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# System prepended metadata

title: Sepsis

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# Sepsis

- [1. Datenschutzliste](#1-datenschutzliste)
  - [1.1. Kategorien](#11-kategorien)
    - [1.1.1. Medikation](#111-medikation)
    - [1.1.2. Laborwerte](#112-laborwerte)
    - [1.1.3. Vitalzeichen](#113-vitalzeichen)
    - [1.1.4. Stammdaten](#114-stammdaten)
    - [1.1.5. Hintergrund](#115-hintergrund)
    - [1.1.6. Diagnosen](#116-diagnosen)
    - [1.1.7. Fehlende Kategorie](#117-fehlende-kategorie)
  - [1.2. Übersicht](#12-übersicht)

## 1. Datenschutzliste

Die folgende Liste bildet eine Übersicht der benötigten Daten für alle Modelle, inkl. der entsprechenden Dimensionen und Einheitenkodierung, wie sie dem Datenschutzbeauftragten am 24. 8. 2021 vorgelegt werden.

### 1.1. Kategorien

#### 1.1.1. Medikation

Für die Abbildung der Medikation im Rahmen des Modells werden folgende Informationen benötigt:

- Dosierung
- Patient\*innen-ID
- Referenz auf das zu verabreichende Arzneimittel
- Referenz zu externem Protokoll oder Guideline, welche befolgt werden
- Zeitpunkt oder Periode der Verabreichung

Davon betroffene Werte:

- Adrenalin
- Antibiotika
- Dobutamin
- Dopamin
- Noradrenalin

#### 1.1.2. Laborwerte 

Für die Abbildung der Laborwerte werden benötigt:

- Laborparameter (IPS LOINC kodiert)
- Messwert (UCUM Quantity kodiert)
- Patient\*innen-ID
- Untersuchungsmethode (keine Kodierungsempfehlung)
- Untersuchungszeitpunkt

Davon betroffene Werte:

- Abdomen-Score
- Arterieller Sauerstoffpartialdruck (PO2)
- Bilirubin                            
- Blutkulturen
- CRB-65-Score
- CRP                                  
- Glomeruläre Filtrationsrate (GFR)
- Haut/Weichteil-Score
- Interleukin-6                        
- Kreatinin                            
- Laktat
- Leukozyten                           
- Leukozyten im Liquor
- Neuro-Score
- Oxygenierungsindex                   
- PCT                                  
- Resistogramm
- SOFA-Score                           
- Thrombozyten
- Urinkulturen
- Uro-Score

#### 1.1.3. Vitalzeichen

Für die Abbildung der Vitalzeichen werden benötigt:

- Parameter (LOINC kodiert)
- Messwert (UCUM Quantity kodiert)
- Patient\*innen-ID
- Untersuchungsmethode (keine Kodierungsempfehlung)
- Untersuchungszeitpunkt

Davon betroffene Werte:

- Atemfrequenz                         
- Blutdruck                            
- Blutzucker
- CAM-ICU                              
- Dialyse
- Glasgow Coma Scale                   
- Herzfrequenz                         
- ICDSC                                
- Körpertemperatur                     
- Mechanische Beatmung                 
- Mittlerer Arterieller Druck
- qSOFA                                
- RASS-Score                           
- Sauerstoffkonzentration der Einatemluft (FiO2)
- Urinausscheidung                     


#### 1.1.4. Stammdaten

Für die Abbildung der Stammdaten werden benötigt:

- Alter
- Aufnahmegrund
- Aufnahmezeitpunkt
- Entlassungsgrund
- Entlassungszeitpunkt
- Geburtsort
- Geschlecht (amtlich)
- Gewicht
- Wohnort

#### 1.1.5. Hintergrund

Für die Abbildung des Patient\*innenhintergrunds werden benötigt:

- ~~Berufliches Umfeld~~
- Pflegeeinrichtung            
- ~~Reiseanamnese~~
- Vorangegangene AB-Therapie (3 Monate)
- Vorangegangene AB-Therapie (6 Monate)
- Vorerkrankungen                      

#### 1.1.6. Diagnosen

Folgende Diagnosen sind relevant:

