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# System prepended metadata

title: Análise de ligação (vetor+inserto) a partir do sequenciamento

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# Análise de ligação (vetor+inserto) a partir do sequenciamento

## Análise de cromatogramas com **phredPhrap**

A seguir serão executados os passos básicos para a análise de cromatogramas (eletroferogramas) gerados por sequenciamento Sanger.

O programa utilizado é o [**phredPhrap**](http://www.phrap.org/phredphrapconsed.html), um *script pipeline* (código com instruções para execução de tarefas sequenciais). 

![](https://i.imgur.com/RwO5cgz.png)


![](https://i.imgur.com/7jlxnIz.png)


1. Ir para o diretório HOME do usuário:
```bash=
cd ~/
```

2. Criar um diretório para a análise:
```bash=
mkdir Chitinophaga_Laccase
```

3. Entrar no diretório:
```bash=
cd Chitinophaga_Laccase/
```

4. Criar os diretórios chromat_dir e edit_dir:
```bash=
mkdir -p chromat_dir/ edit_dir/
``` 
5. 

