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# System prepended metadata

title: Des notebooks R plus reproductibles
tags: [JE-ORGA, JE]

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title: Des notebooks R plus reproductibles
subtitle: Journées GT Notebook 2024
date: 2024-11-13
layout: notes
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## Bienvenue!

:::info

**Bienvenue sur la page de l'atelier _Des notebooks R plus reproductibles_ !**

Vous êtes invités à participer à l'édition de cette page. Il suffit d'ouvrir sa source en cliquant sur le lien `edit on hackmd` en haut à gauche de la page :  
![image](https://hackmd.io/_uploads/rJ51kEbk1l.png)



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Pour en savoir plus, consulter [la documentation](https://pinkmypad.net).


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#R #reproductibilité

## L'atelier 

:::warning

**Organisation :** Nicolas Roelandt, avec Sébastien R.C. & Hugues P.

**Objectif·s :** L'objectif de l'atelier est de mettre en oeuvre plusieurs outils de l'écosystème R permettant d'améliorer la reproductibilité *computationelle* de traitements de données

**Durée :** 2h

**Méthodes :** L'atelier repose sur le principe de ...

**Outils & librairies :** Quarto, Renv, targets, ...

**Dépots git :**

- Materiel : 
  - [Support](https://gt-notebook.gitpages.huma-num.fr/workshop/je_notebook_2024/notebooks-r-plus-reproductibles/support/)
  - [Scripts](https://gitlab.huma-num.fr/gt-notebook/workshop/je_notebook_2024/notebooks-r-plus-reproductibles/scripts)


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## Déroulé de l'atelier

:::info
Cette section liste les étapes de l'atelier et indique les ressources nécessaires/disponibles pour chaque étape.
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:::success

Étape 1: Anatomie d'un notebook *Quarto*
Étape 2: Renforcer les traitements avec *targets*
Étape 3: Gérer l'environnement logiciel avec *Renv*
Étape 4: Aller plus loin avec *Docker*

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## Prise de note

:::info
Cette section peut être utilisée librement comme espace d'organisation et de documentation pendant l'atelier.
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:::warning
**Participants :** _ajoutez vos noms ici_
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## Compte-rendu

:::info
Cette section est utilisée comme espace de consolidation : synthèse des réalisation, difficultés/freins rencontré·e·s, pistes pour la suite, autre...
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### Réalisations

### Difficultés rencontrées

### Pour aller plus loin

