---
title: 'Tâm - Meeting 1 - 24/12/19'
tags: BKHCMUT, Research, Cao Hoang Tru, Vo Thi Ngoc Chau
---

Meeting 1 - 24/12/19
===

## Table of Contents

[TOC]

## Các hướng nghiên cứu
- **Sentiment Analysis:** sentiments từ bác sĩ, điều dưỡng, bệnh nhân; sentiments về quá trình điều trị
- **Information extraction:** về thuật ngữ, thông tin bệnh, tests, treaments
- **Relationship extraction:** (linear context) giữa treatment và bệnh. thường là các dự án share task (collaborations).

## Tìm hiểu MIMIC text
- **Tổng quát MIMIC database:**
- MIMIC-III v1.4
- Gồm 40 tables và tổng cộng 728,556,685 rows và 534 columns
- Thông tin chi tiết về schema tại [đây](https://mit-lcp.github.io/mimic-schema-spy/index.html)
- Thông tin thật của hơn 40 ngàn bệnh nhân tại Beth-Isreal Deaconess Medical Center critical care unit
- Thông tin bao gồm demographics, vital sign measurements made at the bedside (~1 data point per hour), laboratory test results, procedures, medications, caregiver notes, imaging reports, and mortality (both in and out of hospital).
- **Các đặc điểm của MIMIC text:**
- không có ngữ pháp, không câu hoàn chỉnh
- note ngắn và có áp lực thời gian
- có thể được thực hiện bởi người có chuyên môn
- So sánh với Kaggle datasets: kaggle chuẩn và đã được clean hơn
- **Label của MIMIC text:**
- Tìm hiểu về availability của MIMIC clinical text label phục vụ cho sentiment analysis: có **public?** và có **label?**
- Trong trường hợp *not public*: Công trình chuẩn bị dữ liệu như thế nào?
- Trong trường hợp *không có label*: sẽ gửi đi review cho những chuyên gia hỗ trợ nào
- Tham khảo những công trình liên quan; tham khảo/trao đổi với anh Thái
## References
- Reference about sentiment analysis in clinical text (for MIMIC)
- Tham khảo:
- JAIST: Mixture of Language Models Utilization in Score-Based Sentiment Classification on Clinical Narratives. DANG, TRAN THAI. Supervisor: Ho Bao Tu. 2016-09
- Analysis of Aspect-Based Sentiment in Clinical Text from Electronic Medical Records. DAM Hieu Chi, et al
## Các câu hỏi trọng tâm
- **What** - đề tài nghiên cứu
- **Why** - mục đích áp dụng của công trình này
- **Các approach chính** - các approach hiện có trong research về sentiment analysis trong clinical text
- Thực hiện **literature review** về sentiment analysis trong clinical text
## Vì sao chọn MIMIC database
- Lượng data nhiều
- Description chi tiết
- Phong phú về type data
- Phương pháp khoa học
- Data thật
- là standard cho research

## Check point về tiến độ trong 2 tuần nữa
:::info
**Find this document incomplete?** Leave a comment!
:::

###### tags: `Sentiment Analysis` `MIMIC clinical text` `BKHCMUT`