---
# System prepended metadata

title: gnomAD-1-註釋欄位
tags: [基因體/三級分析/資料庫, 基因體, dbSNP, Variant, SNP]

---

gnomAD-1-註釋欄位
===
###### tags: `基因體/三級分析/資料庫`
###### tags: `基因體`, `SNP`, `dbSNP`, `Variant`

<br>

[TOC]

<br>

## 註釋欄位
> - 透過 pbrun vcfanno 標注

- ### 新增 FILTER 欄位
    | ID | Description |
    |----|-------------|
    | PASS | All filters passed |
- ### 新增 contig 欄位
    | ID | length |
    |----|--------|
    | (略) | (略) |
    - 範例：`##contig=<ID=chr1,length=248956422>`
- ### 新增 INFO 欄位 (`gnomad_` 為自定義 prefix)
    [點此查看前半部](https://hackmd.io/d1ehBZm6QD6uwANcVS5-NA)
    [點此查看後半部](https://hackmd.io/EDoP9JdbQjya7EXDu_LDRw)
- ### 新增其他資訊
    - `##bcftools_normVersion=1.7+htslib-1.9`
    - `##bcftools_normCommand=norm -m- -o a5ec15c010cd73f2d5d3aa9d7352da607cb8d59d.norm.vcf /workspace/datasets/germline/HG002/wes-output/output.vcf; Date=Wed Dec 28 10:59:57 2022`

<br>

## 標注範例
- [標注範例1](https://hackmd.io/MpG1DkpfSaKjgfpE-RjM-A)