GTnotebook
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    # 18/09/2023 - 13h30-15h30 - visio ## ODJ (Work in Progress) ### Bilan Webinaires [chaîne canal U TV](https://www.canal-u.tv/chaines/gt-notebook)) Sebastien / Raphaëlle / ? ### Proposition d'évolution du [site Web](https://gitlab.huma-num.fr/gt-notebook/site_quarto) Hugues / Raphaëlle / ? ### Activités sous groupes de travail #### Animation de la discussion/présentation de : - [Charte](https://pinkmypad.net/hackmd/bkJ4M0ZwRPyE-7nS9bKEJA) - Nicolas ? - base de connaissances [ajout post AG] - PKM (org/org-roam) - Zotero - Marion ? (Raphaëlle) - Doranum - Hugues ? - Data Journal SHS / Plateformes en lien avec les *Executable papers* ? Feedback [GT Data Journal SHS](https://mypads2.framapad.org/mypads/?/mypads/group/creation-data-journal-shs-gd54mw94p/pad/view/creation-data-journal-shs-xf54nw95c) #### Info événements - Digithum 12/10/2023 (vidéo à venir) ### Perspectives (voir TGIR Humanum, rdvz avec Stéphane), ? futur de Callisto, cahier des charges sous-jacent ? - Essayer de documenter les spécificités du workflow éditorial lié aux "executable paper" vis à vis des data-paper plus classiques - Faire remonter les critères minima (humains, techniques, méthodologiques) pour faire de "l'execution d'article de données", soit de façon autonome ou semi autonome (TGIR, etc.) soit en s'appuyant sur des infrastructures externes existantes (gitlab, etc.) - Journée d'étude ? Financement ? # éléments de CR ## coopération HumaNum/INSHS - retour sur l'expérience HNLab 2 projets différents : - vision "écosystème" (nakala, gitlab, nb pédgogiques (projet IO), kernels shs) - serveur de calcul bien doté - tps de calcul, service qui fonctionne, utilisateur confirmé, ne s'adresse pas trop à la communauté en devenir SHS quid d'un FNSO ? (pour HNlab) - re.sciences - N. Rougier, changement d'infra - quid d'un prototype ? - HumaNum est présent sur l'appel FNSO depuis le début, mais a investi sur le lien Nakala/Isidore # thématiques 2024 du GT ## notion d'objets intermédiaires / objet frontière ++ Papiers meritant peut être d'être relu (Anthropo, Software design): - Etude de la "Compréhension du code par les développeurs", méta review https://arxiv.org/abs/2206.11102 - Sur la reproductibilité des notebooks: https://arxiv.org/abs/2308.07333 - Wagemann J, Fierli F, Mantovani S, et al. (2022) Five Guiding Principles to Make Jupyter Notebooks Fit for Earth Observation Data Education. Remote Sensing 14(14). DOI: 10.3390/rs14143359. - MOON: Assisting Students in Completing Educational Notebook Scenarios : https://arxiv.org/abs/2309.16201 - Five Guiding Principles to Make Jupyter Notebooks Fit for Earth Observation Data Education Remote Sensing, 2022. https://www.mdpi.com/2072-4292/14/14/3359 Raphaelle : Dessiner un peu mieux les usages, recherche en train de se faire, publication scientifique ? Enjeu pour les SHS, celui de la littéracie. Toutefois pas sur que cela soit seulement le cas des SHS, la biologie par exemple, il semble aussi y avoir un gap entre ceux qui font le code et les autres. ## Notebook vers publication ? => trajectoire courante ou pas ? oui, en sciences politiques notamment @emilien Vers une généralisation de l'émission de document, avec ou sans code, avec Quarto. Autre type de pratique. Quarto a rendu l'exercie plus accessible surement, mais pour nico la pratique coexistait déjà. Notebook essaime au delà de la personne qui l'a créé initialement => collaboration Absence de cas d'usage également ? On ne voit jamais les Notebook, ce n'est pas un objet présentable (voir la [présentation d'A. Legrand](https://reproducibility.gricad-pages.univ-grenoble-alpes.fr/web/presentation_010623.html#presentation_010623), du [réseau RR](http://www.recherche-reproductible.fr/news/2023/06/01/Reproducibility-with-emacs-org-mode.html). ## Récolte/collecte d'usages ### Notebook surtout utilisé pour la pédagogie - code livré avec des outils spécifiques (compilés par data centre) - ou ssh, git etc. - sauf en astronomie par exemple, Jupyter / expérimentation - retour rapide - ou en neuro, envoi d'un NB avec le résultats & commentaires, "vision linéaire" de l'analyse des données, utilisable en réunion en temps réel (facilite les échanges) - ou export en html du notebook, en lecture linéaire, abstraction du computationnel, le cas échéant ### Enquête(s) - résultats de l'enquête datactivist => Repartir de là ? - Urfist Lyon Emilien => Projet recolte d'usage ? (voir 12 octobre) => plusieurs points de collecte possible autour des cas d'usages, cela serait intéressant de creuser. ## Penser au delà du cas d'usage, regarder le couple autour de l'objet : Technicien, Usager, Public etc. / littératie / épistémologie Idem pour la donnée. question de reproductibilité posée à la communauté trajectoire des outils - retour sur des objets proposés par les chercheurs eux-mêmes... genèse d'outils - trace de ce qui s'est passé... # Interventions webinaires 2024 : - invités : Vincent Bontems, Baptiste Mélès, ... - (retours d'expériences / usages / pratiques informatiques en SHS) : DigitHum, EVEille, Rzine, RR # MAIL 26-27/10 au copil Salut, nous reprenons rapidement de fil du GT depuis la réunion du 18 septembre. Le projet de CR figure ici : https://hackmd.io/2SlaRwI8TResHbBux4zWCg Nous proposons deux actions à court terme : - la réponse à un appel à **co-financement de notre JE 2024**, dont la date reste à fixer - disons juin 2024 Il s'agit d'un appel de notre fédération SHS rouennaise, auquel il nous faut répondre **avant le 1er décembre** (un résumé et un montage financier, disponible ici https://irihs.univ-rouen.fr/fr/article/lancement-de-lappel-projets-2024-de-lirihs). Pour cela, nous vous proposons d'échanger sur la forme et le contenu de cette JE du GT **en novembre ([evento](https://evento.renater.fr/survey/gt-notebook-reunion-copil-k3ro62sp))** et des possibilités pour nos laboratoires d'y participer financièrement (des tickets à 500 - 1000 euros par structure par exemple). - un courriel sur la liste large, afin d'informer de la suite de nos actions ! Nous envisageons de reprendre le webinaire en **février 2024**, comme l'année dernière, mais aussi de mettre en oeuvre certaines actions / réalisations. A cette fin, un courrier à la liste large permettrait aussi de partager/répartir ce travail (ou d'autres initiatives) avec des volontaires. (voir https://hackmd.io/2SlaRwI8TResHbBux4zWCg#MAIL-newsletter-2024) - quelques tâches à réaliser à court/moyen terme Parmi les actions "rapides", il est possible de revoir: - le site web du gt (voir notamment le nom de domaine, l'organisation générale etc.) - la base de connaissances (en lien avec Zotero), qui repartirait sur une écriture org/org-roam. _Sur ces deux volets ci-dessus, nous pouvons nous organiser en parallèle via le gitlab._ - la charte, qui évolue... : https://hackmd.io/bkJ4M0ZwRPyE-7nSbKEJA?both - un article de position du GT sur le notebook, ébauché ici : https://hackmd.io/T_-VP3dKS_adR0ylnnejhg?view Qu'en pensez-vous ?

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