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title: 2024年度第3回MDatahub開発合宿
tags: [MicrobiomeDataHub, Meeting]

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2024年度第3回MDatahub開発合宿
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###### tags: `MicrobiomeDataHub` `Meeting`

:::info
- **Location:** [静岡県静岡市ホテルアソシア静岡] (https://www.associa.com/sth/access/) 2階　つつじ
- **Date:** 2025年2月10日13時-2月13日17時
- **Agenda**
- 2月10日 (月)

    > [name=森宙史（遺伝研）　主催者]
	> [name=藤澤貴智（遺伝研）　現地参加者]
	> [name=大石直哉（dogrun）　現地参加者]
- 1.1. 受付・会場準備 13時-13時30分`30 min`
- 1.2. 合宿TODO list作成、分担決め会議 13時30分-14時 `30 min`
- 1.3. 開発　14時-21時 `7 hour`
- 1.4. ホテルチェックイン&夕食　21時

- 2月11日 (火)
    > [name=森宙史（遺伝研）　主催者]
	> [name=藤澤貴智（遺伝研）　現地参加者]
	> [name=大石直哉（dogrun）　現地参加者]

- 2.1. 開発　9時-13時`4 hour`
- 2.2. 昼食休憩　13時-14時 `1 hour`
- 2.3. 開発　14時-21時 `7 hour`

- 2月12日 (水)
    > [name=森宙史（遺伝研）　主催者]
	> [name=藤澤貴智（遺伝研）　現地参加者]
	> [name=大石直哉（dogrun）　現地参加者]

- 2.1. 開発　9時-13時`4 hour`
- 2.2. 昼食休憩　13時-14時 `1 hour`
- 2.3. 開発　14時-21時 `7 hour`

- 2月13日 (木)
    > [name=森宙史（遺伝研）　主催者]
	> [name=藤澤貴智（遺伝研）　現地参加者]
	> [name=大石直哉（dogrun）　現地参加者]
  	> [name=東光一（遺伝研） オンライン参加者]
- 3.1. 開発　9時-13時`4 hour`
- 3.2. 昼食休憩　13時-14時 `1 hour`
- 3.3. 開発　14時-16時 `2 hour`
- 3.4. 4日間のまとめとMicrobiome Datahub論文化に向けた計画会議　16時-17時 `1 hour`


- **参加者:**
    - 森宙史（遺伝研）　主催者
	- 藤澤貴智（遺伝研）　現地参加者
	- 大石直哉（dogrun）　現地参加者
	- 東光一（遺伝研）　オンライン参加者
- **Contact:** 森宙史（遺伝研） <hmori あっと nig.ac.jp>
- **主催者:** 森宙史（国立遺伝学研究所）
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:dart: 目標
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年末に公開したMicrobiome Datahub正式版の機能拡充
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- Microbiome Datahub top page改良
- ユーザドキュメント改良
- MBGD Orthologリストの見せ方改良
- Bac2Featureのphenotypeリストの見せ方改良
    - 11 数値データ (cell_diameter, cell_length, doubling_h, growth_tmp, optimum_tmp, optimum_ph, genome_size, gc_content, coding_genes, rRNA16S_genes, tRNA_genes)
    - 16 0/1データ (gram_stain, sporulation, motility, range_salinity, facultative_respiration, anaerobic_respiration, aerobic_respiration, mesophilic_range_tmp, thermophilic_range_tmp, psychrophilic_range_tmp, bacillus_cell_shape, coccus_cell_shape, filament_cell_shape, coccobacillus_cell_shape, vibrio_cell_shape, spiral_cell_shape)


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## Notes 
- 食事・宿泊先は各自で確保ください
<!-- Other important details discussed during the meeting can be entered here. -->