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# System prepended metadata

title: 額外軟體

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# 額外軟體
## VDM
### 參考網站
VMD(Visual Molecular Dynamics)教程
[VMD(Visual Molecular Dynamics)教程(1)](https://zhuanlan.zhihu.com/p/101565900)
[VMD(Visual Molecular Dynamics)教程(2)](https://zhuanlan.zhihu.com/p/102216008)

輸入檔案主要為pdb檔
lammps配合使用可使用dump檔
也可將pdb檔轉成lammps input data file

## packmol
### 下載
[packmol-20.010-1.el7.x86_64.rpm](https://centos.pkgs.org/7/epel-x86_64/packmol-20.010-1.el7.x86_64.rpm.html)
### 基本介紹
[PACKMOL](http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/userguide.shtml)
## moltemplate
### 下載
[moltemplate from github](https://github.com/jewettaij/moltemplate)
download and run a example ->[Install Moltemplate| Moltemplate installation| Butane-CH3-CH2-CH2-CH3 -creation & relaxation example](https://www.youtube.com/watch?v=rBHyWjWVyaA)

## material studio
[计算材料学-裡面有蠻多介紹](https://www.zhihu.com/column/jisuancailiao)