電腦選豬仔 (超級賽亞豬)
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###### tags: `基因體`
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## [台灣畜產種原資訊網](http://www.angrin.tlri.gov.tw/)
- [豬隻資訊](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig_all.htm)
> 收錄了1974年以來台灣種豬的詳細資訊
- [豬名字查詢](http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/rpc.asp)
- [冠斯 222862](http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/Yresult2.asp?RPC=222862)
- [亞博 225352](http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/Yresult2.asp?RPC=225352)
- 台灣三大豬種:
- 藍瑞斯 (代號 L,Landrace )
- 約克夏 (代號 Y,Yorkshire )

([圖片來源](https://kknews.cc/zh-tw/news/g8gye28.html))<br><br>
- 杜洛克 (代號 D,Duroc ) (主要終端公豬 -> Good, 萬能豬種)

([圖片來源](https://kknews.cc/zh-tw/news/g8gye28.html))<br><br>
- 其他豬種:
- [漢布夏](https://zh.wikipedia.org/zh-tw/%E6%B1%89%E6%99%AE%E5%A4%8F%E7%8C%AA) (代號 H,Hampshire )
- 美國最古老的豬種
- 現已不常出現在種豬拍賣會
- [漢布夏 特徵](https://kmweb.coa.gov.tw/subject/ct.asp?xItem=111617&ctNode=3580&mp=259&kpi=0&hashid=)

