# Análise de ligação (vetor+inserto) a partir do sequenciamento ## Análise de cromatogramas com **phredPhrap** A seguir serão executados os passos básicos para a análise de cromatogramas (eletroferogramas) gerados por sequenciamento Sanger. O programa utilizado é o [**phredPhrap**](http://www.phrap.org/phredphrapconsed.html), um *script pipeline* (código com instruções para execução de tarefas sequenciais). ![](https://i.imgur.com/RwO5cgz.png) ![](https://i.imgur.com/7jlxnIz.png) 1. Ir para o diretório HOME do usuário: ```bash= cd ~/ ``` 2. Criar um diretório para a análise: ```bash= mkdir Chitinophaga_Laccase ``` 3. Entrar no diretório: ```bash= cd Chitinophaga_Laccase/ ``` 4. Criar os diretórios chromat_dir e edit_dir: ```bash= mkdir -p chromat_dir/ edit_dir/ ``` 5.