--- title: Annuaire Journée GT Notebook date: 2024-10-07 layout: cards header-includes: | <style> body { font-family: mono;} div.notes {font-size: large;} code { font-size: 0.85em; } figure img { border: 2px #eee solid; border-radius: 5px;} figcaption { font-size: 1em; } /*section.level2 {display: initial; width: 60%; border-right: 2px solid #eee; }*/ section.level2 {border: 1px #ddd solid; border-radius: 3px; flex: 1 1 300px;} section.largecard {flex: 2 1 100%;} section.footnotes {display: inline-block; width: 60%; font-size: small;} section.footnotes hr {border-bottom-width: 2px} div.column{display: inline-block; vertical-align: top; width: 50%;} div.info, section.info {color: #31708f; background-color: #d9edf7; border-color: #bce8f1; border: 1px solid ; padding: 0.7em 1em; margin-bottom: 0.5em;} div.success, section.success {color: #3c763d; background-color: #dff0d8; border-color: #d6e9c6; border: 1px solid; padding: 0.7em 1em; margin-bottom: 0.5em;} div.warning, section.warning {color: #8a6d3b; background-color: #fcf8e3; border-color: #faebcc; border: 1px solid; padding: 0.7em 1em; margin-bottom: 0.5em;} div.danger, section.danger {color: #a94442; background-color: #f2dede; border-color: #ebccd1; border: 1px solid; padding: 0.7em 1em; margin-bottom: 0.5em;} ul { margin: 0 0 1em; } ol>li>a { text-decoration: underline; } a:visited {color: #2306ad;} .blue {color: blue;} .div130 { width: 130%; } code, .sourceCode { background-color: lavender;} img.right {float:right; max-width: 200px; margin-left: 1em;} </style> --- ## Bienvenue! {.largecard} :::info **Bienvenue sur l'annuaire des journées** *édité ici : [https://pinkmypad.net/hackmd/bVNTSDazRAG8EhOUdV-Mxw](https://pinkmypad.net/hackmd/bVNTSDazRAG8EhOUdV-Mxw))* Vous êtes invité·e à ajouter votre entrée à l'annuaire : 1. Copiez les lignes ci-dessous ```markdown ## Prénom Nom ![](https://){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** **Contact :** **Domaine:** **Quel intérêt pour les notebooks ?** ``` 3. Ouvrez la source de cette page en cliquant sur le lien `edit on hackmd` en haut à gauche : ![image](https://hackmd.io/_uploads/BJDaZ4ZkJe.png) 3. Collez ces lignes directement à la fin du pad 4. Complétez les éléments demandés Pour rafraichir cette page, cliquer sur le bouton `[Refresh]` en haut à gauche de la page Pour en savoir plus, consulter [la documentation](https://pinkmypad.net). ::: ## Nicolas Sauret ![](https://hackmd.io/_uploads/rkYOm4bkJx.png){.right} **Situation :** Maitre de conférence à l'Université Paris 8 **Contact :** nicolas.sauret@univ-paris8.fr / [@nicolassauret](https://social.sciences.re/@nicolassauret) **Domaine:** Écritures numériques, écritures collectives, édition scientifique, humanités numériques **Quel intérêt pour les notebooks ?** - nouvelles écritures scientifiques, notamment collectives - nouvelles formes d'édition et de publication scientifiques - notebook comme un espace multi-displiniaire/pratiques permettant une heuristique sur les données et sur les modèles ## Nicolas Roelandt ![](https://hackmd.io/_uploads/B18a_SZyJe.jpg){.right} **Situation :** Ingénieur d'étude à l'Université Gustave Eiffel **Contact :** nicolas.roelandt@univ-eiffel.fr / [@NRoelandt](https://social.sciences.re/@NRoelandt) **Domaine:** Systèmes d'information géographique, logiciels libres et chataîgnes **Quel intérêt pour les notebooks ?** N'aime ni les traitements de textes et ni compiler du LaTeX. Lit le markdown couramment. ## Sébastien Rey-Coyrehourcq ![](https://hackmd.io/_uploads/Hye83SZkye.png =120x){.right} **Situation :** Ingénieur de recherche à l'UMR IDEES **Contact :** sebastien.rey-coyrehourcq@univ-rouen.fr / [@SReyCoyrehourcq](https://social.sciences.re/@SReyCoyrehourcq) **Domaine:** Informatique développement logiciel (simulation) et calcul intensif, Géographie/Géomatique **Quel intérêt pour les notebooks ?