###### tags: `UAX` `Estudiantes` # Bioinformática y simulación de bioprocesos (Curso 2022/2023)​ - Grado en Biotecnología UAX <font color = 'gray'> <p style="text-align:right;">Prof.: Laura J. Marcos-Zambrano </font> ## Descripción de Contenidos: **TEMA 1: Introducción a la Bioinformática** Definición. El contexto de los datos Biológicos. Estructuras y tipos de datos. Introducción al Análisis de Datos y retos estadísticos. Introducción a Linux y línea de comandos. Lenguajes de programación. **TEMA 2: Fuentes de datos y herramientas bioinformáticas.** Tipos de bases de datos, plataformas de herramientas y visión general. Acceso a las bases de datos moleculares y de secuencias. **TEMA 3: Análisis de datos con R y Bioconductor** El Lenguaje R: entorno de trabajo, conceptos básicos, tipos de variables, funciones, vectores y operadores lógicos, listas. Bioconductor y librerías de R para Bioinformática. **TEMA 4: Secuencias de DNA y RNA.** Anotación de secuencias de DNA. Estrategias de análisis. Alineamiento de secuencias. BLAST, software libre. Algoritmos de alineamiento de pares de secuencias. Localización de secuencias. Descubrimiento de motivos conservados de secuencia. Análisis de expresión génica: Chips de DNA, microarrays: Affymetrix y cDNA. RNA-Seq y ChIP-Seq Transcriptómica. Métodos para estudiar la transcriptómica. **TEMA 5: Secuencias proteicas** Alineamiento, software libre. Alineamiento múltiple. Algoritmos de alineamiento múltiple. Método predictivo usando secuencias de proteínas. Bases de datos de estructura tridimensional. **TEMA 6: Introducción a las ómicas.** Introducción a las “Ómicas”. Genomas: El proyecto Genoma Humano. Conceptos básicos de proteómica, metabolómica, metagenómica. **TEMA 7: Bioinformática traslacional** Informática y Medicina de precisión. Integración de fuentes de datos. ## Seminarios: [Seminario I](https://hackmd.io/@laurichi13/rJOYbaXeo): Introducción a Linux [Seminario II](https://hackmd.io/@laurichi13/Byp6Ygpeo): Bases de datos Bioinformáticas [Seminario III](https://hackmd.io/@laurichi13/SJERmAVZj): Introducción al análisis de datos con R y Bioconductor ## Laboratorios: [Laboratorio I](https://hackmd.io/@laurichi13/r1is_yqzj). ## Proyecto Final: ## Enlaces de Interés: [Creación de Máquina virtual Oracle Virtual Box](https://hackmd.io/@laurichi13/H13G0jQes).