# Sepsis

- [1. Datenschutzliste](#1-datenschutzliste)
- [1.1. Kategorien](#11-kategorien)
- [1.1.1. Medikation](#111-medikation)
- [1.1.2. Laborwerte](#112-laborwerte)
- [1.1.3. Vitalzeichen](#113-vitalzeichen)
- [1.1.4. Stammdaten](#114-stammdaten)
- [1.1.5. Hintergrund](#115-hintergrund)
- [1.1.6. Diagnosen](#116-diagnosen)
- [1.1.7. Fehlende Kategorie](#117-fehlende-kategorie)
- [1.2. Übersicht](#12-übersicht)

## 1. Datenschutzliste

Die folgende Liste bildet eine Übersicht der benötigten Daten für alle Modelle, inkl. der entsprechenden Dimensionen und Einheitenkodierung, wie sie dem Datenschutzbeauftragten am 24. 8. 2021 vorgelegt werden.

### 1.1. Kategorien

#### 1.1.1. Medikation

Für die Abbildung der Medikation im Rahmen des Modells werden folgende Informationen benötigt:

- Dosierung
- Patient\*innen-ID
- Referenz auf das zu verabreichende Arzneimittel
- Referenz zu externem Protokoll oder Guideline, welche befolgt werden
- Zeitpunkt oder Periode der Verabreichung

Davon betroffene Werte:

- Adrenalin
- Antibiotika
- Dobutamin
- Dopamin
- Noradrenalin

#### 1.1.2. Laborwerte

Für die Abbildung der Laborwerte werden benötigt:

- Laborparameter (IPS LOINC kodiert)
- Messwert (UCUM Quantity kodiert)
- Patient\*innen-ID
- Untersuchungsmethode (keine Kodierungsempfehlung)
- Untersuchungszeitpunkt

Davon betroffene Werte:

- Abdomen-Score
- Arterieller Sauerstoffpartialdruck (PO2)
- Bilirubin
- Blutkulturen
- CRB-65-Score
- CRP
- Glomeruläre Filtrationsrate (GFR)
- Haut/Weichteil-Score
- Interleukin-6
- Kreatinin
- Laktat
- Leukozyten
- Leukozyten im Liquor
- Neuro-Score
- Oxygenierungsindex
- PCT
- Resistogramm
- SOFA-Score
- Thrombozyten
- Urinkulturen
- Uro-Score

#### 1.1.3. Vitalzeichen

Für die Abbildung der Vitalzeichen werden benötigt:

- Parameter (LOINC kodiert)
- Messwert (UCUM Quantity kodiert)
- Patient\*innen-ID
- Untersuchungsmethode (keine Kodierungsempfehlung)
- Untersuchungszeitpunkt

Davon betroffene Werte:

- Atemfrequenz
- Blutdruck
- Blutzucker
- CAM-ICU
- Dialyse
- Glasgow Coma Scale
- Herzfrequenz
- ICDSC
- Körpertemperatur
- Mechanische Beatmung
- Mittlerer Arterieller Druck
- qSOFA
- RASS-Score
- Sauerstoffkonzentration der Einatemluft (FiO2)
- Urinausscheidung

#### 1.1.4. Stammdaten

Für die Abbildung der Stammdaten werden benötigt:

- Alter
- Aufnahmegrund
- Aufnahmezeitpunkt
- Entlassungsgrund
- Entlassungszeitpunkt
- Geburtsort
- Geschlecht (amtlich)
- Gewicht
- Wohnort

#### 1.1.5. Hintergrund

Für die Abbildung des Patient\*innenhintergrunds werden benötigt:

- ~~Berufliches Umfeld~~
- Pflegeeinrichtung
- ~~Reiseanamnese~~
- Vorangegangene AB-Therapie (3 Monate)
- Vorangegangene AB-Therapie (6 Monate)
- Vorerkrankungen

#### 1.1.6. Diagnosen

Folgende Diagnosen sind relevant:

- Allgemeine Diagnose (als ICD-10 und Freitext)
- Betroffene Organe
- Zeitpunkt der Sepsisdiagnose

#### 1.1.7. Fehlende Kategorie

Für die folgenden Datenpunkte fehlen noch Kategorie und FHIR-Profil:

- ~~Computertomographie~~
- ~~Thoraxröntgen~~

### 1.2. Übersicht
Die folgende Übersicht findet sich außerdem als Excel Spreadsheet [hier](assets/datenschutzliste.xlsx)

Legende:

- `o` keine Bedenken
- `-` Diskussionsbedarf (**fett markiert**)
- `x` Datum muss aus dem Modell gestrichen werden (~~durchgestrichen~~)