- Allgemeine Diagnose (als ICD-10 und Freitext)
- Betroffene Organe
- Zeitpunkt der Sepsisdiagnose

#### 1.1.7. Fehlende Kategorie

Für die folgenden Datenpunkte fehlen noch Kategorie und FHIR-Profil:

- ~~Computertomographie~~
- ~~Thoraxröntgen~~

### 1.2. Übersicht
Die folgende Übersicht findet sich außerdem als Excel Spreadsheet [hier](assets/datenschutzliste.xlsx) 

Legende:

- `o` keine Bedenken
- `-` Diskussionsbedarf (**fett markiert**)
- `x` Datum muss aus dem Modell gestrichen werden (~~durchgestrichen~~)

| Datum                                          | Kategorie    | Messwert                             | FHIR-Profil                                                                        | Datenschutzbedenken |
| ---------------------------------------------- | ------------ | ------------------------------------ | ---------------------------------------------------------------------------------- | ------------------- |
| Adrenalin                                      | Medikation   | µg/kg/min                            | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o`                 |
| Antibiotika                                    | Medikation   | je nach Medikament                   | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o`                 |
| Dobutamin                                      | Medikation   | µg/kg/min                            | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o`                 |
| Dopamin                                        | Medikation   | µg/kg/min                            | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o`                 |
| Noradrenalin                                   | Medikation   | µg/kg/min                            | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o`                 |
| Abdomen-Score[^3]                              | Laborwerte   | Integer                              | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Arterieller Sauerstoffpartialdruck (PO2)       | Laborwerte   | mmHg                                 | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Bilirubin                                      | Laborwerte   | mg/dl                                | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Blutkulturen                                   | Laborwerte   | Erregernachweis (Ja/Nein/Vielleicht) | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| CRB-65-Score[^3]                               | Laborwerte   | Integer                              | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| CRP                                            | Laborwerte   | mg/l                                 | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Glomeruläre Filtrationsrate (GFR)              | Laborwerte   | ml/min                               | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Haut/Weichteil-Score[^3]                       | Laborwerte   | Integer                              | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Interleukin-6                                  | Laborwerte   | ng/l                                 | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Kreatinin                                      | Laborwerte   | lg/dl                                | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Laktat                                         | Laborwerte   | mg/dl                                | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Leukozyten                                     | Laborwerte   | Anzahl/µl                            | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Leukozyten im Liquor                           | Laborwerte   | Anzahl/µl                            | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Neuro-Score[^3]                                | Laborwerte   | Integer                              | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Oxygenierungsindex                             | Laborwerte   | mmHg                                 | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| PCT                                            | Laborwerte   | ng/ml                                | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Resistogramm                                   | Laborwerte   | Resistenz pro Erreger                | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| SOFA-Score                                     | Laborwerte   | Punktzahl                            | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Thrombozyten                                   | Laborwerte   | Anzahl/µl                            | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Urinkulturen                                   | Laborwerte   | Erregernachweis (Ja/Nein/Vielleicht) | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| Uro-Score[^3]                                  | Laborwerte   | Integer                              | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab)                     | `o`                 |
| **Alter**                                      | Stammdaten   | Kohorte (5-Jahres-Schritte)          | [Patient](./kodierungsgrundlage.md#1111-patient)                                   | `-`                 |
| Aufnahmegrund                                  | Stammdaten   | Freitext                             | [Encounter](./kodierungsgrundlage.md#1121-encounter)                               | `o`                 |
| **Aufnahmezeitpunkt**                          | Stammdaten   | Zeitpunkt                            | [Encounter](./kodierungsgrundlage.md#1121-encounter)                               | `-`                 |
| Entlassungsgrund                               | Stammdaten   | Freitext                             | [Encounter](./kodierungsgrundlage.md#1121-encounter)                               | `o`                 |
| **Entlassungszeitpunkt**                       | Stammdaten   | Zeitpunkt                            | [Encounter](./kodierungsgrundlage.md#1121-encounter)                               | `-`                 |
