13th Workflow Meetup まとめ ========================== 次回は、2019年3月27日水曜日 # 全体 - ワークフローミートアップの概要を書いた - [Workflow Meeup概要 · manabuishii/workflow\-meetup Wiki](https://github.com/manabuishii/workflow-meetup/wiki/workflow-meeup%E6%A6%82%E8%A6%81) - 最初に提案し、原案を書いてくださった、西田さん++ # 石井 - ワークフローミートアップの概要を書いた - ジョブキューシステムの待ち合わせについて、原始的な方法を書いた - [qsubして、雑にジョブが終わるまで待つ \- Qiita](https://qiita.com/manabuishiirb/items/cdfd3f1c947220d9d22a) - 丹生さんと、クラウド利用などについて議論した。 - オンデマンドクラウド - [学認クラウド|大学や研究機関のクラウド導入・活用をサポート](https://cloud.gakunin.jp/) - 北大のサーバサービス - [サーバサービス  – 学際大規模計算機システム](https://www.hucc.hokudai.ac.jp/intercloud/server-service/) # 西田 - ワークフローミートアップの概要を書いた # 丹生 - ワークフローミートアップの概要を書いた - ミートアップ内でのワークフローの定義 - SRX ベースのワークフローエンジンの動作確認・完成度向上のため、[pitagora/cwl](https://github.com/pitagora-galaxy/cwl)で動作確認 - エンジンのバグを発見 - cwl-inspector のバグつぶし - `default` フィールドについて - 無効値としての `null` と `"null"` 型の値としての `null` を区別したい - バグを潰しきれなかった - 変更前 (実はバグがある) ``` 167 tests passed, 1 failures, 29 unsupported features ``` - 変更後 ``` 166 tests passed, 2 failures, 29 unsupported features ``` # 池田 - geneXplain platformのapiについてちょっと調べてみた - geneXplain platformは独geneXplain社のwwwベースのバイオインフォマティクス解析ツール(Galaxyのようなもの) https://genexplain.com/genexplain-platform/ - Freeアカウントの取得が可能(15MBのストレージしか割り当ててもらえないけど)https://genexplain.com/genexplain-platform-registration/ - githubにjavaのAPIが登録されている https://github.com/genexplain/genexplain-api - というわけでapiの中身を利用して、利用可能なツールのリストを取得するコードを書いてみた => [geneXplain platform の apiを利用してみた](https://qiita.com/percipere/items/606ba5c41125f409334f)