###### tags: `UAX` `Estudiantes` # Laboratorio IV: Análisis de enriquecimiento funcional <font color = 'gray'> <p style="text-align:right;">Prof.: Laura J. Marcos-Zambrano </font> ## GO enrichment analysis: **1. Datos a utilizar:** * Ejemplo para tutorial en [ZENODO](https://zenodo.org/record/2565417#.Y1lSEXZBxgR). * Resultados del Laboratorio III: - Listado de genes [UP](https://drive.google.com/file/d/1EtY4IYd0aHF3HtDtakH9gLU_YZX1QJsa/view?usp=sharing) regulated en medio de cultivo SCGM. - Listado de genes [Down](https://drive.google.com/file/d/1GRZXYEpZAf_pSPeyvmA4KAzShZ99Vfx5/view?usp=sharing) Regulated en medio de cultivo SCGM. - Tabla con resultados de [análisis diferencial](https://drive.google.com/file/d/1Ik49r2AdrUr4UL-tkeQ1uGvtCFtUJTIa/view?usp=sharing). - [Anotaciones](https://drive.google.com/file/d/1sP-WPiXIMp4m8nAV2thY97FF64PfuK25/view?usp=sharing) genes Humanos, descargada de la web de GEO. - Tabla con la [ontología de términos GO](https://drive.google.com/file/d/1ZV7BubQzt4veSGfS3rSX5dMGYpnRC0Mk/view?usp=sharing), con las descripciones de cada término y sus relaciones. **2. Web de [Galaxy](https://usegalaxy.eu/).** ## Tutorial Seguiremos el tutorial de [Galaxy](https://training.galaxyproject.org/training-material/topics/transcriptomics/tutorials/goenrichment/tutorial.html) Training! para realizar análisis de enriquecimiento funcional. ## Ejercicio Ejecuta un enriquecimiento de los genes up regulated y downregulated obtenidos en el [Laboratorio III](https://hackmd.io/@laurichi13/rkCfeK6mi) de los datos cargados en el [Seminario V](https://hackmd.io/@laurichi13/SkJs3fsXo). * ¿Qué diferencias observas en cuanto a los enriquecimientos funcionales en cada caso? * Explica brevemente los resultados obtenidos en el Laboratorio III y el Laboratorio IV. Interpreta los reusltados buscando un sentido biológico, para ello debes tomar en cuenta el diseño del experimento. ![](https://i.imgur.com/ibfhAQt.jpg) :::info **IMPORTANTE:** :memo: La evaluación de los Laboratorios III y IV se corresponde con responder las dos preguntas anteriores. :+1: Incluye y explica los gráficos obtenidos en el laboratorio III. :dancers: Se puede realizar en parejas. :::