| ~~Geburtsort~~                                 | Stammdaten   | Postleitzahl                         | [Patient](./kodierungsgrundlage.md#1111-patient)                                   | `x`                 |
| Geschlecht (amtlich)                           | Stammdaten   | m/w/d                                | [Patient](./kodierungsgrundlage.md#1111-patient)                                   | `o`                 |
| Gewicht                                        | Stammdaten   | kg                                   | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| **Wohnort**                                    | Stammdaten   | Postleitzahl                         | [Patient](./kodierungsgrundlage.md#1111-patient)                                   | `-`                 |
| Atemfrequenz                                   | Vitalzeichen | Atemzüge/min                         | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Blutdruck                                      | Vitalzeichen | mmHg                                 | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Blutzucker                                     | Vitalzeichen | mg/dl                                | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| CAM-ICU                                        | Vitalzeichen | Punktzahl                            | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Dialyse                                        | Vitalzeichen | Nein/Akut/Chronisch                  | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition)                               | `o`                 |
| Glasgow Coma Scale                             | Vitalzeichen | Punktzahl                            | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Herzfrequenz                                   | Vitalzeichen | Schläge/min                          | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| ICDSC                                          | Vitalzeichen | Punktzahl                            | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Körpertemperatur                               | Vitalzeichen | Grad Celsius                         | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Mittlerer arterieller Druck                    | Vitalzeichen | mmHg                                 | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Mechanische Beatmung                           | Vitalzeichen | Ja/Nein                              | [Procedure](./kodierungsgrundlage.md#1141-procedure)                               | `o`                 |
| qSOFA                                          | Vitalzeichen | Punktzahl                            | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| RASS-Score                                     | Vitalzeichen | Punktzahl                            | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Sauerstoffkonzentration der Einatemluft (FiO2) | Vitalzeichen | Prozentzahl                          | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Urinausscheidung                               | Vitalzeichen | ml/h                                 | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation)                           | `o`                 |
| Allergien                                      | Hintergrund  | Freitext                             | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition)                               | `o`                 |
| ~~Berufliches Umfeld~~                         | Hintergrund  | Freitext                             | [OccupationalData](./kodierungsgrundlage.md#1212-occupationaldata)                 | `x`                 |
| Pflegeeinrichtung                              | Hintergrund  | Ja/Nein                              | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition)                               | `o`                 |
| ~~Reiseanamnese~~                              | Hintergrund  | Freitext                             | [TravelHistory](./kodierungsgrundlage.md#124-travelhistory)                        | `x`                 |
| Vorangegangene Antibiotika-Therapie            | Hintergrund  | Freitext                             | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o`                 |
| Vorerkrankungen[^1]                            | Hintergrund  | Freitext                             | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition)                               | `o`                 |
| Diagnose                                       | Diagnose     | ICD-10 Code                          | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition)                               | `o`                 |
| Betroffene Organe                              | Diagnose     | Freitext                             | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition)                               | `o`                 |
| **Zeitpunkt der Sepsisdiagnose**               | Diagnose     | Zeitpunkt                            | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition)                               | `-`                 |
| ~~Computertomographie~~[^2]                    | ?            | Zusammenfassung / Bild               | ?                                                                                  | `o`                 |
| ~~Thoraxröntgen~~[^2]                          | ?            | Zusammenfassung / Bild               | ?                                                                                  | `o`                 |

[^1]: Insbesondere Diabetes mellitus
[^2]: Gestrichten unter der Annahme, dass kein strukturell ableitbarer Datenpunkt vorliegt. Ansonsten reevaluieren.
[^3]: Werte spezifisch für das EvKB (liegen strukturiert vor).

Kommentar zu Diskussionsbedarf:

- Alter: Darf nur in Kohorten erfasst werden, nicht als Geburtsdatum.
- Aufnahme-/ Entlassungszeitpunkt: Sollte idealerweise nicht direkt erfasst werden (alternativ: andere Zeitstempel relativ zum Aufnahmezeitpunkt abbilden)
- Wohnort: Nicht die volle PLZ, sondern Kompromiss finden [Anm.: Die ersten beiden Stellen der PLZ sind nicht ausreichend für eine Modellbildung!]
- Zeitpunkt der Sepsisdiagnose: Relativ zum Aufnahmezeitpunkt abbilden
