# PacBio pipeline　

* PacBio 公司所推出的 Sequel II ，是一種長序列定序技術 。
* Sequel II 配套的分析軟體「SMRT Link 10」也加強了整合分析功能，使數據處理流程更加簡潔流暢。

## 運作架構

## 目錄結構
主要的分析與資料整理都作業於　ｓｅｒｖｅｒ

下機資料會在RUN裡面，會根據每個 Run 有幾片cell分檔案夾。
分析的檔案或記錄會根據 JOB ID 在 job_root.local 下分資料夾

## SMRT Link　基本操作與結構


## 最後的output結果處理
根據每個run 去放，最後寄出的資料


SMRT Link　本身就內含許多分析工具，可以直接在ｗｅｂ　ＵＩ　上執行完，然後再去挖資料出來。

## SMRT Link　提供客戶的資料結構