** - L'histoire et la mise en oeuvre passé et future du Literate Programming avec Org et Emacs - Approcher un peu l'eclectisme des pratiques qui suivent les évolutions de ce dispositif multiforme - Le croisement des formes de ces dispositifs avec les questions de reproductibilité (computationelles et les autres) - Progresser dans les outils et les concepts environant le Literate Programing (Common Lisp & Scheme, Moldable Development, IHM , Litératie N. avec [Ink&Switch](https://inkandswitch.com/)/[Inachevé imprimé](https://inacheve-dimprimer.net/), etc. ) en vue de tester un outil de composition de modèle de simulation ## Raphaëlle Krummeich ![](https://gitlab.huma-num.fr/uploads/-/system/user/avatar/432/avatar.png?width=192){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Ingénieure de recherche à l'UMR IDEES **Contact :** raphaelle.krummeich@univ-rouen.fr **Domaine:** Sources et méthodes, histoire des techniques, graphes de connaissances **Quel intérêt pour les notebooks ?** un média utile pour favoriser le dialogue entre disciplines pour une approche rélfexive des machines numériques utilisées dans la recherche et l'enseignement ## Hugues Pecout ![](https://rzine.fr/authors/hpecout/avatar_hu48c8aed0a4ba9ea73497cb3e50db8800_329889_250x250_fill_q90_lanczos_center.jpeg?width=150){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Ingénieure d'études à l'UMR Géographie-cités **Contact :** hugues.pecout@cnrs.fr **Domaine :** Géomatique, analyse spatiale, cartographie... avec R ! **Quel intérêt pour les notebooks ?** : Il s'agit de mon principal outil de production de document. Je suis également membre du comité éditorial [Rzine](https://rzine.fr/), une collection d'articles de méthode en *format* notebook (Rmarkdown, Quarto) ## Olivier Gillet ![](https://avatars.githubusercontent.com/u/24494376?s=400&v=4){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Ingénieure de recherche à l'UMR IDEES **Contact :** gillet.olivier@outlook.fr **Domaine:** Géomatique, Système multi-agents, Modélisation **Quel intérêt pour les notebooks ?** ## Mattia Bunel ![](https://mbunel.xyz/static/archi.jpg){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Ingénieur de recherche à l'UMR Géographie-cité & [PGHN](https://psigehess.hypotheses.org/membres) (EHESS) **Contact :** mattia.bunel@ehess.fr / [@mattiabunel](https://framapiaf.org/@mattiabunel) **Domaine:** Géomatique **Quel intérêt pour les notebooks ?** ## Alexandre Cebeillac ![image](https://i1.rgstatic.net/ii/profile.image/613136407216128-1523194519764_Q128/Alexandre-Cebeillac.jpg){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Post doc / Ingénieur à l'UMR IDEES / Rouen **Contact :** alexandre.cebeillac1@univ-rouen.fr **Domaine:** Géomatique / Télédétection / Modélisation **Quel intérêt pour les notebooks ?** Quarto (et avant rmarkdown) est le principal outil que j'utilise pour documenter mes codes et les partager via un serveur human-num. ## Paul Chapron ![oldpunk](https://hackmd.io/_uploads/B1lsPyF8b1e.jpg){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** chercheur au [LASTIG](https://www.umr-lastig.fr/) **Contact :** paulpointchapronarobaseignpointfr **Domaine:** simulation pour les sciences sociales, exploration de modèles de simulation avec [OpenMOLE](http://next.openmole.org) **Quel intérêt pour les notebooks ?** - vague, mais c'est des copains qui s'occupent de ces journées - le dialecte R-markdown était vraiment confortable, faut-il en changer ? - voir si un notebook peut faire un bon support de communication de résultats de recherche (pour des petits modèles en tout cas ) ## Marc Chantreux ![ma page pro](https://mc.pages.unistra.fr){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** ingénieur perché au CESAR (calcul et services avancés à la recherche) de l'université de Strasbourg. **Contact :** mc@unistra.fr **Domaine:** sobriété, convivialisme, et pratique intuitive de la philosophie des sciences par l'usage d'unix. :wq **Quel intérêt pour les notebooks ?** fan d'horreur en général, je pratique surtout jupyter les vendredis 13 et les nuits de pleine lune. ## Konrad Hinsen ![](https://hackmd.io/_uploads/HydVeiUbkx.png){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** chercheur CNRS au [Centre de Biophysique Moléculaire](https://cbm.cnrs.fr/) à Orléans et chercheur associé au [Synchrotron SOLEIL](https://www.synchrotron-soleil.fr/) **Contact :** konrad.hinsen@cnrs.fr **Domaine:** physique statistique, simulation moléculaire, épistémologie du calcul scientifique **Quel intérêt pour les notebooks ?