# BLAST
## Biyoinformatik
### Hazırlayan : Ahmet Bera Beycar

## Blast Nedir ?

#### Biyolojik verilerin analizi, genetik araştırmalar ve türler arası benzerliklerin belirlenmesi için biyoinformatik araçları kullanılır.
Bu araçlardan biri de "BLAST"tır.

## Temel Blast Tipleri
##### Nucleotide BLAST (BLASTn): Nükleotid dizileri arasındaki benzerlikleri bulmak için kullanılır.
Protein BLAST (BLASTp): Protein dizileri arasındaki benzerlikleri bulmak için kullanılır.
TBLASTn ve TBLASTx: Nükleotid dizileri ile protein dizileri arasındaki benzerlikleri bulmak için kullanılır.

## Nasıl Çalışır


#### BLAST, bir sorgu dizisini alır ve bu diziyi bir veritabanındaki diğer dizilerle hızlı bir şekilde karşılaştırır.

## Bir Blast Tarama Örneği
#### Örnekte blast ile tarandığında çıkan dizi verilmiştir.

## KAYNAKLAR

##### Altschul, S. F., Gish, W., Miller, W., Myers, E. W., & Lipman, D. J. (1990). Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology, 215(3), 403-410.

Camacho, C., Coulouris, G., Avagyan, V., Ma, N., Papadopoulos, J., Bealer, K., & Madden, T. L. (2009). BLAST+: architecture and applications. BMC Bioinformatics, 10(1), 421.

Mount, D. W. (2004). Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press.

Pearson, W. R. (2013). An introduction to sequence similarity ("homology") searching. Current Protocols in Bioinformatics, 42(1), 3.1.1-3.1.8.

Pruitt, K. D., Tatusova, T., & Maglott, D. R. (2007). NCBI reference sequences (RefSeq): a curated non-redundant sequence database of genomes, transcripts and proteins. Nucleic Acids Research, 35(Database issue), D61-D65.