FHIR IG導入與FHIR資料平台 === 目前我們處於FHRI的萌芽期,絕大多數的醫療資訊資料並不是FHIR的格式。希望將醫療資料FHIR化,大致有兩個方式:從源頭Push或是使用端Pull。一種方式是希望將原始的資料盡可能FHIR化,之後發展FHIR相關應用;另一個角度則是從應用出發,制定新的IG,然後逐步將資料FHIR化。平心而論,這兩種方式殊途同歸,但畢竟優先順序不同,作法自然也有差異。  如果醫院採取先將資料FHIR化,那首要的工作就是FHIR建置資料平台(如上圖棕色部分),然後使用類似ETL的方法,將原始資料轉換成FHIR格式後匯入FHIR平台。雖然這樣的作法較為全面,也同時建立醫療大數據的基礎,但實務上這樣的方式也需要立即投入較大量的人力、物力資源才能達到預期的效益。 這樣的做法會有一個潛在問題,由於過去醫療資訊系統所蒐集的資料並不夠全方位,也就是說,發展IG應用時,如果遇到IG所需要的資料並非存在於既有系統,醫院先了解IG的真正需求,然後新增或修正既有HIS的功能/流程,才能順利產生資料,符合IG規範。如果從軟體生命週期的觀點來看,就是醫院必須先完成系統分析工作,才能開始開發IG的應用。 另一個做法則是從FHIR應用出發,先符合官方要求,再逐步將醫療資料FHIR化。這樣的做法缺點在於對FHIR並沒有一個全方面的解決方案,同時過程中無可避免會產生許多重複性的資料。因此,我們將過程拆解,提供一個IG導入的標準作業流程,希望能以漸進式的作法,同時兼顧醫院短期(符合IG需求)與中長期(全方面FHIR化)目標。 導入IG第一個困難是了解IG Profile相關欄位與既有系統的對應。一般而言,我們會從IG規範與範例資料開始,清楚每一個Profile/Element意義,同時使用醫院真實的驗證資料嘗試去產生符合IG規範的FHIR Bundle檔案。如果這個過程順利,就可以確認我們清楚醫院既有資料與IG規範的關係,同時了解哪些資料並不存在於既有系統之中,接下來才是醫療資訊系統的功能增修。 這個流程需要很多人工作業,上圖綠色的部分則是說明如何使用工具將這樣流程自動化(半自動化)。包含三個主要元件:IG Analyzer、[FUME](https://github.com/Outburn-IL/fume-community)與IG Cooker。 IG Analyzer的輸入為IG package,根據IG所定義的規範內容,產生FUME所需要的設定檔(FLASH)同時轉換為對應之ConceptMap並上傳至FHIR資料平台。操作畫面如下圖:  FUME提供了將JSON檔案轉換為標準FHIR Resource的功能,也就是說,結合FUME與IG Aanlyzer所產生的ConceptMap,就可以將簡單的JSON檔案,透過IG Cooker轉換為FHIR Resource檔(如下圖)。  如果搭配衛福部提供的Excel檔案,我們就可以將驗證資料逐步輸入IG Cooker並產生IG所需要的Profile與Bundle。 IG Analyzer另一個功能則是根據既有的FHIR資料,逆向產生FHIR資料平台所需之測試資料,也就是說當我們使用驗證資料產生FHIR Bundle的同時,我們也可以產生FHIR資料平台所需要的測試資料,這些測試資料可使用於HIS資料匯入與FHIR資料平台導入IG的開發。
×
Sign in
Email
Password
Forgot password
or
By clicking below, you agree to our
terms of service
.
Sign in via Facebook
Sign in via Twitter
Sign in via GitHub
Sign in via Dropbox
Sign in with Wallet
Wallet (
)
Connect another wallet
New to HackMD?
Sign up