# PDBj勉強会 第92回 **2020/10/20（火）15:00～17:00** **出席：鷹野さん、鈴木さん、笠原さん、工藤** **欠席：** ## 話題 ### サイエンスアゴラ [11/22（日）12:30～13:20、栗栖先生のライブ講演](https://www.jst.go.jp/sis/scienceagora/2020/planning/planning_2205.html) 事前参加登録必要（無料） ### PDBjのシステムまわりのこと * ようやく奨励会にFirewallが設置されたが、DNSサーバがいなくてまだまともに構築が進められない。PDBjのウェブサーバにpingが打って応答を確認することぐらいしかできない。 * 居室リフォームに伴い11月中旬2週間程は別場所（自宅など）での業務 * EMPIARのストレージ524TBの使用率が90%を超えた。約240TBの追加サーバを買ったがこれをどうやって使うかを検討中。ローカル論理ボリュームを、複数ノードで共有するにはHAクラスタの構築が必要。さらに買い足し、最終的には現行の524TB＋600TB x 3になる。 * 10GbEは1GbEの銅線LANケーブル（RJ-45）とは違ってHubにさされば通信できるとは限らない。相性が合わなければささってもリンクランプもつかない。 * HOMCOSサーバも経年を考えると早急に移設が必要。 * PDB50周年を記念して作成した2021年カレンダーを日中韓にlocalizeして印刷する。なかなか手が回らない。 ### その他 * 鷹野さんの御父上がご逝去されバタバタしたというお話し、丁度引っ越しや授業開始が重複して大変だったそうで。 * Zoomの録画は圧縮率はすごいが編集するとサイズがでかくなる。 * プログラミングのオンライン授業をやってみる（笠原さん）。わかりません、だけを出力するプログラムを提出してきたやつがいた。わからないなら聞いてくれればいいのに。 * 関大の学生で集団感染が出たそうな。 * オンラインで授業は原則60単位ぐらいまでしか出せないはずだが、今年は特例でそれを越えてもいいらしい。 * 文科省は対面を推奨しているが、かと言って感染拡大は防止する配慮は必要。大学の事務方は対面にしろと苦情が入ったりして苦慮しているとのこと。 * 最近、だいぶ寒くなったので感染がひどくなる懸念があるのでは? * 東京の宅地は昭和な雰囲気が残る商店街があちこちに残っている。 * 最近、あちこちで大学生が大麻で捕まってますね。 * これから大学の入試があるが、クラスターが発生すると入試できなくなるので困る。 * スパイクに抗体をつけて解いた新型コロナウイルスのタンパク質構造がどんどん出ている。でもまだこれですぐ薬ができるわけではない。 * COVID19関係の構造がPDBに登録されると、論文公開を待たずエントリーを公開するようPDB各拠点のPIから要請することになっている。 * COVID19の構造を出すにあたり、系ができるまでが大変。 * 日本はあまりコロナウイルスでの死者が出ていないため、あまり研究は進んでない感がある。中国で研究がさかんなのはSARSの経験もあるのでは。 * 東アジアと欧米ではSARS-CoV-2の系が違う? PDBに登録された構造はUniProtに登録された配列と違えば、そのことが注釈として入る。まだどれが正式な配列かは共通認識はかたまってなさそう。 * 肥後さんは兵庫県立大学に籍があるが、今年はほとんど行ってないそうな。 * [蛋白研HP](http://www.protein.osaka-u.ac.jp/)はJQueryが使われている。あまり新しい技術ではない。 * [ダイバーシティのページ](http://www.protein.osaka-u.ac.jp/strength/#diversity)で数字の食い違いがある→広報室に連絡 * 中川所長は第20代所長。 * Database誌に[PyDISH](https://pydish.bio.info.hiroshima-cu.ac.jp/)が載った。[DOI:10.1093/database/baaa066](https://doi.org/10.1093/database/baaa066) * オープンアクセスの料金、高い雑誌は高い。 * 名前は大事だね。PyDISH（Python-based database & analyzer for DIStortion of Heme porphyrin）は結構考えた。 * 何らかのスキル（例：簿記）が必要な業務に携わると、どうせならその資格を取ってしまおう、と思うことありますよね。 ## 参考情報 * [PDBj勉強会 各回内容](https://hackmd.io/vZS6tNdjTaGEUXCFNn5Vew) * [各種資料（Google Drive）](https://drive.google.com/drive/folders/1vMa0DWILcqdIPDL4JQIunRxWIAscSdnq)