# Introduction for processing clinical data - 現代醫療過程使用到許多儀器及資訊系統，這些系統會產生臨床資料(clinical data) - 系統常常需輸出臨床資料，以利分析處理、或跨系統整合應用 - 但程式設計師不一定能恰當解析臨床資料(因老師沒教) - 解析臨醫資料，並將其資料標準化，是未來智慧健康醫療的基礎 ## 臨醫資料分類 - 文字檔 -- plain text, CSV, JSON,XML ... -- 醫院資訊資訊系統主要處理文字資料，也輸出文字檔資料 - 數位檔 -- 如:心電圖、腦波圖、醫學影像等由醫療儀器產生的資料 -- 通常夾雜數位及文字資料，不容易解析 ## Parsing clinical data - 需先了解資料規格(最難) - 讀取資料檔案 - 在 binary 陣列當中，讀取每個 byte 資料 - 解析的資料格式轉換(最複雜、最容易出錯) - 數值大小換算及資料分析處理 - 結果輸出 ## 縱橫資料 - array 紀錄許多筆同一類型資料 - 成對之 name value pair - 結合成樹狀結構 csv 以行列結構紀錄 ## 學習重點 1. 學會解析數位資料 2. 將其轉成容易處理的標準規格，如 FHIR media 描述資料 + 單純的數位資料( 如 一串 int 或 float 單純心電圖數據或影像像素資料) ## 練習 1. 使用 VS code Show HexDump 分析資料檔案 2. 使用程式解析各式臨醫資料 3. 將臨醫資料轉成 FHIR JSON 格式 4. 配合應用情境、整合架構、及流程，產生並上傳標準規的 FHIR 資料 ### CSV 範例資料 ```csv Name, bankName, bankID, accountID 黃大毛,花二信,216,07012345678 楊玉環,郵局,700,22398765432 蔡小文,富邦銀行, 012,55555555555555 ``` 注: 上述資料可轉成 FHIR account 歐: https://build.fhir.org/account.html