47th Workflow Meetup (2021-12-01 Wed)

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20211201 · workflow-meetup-jp/workflow-meetup Wiki

2021-12-01(Wed)
13:00 - 19:00 まで。

完全リモートのため、全世界どこからでも参加可能。

事前計画

全体

• 海外のRSE普及活動に倣ってworkflow meetupが目指すところを具現化する

  • https://rse-asia.github.io/RSE_Asia/

• GHCRのコンテナ容量問題が解決したかを、みなさんにたずねる。

  • 2021年12月1日、GHCRのコンテナ容量問題は特に顕在化してきていないので、また次回まで観察

• docker hub ライセンスについて

  • ９月１日くらいの時点では pull の数に制限があるのではないか？
    • https://www.docker.com/pricing

      Anonymous Users 100 pulls per 6 hours

  • 2021年12月1日、publicならGHCRで問題がない感じがある。

• Jupyterlabのコラボのハンズオン

  • CWL User Guideを動かす
  • スクラッチからどれくらいで準備ができるか
  • dockerはつかえなさそうだがどうなんだろう。
    • udockerをいれればよいではないか？
    • rootless docker ?
  • binderは、OSはUbuntuの18.04です
  • binderとngrokがあれば、Galaxyをたてられるんではないか？

• グラフの書き換えがみんなにわかるとよいだろう

  • y=2xのグラフをy=3xにしたら、全員の画面がかわればそれはそれで便利そう。

• Advent Calendarを作る

  • 作った
  • Common Workflow Language (CWL) Advent Calendar 2021 - Adventar

石井

• 次回１月１２日水曜日
  • 2021年度は、月の第一週の水曜日13時スタートの方向。ただし、月曜日など他の日になるかもしれないです。

西田

• いったんワークフロー技術のノウハウの情報共有から離れようと思っています。
• 海外のRSEコミュニティの運営方法を学び、日本でそれを広めるための方策と実行をここで検討します。
  • 「海外のRSEコミュニティ」とこのコミュニティのメンバーが持つ性質が似ているため
  • このコミュニティの目標をより明確にするため

丹生

• schema-salad-d いじり

末竹

こうなりました

全体

RSE

• Research Software Engineers
• Research Software Engineers | Research Software Engineers International
• RSE Asia Associationさん (@RSE_Asia) / Twitter
• 参考: 学会誌 コンピュータソフトウェア
  • 通常の研究論文と異なり、ソフトウェアの完成度などが評価尺度の論文カテゴリがある
  • https://www.jssst.or.jp/edit/detail/software_papers.html

JupyterLabのgithubサイトを作る

石井

• 今回の案内をし忘れているところがあったので、次回の案内の設定をおこなっている。
  • 次回は2022年1月12日
• sparqlをパースしようとしたら、S式がでてきた。まぁそうなるよね。という感じではある。

西田

• とにかくカーペントリーズ日本語チームの活動を進める
• このコミュニティとは別に日本のRSEコミュニティを作る

丹生

• schema-salad-d 実装のために Salad いじり
  • schema-salad-tool の仕様に記述がない挙動を報告
    • 既に各所で使われているので直らなさそう…
  • Implied context でも Explicit context でもない謎の salad document が import できてしまう問題
    • 仕様に色々記述が少ないせいで、どう報告したものか途方に暮れている
      • そもそも implied context と explicit context 以外で書かれた salad document が valid なのか否か
        • salad document とはそもそもなんなのか

          A Salad document must consist only of either a single root object or an array of objects.

        • なんもわからん…
• CWL AC の初日の記事を書いた
  • ほぼ昨年度と同じ

末竹

池田

Joel Nitta

(石井記述)

• ワークフローmeetup 2021-12-01
  • RSE

前回のミートアップから今回のミートアップまでにSlackなどにあったリンクメモ

• ここから書く
• TogoTV へようこそ！ | TogoTV
  • TogoTV は2007年7月からはじまっているようだ。
• RSE Asia Associationさん (@RSE_Asia) / Twitter