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# System prepended metadata

title: 'Bruker: MDE-Olimpia'

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# Bruker: MDE-Olimpia

:information_source: Usar Paravision 6.0.1, antena 2x2.



## Registrar animal

### Animal ID, Animal Name
Nomenclatura: `R83A-Olimpia`, donde 83 es el número de la rata madre, y la letra A significa la primera de las crías.

Apuntar fecha de nacimiento y sexo.

### Study Name
Simplemente `1` (número de escaneo). Apuntar el peso.

![](https://i.imgur.com/A39oi3r.png)

## Protocolo MDE_Olimpia
Está disponible en Rat-Head-Diffusion.
![](https://i.imgur.com/RdGjNcz.png)

1. Arrastrar el localizador y ejecutar.
1. Arrastrar `DWI_for_shimming`.
    * Abrir pestaña de ajustes y ejecutar un B0map
    ![](https://i.imgur.com/dnwPQ8C.png)
    Al terminar, dar clic en _apply_ y luego _back_.

    * Colocar las rebanadas de manera que alcancen a cubrir desde bulbo hasta cerebelo. Se vale estirar el FOV de forma rostro-caudal para que las rebanadas se separen entre ellas y que tengamos cobertura total del cerebro.
    * En _Setup-Shim-Auto-shim_ seleccionar _map shim_, y habilitar palomita en _automatic shim volume_.
![](https://i.imgur.com/7Hv5Dii.png)
    * Ejecutar secuencia, dura muy poco. Lo que en realidad queremos es el mapa de B0, pero revisar imágenes y ver que no haya artefactos furiosos.
1. Arrastrar `STE_b200_10d`.
    * Revisar que esté _current shim_
    * Colocar FOV
    ![](https://i.imgur.com/193rbUN.png)
1. Arrastrar el resto de las DWIs (STE, PTE y LTE), de una por una.
1. Copiar los parámetros de `STE_b200_10d` a todas las demás (slice orientation, geometry, saturations).
1. Dar clic en _Apply_ a todas las secuencias de DWI. Dar clic en _Continue_.
1. Arrastrar secuencia T2_TurboRARE. Acomodar manualmente FOV para cobertura total de cerebro. Adquirir.






## Sorpresas

### Error (esperado) de gradiente
En las secuencias con b=2000 aparece el siguiente error que podemos ignorar:
![](https://i.imgur.com/Oo3AKNh.png)
Dar clic en `Close`. El error aparece 3 veces, es normal. Dar mismo clic a las tres veces.

### Image drift
A veces (no sé cómo predecirlo) los volúmenes a lo largo del tiempo parecen desplazarse de maneera ventro-dorsal o dorso-ventral. Si el drift es tanto que la corteza llega al borde dorsal del FOV, se va a enrollar. Si se desplaza dorso-ventralmente, perderemos la parte más basal del cerebro. Mientras la corteza siga en el FOV no hay mucho problema, pero si se enrolla será inutilizable. Si el drift es demasiado, hay que repetir la adquisición en cuestión, moviendo el FOV pero únicamente en el eje ventro-dorsal. No mover FOV de izquierda-derecha ni rostro-caudal.
