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# System prepended metadata

title: 電腦選豬仔 (超級賽亞豬)
tags: [基因體]

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電腦選豬仔 (超級賽亞豬)
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###### tags: `基因體`

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## [台灣畜產種原資訊網](http://www.angrin.tlri.gov.tw/)
- [豬隻資訊](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig_all.htm)
    > 收錄了1974年以來台灣種豬的詳細資訊
    - [豬名字查詢](http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/rpc.asp)
        - [冠斯 222862](http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/Yresult2.asp?RPC=222862)
        - [亞博 225352](http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/Yresult2.asp?RPC=225352)
    - 台灣三大豬種：
        - 藍瑞斯 (代號 L，Landrace )
        - 約克夏 (代號 Y，Yorkshire )
            ![](https://i.imgur.com/ZimJCPv.jpg)
            ([圖片來源](https://kknews.cc/zh-tw/news/g8gye28.html))<br><br>
        - 杜洛克 (代號 D，Duroc ) (主要終端公豬 -> Good, 萬能豬種)
            ![](https://i.imgur.com/OGr3dsu.jpg)
            ([圖片來源](https://kknews.cc/zh-tw/news/g8gye28.html))<br><br>
    - 其他豬種：
        - [漢布夏](https://zh.wikipedia.org/zh-tw/%E6%B1%89%E6%99%AE%E5%A4%8F%E7%8C%AA) (代號 H，Hampshire )
            - 美國最古老的豬種
            - 現已不常出現在種豬拍賣會
            - [漢布夏 特徵](https://kmweb.coa.gov.tw/subject/ct.asp?xItem=111617&ctNode=3580&mp=259&kpi=0&hashid=)
              ![](https://kmweb.coa.gov.tw/subject//public/Data/882614375853.jpg)
          

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## 豬隻育種策略
![](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/prevention/TaiwanPigBreeding2015.jpg)
- ### 基因選種目標
    - 基本目標：
        - 增加遺傳穩定度
        - 降低選種成本
    - 進階目標：
        - 提升種猪的國際競爭力
        - 肉猪生產效率


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## 術語
### 基因型 Genotyping
└── 分類
    ├── 生殖：多產基因、產精基因
    ├── 成長：增長基因
    ├── 肉質：肉質基因、增肌基因
    └── 抗壓：緊迫基因


- #### [緊迫基因 (AA, AB, BB)、](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/pigpss.htm)
    > AA型：正常型，不具猝死
    > AB型：雜合型，緊迫基因的攜帶者
    > BB型：緊迫型，具有猝死 ---> 會被淘汰、無法參與「肉質基因檢測」
    
    - [[wiki] 豬緊迫性症候群](https://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%8C%AA%E7%B4%A7%E8%BF%AB%E6%80%A7%E7%BB%BC%E5%90%88%E7%97%87)
        > 這種豬隻在遭遇緊迫情形，如打鬥，綑綁運送市場等常在中途突然死亡，充分表示無法適應緊迫情形。
        > 
        > 死亡原因：高燒、酸血、血糖過低

- #### [多產基因 (MM, MN, NN)](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/dopgipmu.htm)
    > MM：多產型【MM 諧音：媽媽】，MN：雜合型，NN：一般型
    
    - ##### [何謂多產基因](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/dopgip1.htm) (more)
        > 位於第一對染色體短臂上的 ESR 基因，有兩個對偶基因 A 和 B，具BB 型之母豬較 AA 型者每胎可多生1.5~2.3頭仔豬。
        > 
        > ESR基因可以增加窩仔數，改善繁殖成績，因此應用多產基因的篩檢技術做為輔助豬群改良的工具，實為改善母豬繁殖性能快速之方法。


- #### [肉質基因 (HH6, HL5, HL4, HL3, LL2, LL1, LL0)](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/hdna.htm)
    > HH：高肉質型，HL：中肉質型，LL：低肉質型

- #### [增肌基因 (FF, FG, GG)](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/pigigf2.htm)
    > 簡單講：提高瘦肉率
    > FF：增肌型，FG：雜合型，GG：正常型
    - [增肌基因 - 神農生技股份有限公司](http://www.rfbiotech.com.tw/increased-muscle-gene.html)
        > 增肌基因在第二號染色體2P1.7位置上控制瘦肉率，帶有增肌基因的種公豬可使肉豬瘦肉率增加2 %，並使肉豬肥育整齊度提昇 25% 。
        > 
        > 增肌基因是一種源自父親的基因。
    - [小伙發現壯如牛的肌肉豬，其成長原因，讓人不寒而慄](https://kknews.cc/agriculture/znrxye3.html)

