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title: PDBj勉強会 第96回

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# PDBj勉強会 第96回
**2021/04/13（火）15:00～17:00**
**出席：鷹野さん、鈴木さん、笠原さん、工藤**
**欠席：**

## 話題
* 先日蛋白研のサーバ室でボヤ騒ぎがありました。原因ははっきりしませんが、過剰なたこ足配線が一因と思われます。電線を接続する際は接続機器の消費電力を確認し、過剰な配線とならないよう注意しましょう。
* サイエンスフェスタに蛋白研（というかPDBj）として出展申し込みをしました。ブース出展内容を3分以内の動画で紹介。SARS-CoV-2の万見プライムエントリーをつくる。
* クラウド側WAF（Web Application Firewall）の利用はなかなかすんなりいかない。特にwebとそれ以外（ftp, rsync）が同一のホスト名を共有している[ftp.pdbj.org](https://ftp.pdbj.org/)、[ftp-versioned.pdbj.org](https://ftp-versioned.pdbj.org/)に関しては（web以外は素通しするような選別が必要だが、それだとうまく通信できなかったりする）。
* ヘム蛋白質の解析サービスを鷹野さんが構築中
* PDBj公開サーバ群は蛋白研DMZ（133.1.158.128/26）に置かれている。広島市大ではDMZを設けられないのでどうすれば？→L3 Switchを導入し、VLANを切って他のマシンとは直接通信ができないようにするのも一案。
* いろいろ古い機器が壊れていって対応に追われ大変。汎用コンの切り替えもあるのに。上述のボヤの影響で壊れた機器もある（empiar、またデータ容量が大きいだけに復旧が大変、運悪く丁度保守更新の手続き遅れで保守切れ状態になっていたこともあり対応に遅れが出た）
* 笠原さんの研究室でコロナウイルス陽性者が出たが、ほとんど登校してなかったのであまり影響なし。
* サーバ室を加湿すべきかも、早稲田などでは加湿しているらしい。湿度が低いと火災が起きやすくなるのでその対策として。蛋白研サーバ室ではまず湿度を測ってみて、必要があるようなら加湿器を置くなどの対策を検討。
* 蛋白研サーバ室では、特に最近はempiarのラック群があるエリアの気温は高めになっている。大型扇風機を稼働させているが、空気をかき回しているだけで、根本的な排熱対処法にはなっていない。換気扇を導入するなどを検討していただけるといいと思うが、どこが費用を出すという問題がありそう。
* alpha foldはどうして良い構造予測結果が出せた？ 中身はよくわからない。→機械学習・強化学習の作り込み、Google内の大きな計算資源を活用、蛋白質ドメイン知識もあった上で。配列プロファイル
* 構造予測は時間さえあればできるはず？ 量子コンピュータを使えばより高速に、より大きな構造についても正確な予測ができる？
* SNS、いろいろあってなかなか活用できてない。
* 文章を書く作業はやっていないと書く能力はすぐに落ちてしまいがち。
* センター試験の英語のアクセント問題はlistening、適語選択問題はwritingに相当する能力を測ることを意図した問題。[中国語検定](http://www.chuken.gr.jp/)にもそのような問題がある（同じ声調の語を選ぶ、適語を選ぶ）。
* オンラインの学会に参加しても、つい仕事しながら片手間での参加となり真剣に話を聞かなくなってしまう。


## 参考情報
* [PDBj勉強会 各回内容](https://hackmd.io/vZS6tNdjTaGEUXCFNn5Vew)
* [各種資料（Google Drive）](https://drive.google.com/drive/folders/1vMa0DWILcqdIPDL4JQIunRxWIAscSdnq)
