Julia 使用心得

了解使用心得

• 用在生物系統模擬
  • Catalyst.jl
  • DifferentialEquations.jl
  • 有很多非線性的酵素反應
  • 需要特定的演算法解微分方程
  • 需要平行運算
  • 機率模型的估算
• 原本用 Python
  • 需要 ODE solver
  • 需要大量解微分方程
  • Python scipy 幫助有限
  • Matlab 也是選項, 但不是 open source 且沒有像 DifferentialEquations 那麼齊全
• 缺點
  • 預編譯 (precompilation) 需要一段時間, 雖然在改善中了

Julia的效能（比如與其他語言相比差多少等等

• 如果要迴圈與迭代: Julia 會很快
• 要達到最佳效能, 不用寫兩種語言
  • 以前要 Python -> C++
  • 或 Matlab -> C++
• 可以擴充 Composable
  • Multiple dispatch (多重派發)
  • 可以擴充別人的套件, 和自己的功能結合
  • https://github.com/stevengogogo/FindSteadyStates.jl

你看到的Julia在學術界的發展

• JuliaSim
  • DifferentialEquations.jl
  • DiffEqFlux.jl
  • DataDrivenDiffEq
  • ModelingToolkit
• Agent based modeling: Agent.jl
  • 目前最快最彈性的套件
    • Previous: Netlogo, Mesa (Python3)
• Basyian Statistics
• Climate simualation
  • Previous: Fortran
• Quantitative Economics
• Data science
  • Flux.jl
  • Taiwan
    • GeometricFlux.jl
    • Transformer.jl
• Pharmaceutical modeling
  • Previous: NOMEM, R
  • Require Basyian statistics, simulation -> slow
  • Julia is a promising solution
  • Pumas-AI