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tags: bioasq

BioASQ 10b phaseB

主要參考來源為 dmis-lab 在8b提出來的方法
去年實驗方法:https://ceur-ws.org/Vol-3180/paper-27.pdf

Exact Answer

去年的模型都在 /home/denis049/bioasq/bioasq8b/8b_code_result 裡面
各題型的模型都有經過不同的transfer learning,
M代表 MNLI,S 代表SQuAD,MS為先MNLI再SQuAD。
各題型所使用的模型、程式碼都在下方的bash檔中都找得到

模型

  • BioBERT_SQuAD
    /home/denis049/bioasq/model/biobert_squad
  • BioBERT_MNLI
    /home/denis049/bioasq/model/biobert_mnli

訓練資料集

/home/denis049/bioasq/data/BioASQ-9b/

Yes/no

Yes/no 問題的模型為 BioBERT 遷移學習於 MNLI。
訓練模型: /home/denis049/bioasq/bioasq8b/yesno/run.sh
訓練完模型在 /home/denis049/bioasq/bioasq8b/8b_code_result/yesno/M
predict and evaluation: /home/denis049/bioasq/bioasq8b/yesno/PnE.sh

Factoid

Factoid 問題的模型為 BioBERT 遷移學習於 SQuAD。
訓練模型: /home/denis049/bioasq/bioasq8b/factoid/run.sh
訓練完模型在 /home/denis049/bioasq/bioasq8b/8b_code_result/factoid/S
predict and evaluation: /home/denis049/bioasq/bioasq8b/factoid/PnE.sh

List

List 問題的模型為 BioBERT 遷移學習於 SQuAD。
訓練模型: /home/denis049/bioasq/bioasq8b/list/run.sh
訓練完模型在 /home/denis049/bioasq/bioasq8b/8b_code_result/list/S
predict and evaluation: /home/denis049/bioasq/bioasq8b/list/PnE.sh