# 79th Workflow Meetup (2024-07-10 Wed) ================================ [20240710 · workflow\-meetup\-jp/workflow\-meetup Wiki](https://github.com/workflow-meetup-jp/workflow-meetup/wiki/20240710) 2024-07-10(Wed) 13:00 - 19:00 まで。 完全リモートのため、全世界どこからでも参加可能。 # 事前計画 ## 全体 ## 石井 - 次回は、8/7(Wed)、それ以降は、仮の予定。もしかしたら * 9/4(Wed) * 10/2(Wed) * 11/13(Wed) * 12/4(Wed) * 1/15(Wed) * 2/5(Wed) * 3/5(Wed) * 4/2(Wed)、仮 * - 2023年度は、月の第一週の水曜日13時スタートの方向。ただし、月曜日など他の日になるかもしれないです。 - たいてい第１木曜日は、pitagora meetup ありとおもわれる # こうなりました ## 全体 ## 石井 - toilの内部を探る予定 - vscodeでみれるようになったとおもっている。 - 手順などは[ここ](https://github.com/manabuishii/cwl-samples-2023/tree/main/fail-scatter-examle)で書く予定 - vscodeメニュー表示がおかしくなったが、"Reset All Menu"でなおった。 - 壊す方法がわからない気がしている。 - きょうはじめておきた - この問題の解答はヤフー知恵袋でもでてくるので、おおくの人がなっている可能性がある。 - 目標1.中を見ていって、CWLのジョブと、slurmとかジョブスケジューラのjobidの対応とか取得できるのか？ - 目標2.失敗したジョブ以外で成功したジョブの結果を取り出したい - 失敗したジョブが存在しなかったことにしたい（できれば） - 現状２０万件のうち１つ壊れていても、残りの199999が取り出せない。 ## 丹生 - [DBCLS BioHackathon 2024](http://2024.biohackathon.org/) の参加登録 -> done! - [rclone](https://rclone.org/) の利用方法の確認 - 独自のプロキシ設定は持たず、`HTTPS_PROXY` 環境変数によりプロキシ設定を制御している - …ということを忘れていてハマっていた - `rclone` から s3 バケットにアクセスするときのみプロキシを経由させたいため、`HTTPS_PROXY` を `.bashrc` などに書くのは適切ではない - `s3cmd` は独自のプロキシ設定が可能なため問題にはならない - 以下のラッパー(`with-proxy`)を作成して解決することにした ```sh #!/bin/sh env HTTPS_PROXY=http://133.39.232.2 "\$@" ``` - `with-proxy rclone ...` でうまいことやってくれる - 検証用ノードの時刻がずれていたため報告… - [cwltest#209](https://github.com/common-workflow-language/cwltest/pull/209) 対応は手が付けられず… - 上記はマージ済みだが、CWL v1.0-v1.2 の run_test.sh にも対応が必要 ## # 前回のミートアップから今回のミートアップまでにSlackなどにあったリンクメモ - ここから書く