# Stanično disanje
Ena Kosec
Sveučilište u Rijeci, odjel za biotehnologiju
kolegij: informatika
Rijeka, 30. lipnja 2023.
---
# Sadržaj
1. Što je stanično disanje?
1.1. ATP
2. Gdje i kako se odvija?
2.1. Glikoliza
2.2. Krebsov ciklus
2.3. Oksidativna fosforilacija
3. jednadžba procesa
4. izgled molekula koje sudjeluju u procesu
---
# Što je stanično disanje?
- <font color=green> **skup metaboličkih reakcija** </font> i procesa u stanici
- oslobađanje energije koja se kasnije ulaže u proizvodnju <font color=green> **adenozin trifosfata** </font>
 slika 1. prikaz ATP-a pomoću RDKit-a
----
### ATP
- adenozin trifosfat
- glavno unutarstanično <font color=green> **skladište energije** </font>
- nastaje 38 molekula u životinjskim i 36 molekula u biljnim st.
- [nešto više o ATP-u](https://hr.wikipedia.org/wiki/Adenozin_trifosfat)
<img src="https://cdn.britannica.com/78/117278-050-576B132B/processes-production-ATP-glycolysis-tricarboxylic-acid-cycle.jpg" width=300 hight=300 >
slika 2. [izvor](https://www.britannica.com/science/adenosine-triphosphate), nastanak ATP-a
---
# Gdje i kako se odvija?
- u stanici
- biljne st.: kloroplast
- životinjske st.: mitohondrij
- kroz 3 procesa:
- glikoliza
- Krebsov ciklus
- oksidativna fosforilacija
----
### Glikoliza
- u citoplazmi
```mermaid
graph TD;
A[1 mol glukoze]--->B[2 mol pirogrožđane kis];
A--->C[2 mol ATP-a];
```
<font color=green> $C_6H_{12}O_6 \to 2C_3 + 2ATP + 2NADH + H^+$ </font>
- bez kisika → proces fermentacije, ne nastaje energija
----
### Krebsov ciklus
- u matriksu mitohondrija
- aerobni proces
- iz pirogrožđane kiseline nastaje ugljikov(IV) oksid i 2 molekule ATP-a
----
### Oksidativna fosforilacija
- u unutrašnjoj membrani mitohondrija
- energetski najproduktivniji dio
- nastaje voda i 34 molekule ATP-a
----

slika 3. [izvor](https://edutorij.e-skole.hr/share/proxy/alfresco-noauth/edutorij/api/proxy-guest/57d48e40-07e9-452c-8f72-3275917d687e/j_2.html), prikaz nastanka ATP-a glikolizom, Krebsovim ciklusom i oksidativnom fosforilacijom
----
### nastanak ATP-a
```mermaid
flowchart TD;
D[st disanje]--->E[glikoliza];
D--->F[Krebs ciklus];
D--->G[oks fosfor];
E--->H[2 ATP];
F--->I[2 ATP];
G--->J[34 ATP];
```
----
```mermaid
pie
title Postotak nastanka ATP-a po fazama staničnog disanja
"glikoliza": 2
"Krebsov ciklus": 2
"oksidativna fosforilacija": 34
```
---
# jednadžba procesa
<font color=green> $C_6H_{12}O_6{(aq)} + 6O_2{(g)} \to 6CO_2{(g)} + 6 H_2O_{(l)}$ </font>
|spoj|uloga|
|:---:|:---:|
|glukoza|glavni izvor energije|
|kisik|oslobađa en. iz hranjivih tvari|
|ugljikov dioksid|nusprodukt/višak u reakciji|
|voda|produkt oksidativne fosforilacije|
----
### produkti i reaktanti staničnog disanja
```mermaid
pie
title Postotak nastanka ATP-a po fazama staničnog disanja
"glukoza": 1
"kisik": 6
"ugljikov dioksid": 6
"voda": 6
```
---
# izgled molekula koje sudjeluju u procesu
----

slika 4. prikaz molekule glukoze pomoću PyMol-a
----

Slika 5. prikaz molekule kisika pomoću RDKit-a
----

Slika 6. prikaz molekule vode pomoću Avogadra
----

Slika 7. prikaz molekule ugljikovog dioksida pomoću RDKit-a
{"slideOptions":"{\"theme\":\"solarized\",\"transition\":\"convex\"}","title":"Stanično disanje","contributors":"[{\"id\":\"8ae66a85-c0d5-42ab-bd97-9e963aae6132\",\"add\":5185,\"del\":1421}]"}