd.io/r862GIecT2-XFLAVm7aoNA) - RSE # 前回のミートアップから今回のミートアップまでにSlackなどにあったリンクメモ - ここから書く - [TogoTV へようこそ！ \| TogoTV](https://togotv.dbcls.jp/welcome.html) - TogoTV は2007年7月からはじまっているようだ。 - [RSE Asia Associationさん \(@RSE\_Asia\) / Twitter](https://twitter.com/RSE_Asia)