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title: PDBj勉強会 第107回

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# PDBj勉強会 第107回
**2022/07/05（火）15:00～17:00**
**出席：鷹野さん、鈴木さん、工藤**
**欠席：**

## 話題
### PDBjの近況
* 阪大雇止め対応に伴う奨励会送りが始まりました。最初の見学さんが今月から。残り4名（横地、張、池川、常住）が順次交代で奨励会行きとなり、最後に工藤が行く予定。
* 篠原先生が7/30（土）と8/6（月）に[高校生向け蛋白研セミナー](http://www.protein.osaka-u.ac.jp/seminar/20220730/)を開催され、PDBjも協力することになった。今日の打ち合わせでは工藤が約30分、[PDBj入門](https://numon.pdbj.org/)を紹介することになった。
* [サイエンスフェスタ](https://www.pesj-bkk.jp/OSF/)（青少年のための科学の祭典大阪大会）に今年もPDBjから出展する。今年は今のところ対面開催予定（8/20（土）・21（日）、大谷中学・高校）だが、昨年同様の事前収録動画での出展方法も用意されており、今年も事前収録動画（5分以内）で出展する。川端さんに昨年用意していただいたCOVID-19コンテンツを元に今年用のコンテンツを作成予定。
* 蛋白研の公式マスコット「たんぱくん＆きみちゃん」というのができたようです。
![たんぱくん＆きみちゃん](https://i.imgur.com/vXhTU8X.png)
* PDB Chinaのアノテータがトレーニングのため来日する予定になっているが、繰り返し延期されて今のところ8月中旬頃来日予定。
* [wwPDBのPDB Archiveサイト](https://www.wwpdb.org/ftp/pdb-ftp-sites)が1つ増えて以下の5つになっている。Amazonから公共データベースをAWSに置きたいのでデータ提供して欲しいと要請があり実現したとのこと。rcsb.org というドメインだとRCSBだけがやっているように見えるのでよくないという意見もあるが、アーカイブキーパーだからrcsb.orgになったとのこと。これによってPDBjのアクセスが減ることがあれば対処を検討する必要があるかもしれない。
    * wwPDB: ftp.wwpdb.org
    * RCSB PDB (US): ftp.rcsb.org
    * RCSB PDB (US/AWS): s3.rcsb.org
    * PDBe (UK): ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/pdb/
    * PDBj (Japan): ftp.pdbj.org
* 今月の分子の中国語・韓国語訳を始めています
未公開ですが、機械翻訳したものを于さん、金さんにreviewしてもらってぼちぼち準備していっています。
* EMPIARのミラーリングについて、そろそろ本家EBIに完全に追従するのはきびしくなりそう。現在容量2.6PB中2.0PB使用。LTOテープにもバックアップを取っている。一部はオンデマンドでテープ書き戻しでダウンロードできるようにする？

### PyDISH
* PyDISHにエントリーのあるPDBIDリストをどこかのウェブサイト等でご提供いただく話はどうなりました？

## 参考情報
* [PDBj勉強会 各回内容](https://hackmd.io/vZS6tNdjTaGEUXCFNn5Vew)
* [各種資料（Google Drive）](https://drive.google.com/drive/folders/0B659VZN6csLGOElsQjFra3hZMFE?resourcekey=0-oPI9A7lRcy3E2MrFcHs0OA&usp=sharing)