| Datum | Kategorie | Messwert | FHIR-Profil | Datenschutzbedenken |
| ---------------------------------------------- | ------------ | ------------------------------------ | ---------------------------------------------------------------------------------- | ------------------- |
| Adrenalin | Medikation | µg/kg/min | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o` |
| Antibiotika | Medikation | je nach Medikament | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o` |
| Dobutamin | Medikation | µg/kg/min | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o` |
| Dopamin | Medikation | µg/kg/min | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o` |
| Noradrenalin | Medikation | µg/kg/min | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o` |
| Abdomen-Score[^3] | Laborwerte | Integer | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Arterieller Sauerstoffpartialdruck (PO2) | Laborwerte | mmHg | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Bilirubin | Laborwerte | mg/dl | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Blutkulturen | Laborwerte | Erregernachweis (Ja/Nein/Vielleicht) | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| CRB-65-Score[^3] | Laborwerte | Integer | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| CRP | Laborwerte | mg/l | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Glomeruläre Filtrationsrate (GFR) | Laborwerte | ml/min | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Haut/Weichteil-Score[^3] | Laborwerte | Integer | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Interleukin-6 | Laborwerte | ng/l | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Kreatinin | Laborwerte | lg/dl | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Laktat | Laborwerte | mg/dl | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Leukozyten | Laborwerte | Anzahl/µl | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Leukozyten im Liquor | Laborwerte | Anzahl/µl | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Neuro-Score[^3] | Laborwerte | Integer | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Oxygenierungsindex | Laborwerte | mmHg | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| PCT | Laborwerte | ng/ml | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Resistogramm | Laborwerte | Resistenz pro Erreger | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| SOFA-Score | Laborwerte | Punktzahl | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Thrombozyten | Laborwerte | Anzahl/µl | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Urinkulturen | Laborwerte | Erregernachweis (Ja/Nein/Vielleicht) | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| Uro-Score[^3] | Laborwerte | Integer | [ObservationLab](./kodierungsgrundlage.md#1152-observationlab) | `o` |
| **Alter** | Stammdaten | Kohorte (5-Jahres-Schritte) | [Patient](./kodierungsgrundlage.md#1111-patient) | `-` |
| Aufnahmegrund | Stammdaten | Freitext | [Encounter](./kodierungsgrundlage.md#1121-encounter) | `o` |
| **Aufnahmezeitpunkt** | Stammdaten | Zeitpunkt | [Encounter](./kodierungsgrundlage.md#1121-encounter) | `-` |
| Entlassungsgrund | Stammdaten | Freitext | [Encounter](./kodierungsgrundlage.md#1121-encounter) | `o` |
| **Entlassungszeitpunkt** | Stammdaten | Zeitpunkt | [Encounter](./kodierungsgrundlage.md#1121-encounter) | `-` |
| ~~Geburtsort~~ | Stammdaten | Postleitzahl | [Patient](./kodierungsgrundlage.md#1111-patient) | `x` |
| Geschlecht (amtlich) | Stammdaten | m/w/d | [Patient](./kodierungsgrundlage.md#1111-patient) | `o` |
| Gewicht | Stammdaten | kg | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| **Wohnort** | Stammdaten | Postleitzahl | [Patient](./kodierungsgrundlage.md#1111-patient) | `-` |
| Atemfrequenz | Vitalzeichen | Atemzüge/min | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Blutdruck | Vitalzeichen | mmHg | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Blutzucker | Vitalzeichen | mg/dl | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| CAM-ICU | Vitalzeichen | Punktzahl | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Dialyse | Vitalzeichen | Nein/Akut/Chronisch | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition) | `o` |
| Glasgow Coma Scale | Vitalzeichen | Punktzahl | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Herzfrequenz | Vitalzeichen | Schläge/min | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| ICDSC | Vitalzeichen | Punktzahl | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Körpertemperatur | Vitalzeichen | Grad Celsius | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Mittlerer arterieller Druck | Vitalzeichen | mmHg | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Mechanische Beatmung | Vitalzeichen | Ja/Nein | [Procedure](./kodierungsgrundlage.md#1141-procedure) | `o` |
| qSOFA | Vitalzeichen | Punktzahl | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| RASS-Score | Vitalzeichen | Punktzahl | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Sauerstoffkonzentration der Einatemluft (FiO2) | Vitalzeichen | Prozentzahl | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Urinausscheidung | Vitalzeichen | ml/h | [Observation](./kodierungsgrundlage.md#1112-observation) | `o` |
| Allergien | Hintergrund | Freitext | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition) | `o` |
| ~~Berufliches Umfeld~~ | Hintergrund | Freitext | [OccupationalData](./kodierungsgrundlage.md#1212-occupationaldata) | `x` |
| Pflegeeinrichtung | Hintergrund | Ja/Nein | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition) | `o` |
| ~~Reiseanamnese~~ | Hintergrund | Freitext | [TravelHistory](./kodierungsgrundlage.md#124-travelhistory) | `x` |
| Vorangegangene Antibiotika-Therapie | Hintergrund | Freitext | [MedicationAdministration](./kodierungsgrundlage.md#1162-medicationadministration) | `o` |
| Vorerkrankungen[^1] | Hintergrund | Freitext | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition) | `o` |
| Diagnose | Diagnose | ICD-10 Code | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition) | `o` |
| Betroffene Organe | Diagnose | Freitext | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition) | `o` |
| **Zeitpunkt der Sepsisdiagnose** | Diagnose | Zeitpunkt | [Condition](./kodierungsgrundlage.md#1131-condition) | `-` |
| ~~Computertomographie~~[^2] | ? | Zusammenfassung / Bild | ? | `o` |
| ~~Thoraxröntgen~~[^2] | ? | Zusammenfassung / Bild | ? | `o` |

[^1]: Insbesondere Diabetes mellitus
[^2]: Gestrichten unter der Annahme, dass kein strukturell ableitbarer Datenpunkt vorliegt. Ansonsten reevaluieren.
[^3]: Werte spezifisch für das EvKB (liegen strukturiert vor).

Kommentar zu Diskussionsbedarf:

- Alter: Darf nur in Kohorten erfasst werden, nicht als Geburtsdatum.
- Aufnahme-/ Entlassungszeitpunkt: Sollte idealerweise nicht direkt erfasst werden (alternativ: andere Zeitstempel relativ zum Aufnahmezeitpunkt abbilden)
- Wohnort: Nicht die volle PLZ, sondern Kompromiss finden [Anm.: Die ersten beiden Stellen der PLZ sind nicht ausreichend für eine Modellbildung!]
- Zeitpunkt der Sepsisdiagnose: Relativ zum Aufnahmezeitpunkt abbilden