- #### 增長基因 (QQ, QR, RR)
    > QQ：增長型，QR：雜合型，RR：正常型
    > 
    > 飼料效率(飼料量/增重)，越低約好，能降低飼料成本，提高養猪的利潤
    
- #### [產精基因](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/pigprlr.htm) (非基因檢測)
    - [種豬的產精基因](https://taiwan-swine.com/forum.php?mod=viewthread&tid=28235)
        > 會改善種公豬繁殖力及母豬產仔數。
        > 
        > 篩選標準：公豬產精子 >= 一兆隻總數
        > 
        > 公豬每次採精量如有200毫升及精子濃度每毫升3億精子來計，每次採精總精子數為600億隻精子，則採精17次，就會達10,000億隻精子總數(600億精子 x 17次=10,200億精子)，而達10,000億(一兆)隻精子總數的月齡，可供作選拔生長佳且產精強的種公豬之重要性狀。
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## 其他專案
- [[台糖黑客松] 從台灣種豬資料庫找出最好吃的豬豬家族](https://medium.com/@LiChengEn/53d6a38535a0)
    > 從屏科大張直老師的這份[〈種豬肉質基因(HH6)檢測〉](http://agrkb.angrin.tlri.gov.tw/modules/smartsection/item.php?itemid=272&source=post_page---------------------------)文章中得知：豬肉品質高低受到遺傳與屠宰前後各種條件因素的影響，影響最大的是緊迫敏感基因(BB型)、RN﹣基因(Rendement Napole gene)與心臟脂肪酸結合蛋白基因(Heart fatty acid-binding protein, H-FABP)。
    > 
    > 全台灣最好吃的豬豬家族裡的大家長，他的名字叫亞標，出生於2009年9月12日，出身於宜蘭福昌豬場繁殖。

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## 基因體
### NCBI


| Assembly | 異名(Synonym) | 日期(Date) | RefSeq 登錄編號 |  特徵統計(Feature counts) |
| -------- | -------- | -------- | -------- | --------- |
| Sscrofa11.1 | susScr11 | 2017/02/07 | [GCF_000003025.6](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000003025.6) | [Release 106](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_euk/Sus_scrofa/106/) |
| Sscrofa9 | - | 2009/11/02 | [GCA_000003025.1](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCA_000003025.1/) | - |

### UCSC


| 異名(Synonym) | 更新時間 | FTP |
| -------- | -------- | -------- |
| susScr11 | 2017/11/13 | [goldenPath/susScr11](ftp://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/susScr11/) |
| susScr3 | 2015/02/06 | [goldenPath/susScr3](ftp://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/susScr3/) |
| susScr2 | 2012/11/16 | [goldenPath/susScr2](ftp://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/susScr2/) |

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## 其他參考
- [種猪的基因選種](https://www.angrin.tlri.gov.tw/fifty/08.pdf)
    - 二、種猪的血統登錄
    - 三、種猪的選拔性狀
- [豬隻遺傳檢測結果英文字母代碼](https://taiwan-swine.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3069)
- [豬的種類大全](https://kknews.cc/zh-tw/news/g8gye28.html)
- [行政院-豬主題館-原種創意](https://kmweb.coa.gov.tw/subject/ct.asp?xItem=111629)
- [豬隻價錢](https://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/igf27price.htm)
- [豬經濟性狀遺傳標記 開發與應用](http://www.biotaiwan.org.tw/mag/image_doc/19/08%E8%B1%AC%E7%B6%93%E6%BF%9F%E6%80%A7%E7%8B%80%E9%81%BA%E5%82%B3%E6%A8%99%E8%A8%98%E9%96%8B%E7%99%BC%E8%88%87%E6%87%89%E7%94%A8.pdf) (介紹基因)
- ### 基龍米克斯專欄
    - [電腦也會選豬仔AI優選豬創造台灣出口大商機](https://www.narlabs.org.tw/xmdoc/cont?xsmsid=0I148622737263495777&sid=0J192611085046536266)
        - [電腦也會選豬仔 The Chosen One (影片)](https://www.youtube.com/embed/phd3E-Im2pQ)
    - [基龍米克斯發展農業基因體資料庫](https://www.genomics.com.tw/news/detail/309)
        > 「精準醫療短期內看不到實質的回報」，游卓遠說，健康基因檢測需要時間驗證，報告出來也沒有後續的配套措施，大家看不到期望的未來，不願意投資。但是豬隻不一樣，一隻豬生下來七個月就會被屠宰，可以知道預測的準不準，便可發展後續的業務。
        > 
        > 「基龍米克斯已不是大家想像的基因檢測公司，而是農業基因體的應用公司」。