** - Comment rendre les calculs plus intélligible ? - Comment rendre l'interaction avec l'ordinateur plus fluide ? ## Pierre Poulain ![](https://hackmd.io/_uploads/H1v_Y6U-1l.png){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** maître de conférences en bioinformatique à [Université Paris Cité](https://u-paris.fr/), chercheur au [Laboratoire de Biochimie Théorique](http://www-lbt.ibpc.fr/), ambassadeur [Software Heritage](https://www.softwareheritage.org/) **Contact :** pierre.poulain@u-paris.fr **Domaine:** bioinformatique, dynamique moléculaire, réutilisation des données de simulation, science ouverte. **Quel intérêt pour les notebooks ?** - Les notebooks comme outils d'exploration dans une analyse de données scientifiques ou comme rapports / compte-rendus. - Les notenooks comme supports pédagogiques pour l'apprentissage de la programmation (Python). ## Célya Gruson Daniel ![](https://){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** praticienne-chercheuse à Inno³, chercheuse associée au COSTECH (UTC) **Contact :** cgruson-daniel@inno3.fr **Domaine:** science ouverte, open source, communs numériques **Quel intérêt pour les notebooks ?** usages des notebooks en SHS, articulation avec les principes FAIR, dimension juridique des notebooks ## Émilien Schultz ![](https://emilienschultz.github.io/emilien.png){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Ingénieur de recherche / data scientist au CREST (ENSAE/GENES) **Contact :** emilien.schultz@ensae.fr **Domaine:** Sciences sociales computationnelles **Quel intérêt pour les notebooks ?** Engagé dans la programmation Python et familier du projet Jupyter ; [recherches sur les notebooks Jupyter](https://hal.science/hal-04316428) ## Gabriel Alcaras ![](https://medialab.sciencespo.fr/static/photo_2024-09-09_17-42-51_8f974383-ab34-41cc-ab62-fdbaa953f083.cover.jpg){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Chercheur post-doctoral au médialab de Sciences Po Paris **Contact :** gabriel.alcaras@sciencespo.fr **Domaine:** sociologie de l'informatique, sciences sociales computationnelles **Quel intérêt pour les notebooks ?** usages des notebooks en SHS, côté recherche et enseignement ; études sur l'écriture informatique ## Guillaume Anciaux ![](https://gitlab.com/uploads/-/system/user/avatar/5219042/avatar.png?width=800){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Collaboratur Scientifique Senior à l'[EPFL-ENAC-IIC-LSMS](https://www.epfl.ch/labs/lsms/) **Contact :** guillaume.anciaux@epfl.ch, https://gitlab.com/ganciaux **Domaine:** computational mechanics, dataset curation, open publication **Quel intérêt pour les notebooks ?** Utilisation pour curation, vizualization, edition et annotation de jeux de données. Utilisation pour l'enseignement, pour les exercices mais aussi pour les cours en amphi. Utilisation pour les échanges de recherche, notamment pour diffuser des reésultats de simulations, et ou expérience. Utilization pour la réalization de slides de présentation. ## Simon Tournier ![](https://){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** Ingénieur de Recherche à la [Plateforme Technologique](https://plateforme-stlouis.medecine.univ-paris-diderot.fr/) de l'Institut de Recherche Saint Louis **Contact :** simon.tournier@u-paris.fr **Domaine:** calcul scientifique, parfois de la bioinformatique, environnement logiciel reproductible **Quel intérêt pour les notebooks ?** Comment rendre reproductible (vérifiable) ce qui est concu interactif ? ## Julien Perret ![](https://www.umr-lastig.fr/julien-perret/img/julien.jpg){.right} <!--lien vers une photographie/illustration--> **Situation :** chercheur au [LASTIG](https://www.umr-lastig.fr/) **Contact :** julienpointperretarobaseignpointfr **Domaine:** simulation pour les sciences sociales, exploration de modèles de simulation avec [OpenMOLE](http://next.openmole.org) **Quel intérêt pour les notebooks ?** - reproductibilité en sciences de l'information géographique