2020秋季第六場研讀紀錄
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###### tags: `TCPSR` `Reproducibility`

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- **研讀主題:**
- **地點:** [社會創新實驗中心](https://silab.sme.gov.tw/) 202會議室
- **youtube直播連結:** https://www.youtube.com/watch?v=W7S08vd5SRw
- **日期時間:** Oct 25(SUN), 2020 2:00 PM (CST)
- **討論流程**
1. 文獻領講 `60 min`

2. 延伸問題 `30 min`

3. 自由討論

- **參與者簽到:** [表情符號包](https://github.com/ikatyang/emoji-cheat-sheet)
- :man: 林君昱(CYL)
- :heart: 陳紹慶(CSC)
- :man: 劉効樺(SHL)
- :woman: 周蔚倫(WLC)
- :man: 廖佑銘(YML)

- **領講人:** CYL
- **研讀文獻:** [Wilson et al. (2017)](https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1005510)

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## 文獻領講

<!--- 簡報網址置入以下括號之內 --->
- [領講簡報 ppt](https://drive.google.com/file/d/19eep55_n2c7SYl3b45EF7hpd4B09NnK7/view?usp=sharing)

:::success
(筆記與討論紀錄區)

電腦與程式設計新手如何利用電腦來協助進行研究時的**資料管理、程式撰寫、團隊合作、專案存檔、追蹤修訂、撰稿**等的方法與工具，提供最低標準的大方向指引。

領講者心得：是大原則，雖然無法讀完就可知道如何馬上做，仍需自行思考，找出其他更深入的資源，設計、選擇自己的作法。

- 適合誰？

研究新手：研究生、專題生/大學生…

有經驗的研究者：雖有的像常識已在用，但可重新檢視自己的作法、學習新工具、設計教育新人的方案

- carpentries單位及課程介紹

- scientific computing

- 6 topics, see original paper BOX 1

- Learning difficulties to use version control systems

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- 你是用哪些方法呢（eg 軟體、流程）？是否都符合本文建議？在哪有困難或疑惑？

- 備份：esp imaging data?

- Manuscirpt 的編改（投稿論文、學生的學位論文、poster/ppt）:

- email + MS Word tracking, gdoc, Office365 online Word Web App,…

- 文獻管理 for collaboration： Zotero, endnote, Mendeley… (shared library? reference ID problem?)

- Shared to-do list, project management software?

- Slack, Asana, Remind Me the Milk…

- 心理學研究的 reproducibility 建議？

- 有何標準化的 project & data format (eg MRI), 實驗程式, 分析流程…

- 訓練學生/助理/新進人員的推薦方式、資源？Lab manual template…

## :

好料分享
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#### :dart: [A Crowdsourced Effort to Develop a Lab Manual Template](https://bit.ly/2FdVt8F)

Check the others in [SIPS products](https://improvingpsych.org/sipsinaction/sips-products/)

#### :mag: [The Doom Lab](https://github.com/doomlab)

#### :books: [papaja: Reproducible APA manuscripts with R Markdown](https://crsh.github.io/papaja_man/)

#### :wrench: [tidystats: export the statistical model outputs to word file](https://willemsleegers.github.io/tidystats/)

#### :fire: Science as Amateur Software Development by Richard McElreath

{%youtube zwRdO9_GGhY%}

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## 自由討論
<!-- Other important details discussed during the meeting can be entered here. -->