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## 豬隻育種策略

- ### 基因選種目標
- 基本目標:
- 增加遺傳穩定度
- 降低選種成本
- 進階目標:
- 提升種猪的國際競爭力
- 肉猪生產效率
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## 術語
### 基因型 Genotyping
└── 分類
├── 生殖:多產基因、產精基因
├── 成長:增長基因
├── 肉質:肉質基因、增肌基因
└── 抗壓:緊迫基因
- #### [緊迫基因 (AA, AB, BB)、](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/pigpss.htm)
> AA型:正常型,不具猝死
> AB型:雜合型,緊迫基因的攜帶者
> BB型:緊迫型,具有猝死 ---> 會被淘汰、無法參與「肉質基因檢測」
- [[wiki] 豬緊迫性症候群](https://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%8C%AA%E7%B4%A7%E8%BF%AB%E6%80%A7%E7%BB%BC%E5%90%88%E7%97%87)
> 這種豬隻在遭遇緊迫情形,如打鬥,綑綁運送市場等常在中途突然死亡,充分表示無法適應緊迫情形。
>
> 死亡原因:高燒、酸血、血糖過低
- #### [多產基因 (MM, MN, NN)](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/dopgipmu.htm)
> MM:多產型【MM 諧音:媽媽】,MN:雜合型,NN:一般型
- ##### [何謂多產基因](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/dopgip1.htm) (more)
> 位於第一對染色體短臂上的 ESR 基因,有兩個對偶基因 A 和 B,具BB 型之母豬較 AA 型者每胎可多生1.5~2.3頭仔豬。
>
> ESR基因可以增加窩仔數,改善繁殖成績,因此應用多產基因的篩檢技術做為輔助豬群改良的工具,實為改善母豬繁殖性能快速之方法。
- #### [肉質基因 (HH6, HL5, HL4, HL3, LL2, LL1, LL0)](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/hdna.htm)
> HH:高肉質型,HL:中肉質型,LL:低肉質型
- #### [增肌基因 (FF, FG, GG)](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/pigigf2.htm)
> 簡單講:提高瘦肉率
> FF:增肌型,FG:雜合型,GG:正常型
- [增肌基因 - 神農生技股份有限公司](http://www.rfbiotech.com.tw/increased-muscle-gene.html)
> 增肌基因在第二號染色體2P1.7位置上控制瘦肉率,帶有增肌基因的種公豬可使肉豬瘦肉率增加2 %,並使肉豬肥育整齊度提昇 25% 。
>
> 增肌基因是一種源自父親的基因。
- [小伙發現壯如牛的肌肉豬,其成長原因,讓人不寒而慄](https://kknews.cc/agriculture/znrxye3.html)
- #### 增長基因 (QQ, QR, RR)
> QQ:增長型,QR:雜合型,RR:正常型
>
> 飼料效率(飼料量/增重),越低約好,能降低飼料成本,提高養猪的利潤
- #### [產精基因](http://www.angrin.tlri.gov.tw/pig/pigprlr.htm) (非基因檢測)
- [種豬的產精基因](https://taiwan-swine.com/forum.php?mod=viewthread&tid=28235)
> 會改善種公豬繁殖力及母豬產仔數。
>
> 篩選標準:公豬產精子 >= 一兆隻總數
>
> 公豬每次採精量如有200毫升及精子濃度每毫升3億精子來計,每次採精總精子數為600億隻精子,則採精17次,就會達10,000億隻精子總數(600億精子 x 17次=10,200億精子),而達10,000億(一兆)隻精子總數的月齡,可供作選拔生長佳且產精強的種公豬之重要性狀。
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## 其他專案
- [[台糖黑客松] 從台灣種豬資料庫找出最好吃的豬豬家族](https://medium.com/@LiChengEn/53d6a38535a0)
> 從屏科大張直老師的這份[〈種豬肉質基因(HH6)檢測〉](http://agrkb.angrin.tlri.gov.tw/modules/smartsection/item.php?itemid=272&source=post_page---------------------------)文章中得知:豬肉品質高低受到遺傳與屠宰前後各種條件因素的影響,影響最大的是緊迫敏感基因(BB型)、RN﹣基因(Rendement Napole gene)與心臟脂肪酸結合蛋白基因(Heart fatty acid-binding protein, H-FABP)。
>
> 全台灣最好吃的豬豬家族裡的大家長,他的名字叫亞標,出生於2009年9月12日,出身於宜蘭福昌豬場繁殖。
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## 基因體
### NCBI
| Assembly | 異名(Synonym) | 日期(Date) | RefSeq 登錄編號 | 特徵統計(Feature counts) |
| -------- | -------- | -------- | -------- | --------- |
| Sscrofa11.1 | susScr11 | 2017/02/07 | [GCF_000003025.6](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000003025.6) | [Release 106](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_euk/Sus_scrofa/106/) |
| Sscrofa9 | - | 2009/11/02 | [GCA_000003025.1](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCA_000003025.1/) | - |
### UCSC
| 異名(Synonym) | 更新時間 | FTP |
| -------- | -------- | -------- |
| susScr11 | 2017/11/13 | [goldenPath/susScr11](ftp://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/susScr11/) |
| susScr3 | 2015/02/06 | [goldenPath/susScr3](ftp://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/susScr3/) |
| susScr2 | 2012/11/16 | [goldenPath/susScr2](ftp://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/susScr2/) |
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## 其他參考
- [種猪的基因選種](https://www.angrin.tlri.gov.tw/fifty/08.pdf)
- 二、種猪的血統登錄
- 三、種猪的選拔性狀
- [豬隻遺傳檢測結果英文字母代碼](https://taiwan-swine.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3069)
- [豬的種類大全](https://kknews.cc/zh-tw/news/g8gye28.html)
- [行政院-豬主題館-原種創意](https://kmweb.coa.gov.tw/subject/ct.asp?xItem=111629)
- [豬隻價錢](https://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/igf27price.htm)
- [豬經濟性狀遺傳標記 開發與應用](http://www.biotaiwan.org.tw/mag/image_doc/19/08%E8%B1%AC%E7%B6%93%E6%BF%9F%E6%80%A7%E7%8B%80%E9%81%BA%E5%82%B3%E6%A8%99%E8%A8%98%E9%96%8B%E7%99%BC%E8%88%87%E6%87%89%E7%94%A8.pdf) (介紹基因)
- ### 基龍米克斯專欄
- [電腦也會選豬仔AI優選豬創造台灣出口大商機](https://www.narlabs.org.tw/xmdoc/cont?xsmsid=0I148622737263495777&sid=0J192611085046536266)
- [電腦也會選豬仔 The Chosen One (影片)](https://www.youtube.com/embed/phd3E-Im2pQ)
- [基龍米克斯發展農業基因體資料庫](https://www.genomics.com.tw/news/detail/309)
> 「精準醫療短期內看不到實質的回報」,游卓遠說,健康基因檢測需要時間驗證,報告出來也沒有後續的配套措施,大家看不到期望的未來,不願意投資。但是豬隻不一樣,一隻豬生下來七個月就會被屠宰,可以知道預測的準不準,便可發展後續的業務。
>
> 「基龍米克斯已不是大家想像的基因檢測公司,而是農業基因體的應用公司」。