前言 今天同事說到，hapi fhir 在驗大資料 (json 超過 3000 行， Bundle entry 超過20 筆)時，hapi fhir 會出現驗證不過的情況，但其實資料都對，出現的錯誤也不是 terminology code 的問題，而是資料不見了！並且，發生率還蠻高的，不得不把 HAPI FHIR 驗證給替換掉 資料正確卻找不到的範例 過程中，我們拿出官方的 Validator 去驗，竟然卻成功了！只不過會有 code 驗不到的問題，於是我們打算用官方 Validator 接 HAPI FHIR 當作 TX server 作為臨時解決方案，過程依然碰壁 這篇將會針對「讓 HAPI FHIR 作為 Official Validator 的 tx server」 :::warning 後續的 HAPI FHIR 都是使用 Docker 建立

前言 因為在實務上使用 HAPI FHIR 的 $validate API 時，遇到眾多問題，而使用原生官方的 validator 時，卻又無錯誤，所以決定將 HAPI FHIR 的 $validate 更改成呼叫遠端的驗證服務，並回傳 OperationOutcome 架構圖 :::danger 實作前，請先準備好使用 docker compose 架設的 HAPI FHIR，且套用 tx server 能力: 讓 HAPI FHIR 作為 Official Validator 的 tx server ::: Validator 服務選擇

以下是筆者當時遇到的情境，在 ValueSet 當中的 Code 都是擁有括號的 QW 數值 QW(x)，但在進行 Expansion 之後，會變成只有一個 QW 的結果 Magic ValueSet Expansion Result 問題的主要原因 HAPI FHIR 的 free text index 使用 simple query string 進行搜尋，若是文字使用以下符號，將有可能導致 query 不到所想要的結果 Elastic Search query string syntax +, |, -, ", *, (, ), ~ Elastic Search Simple query string syntax

前言 某天同事收到了別人發過來的 issue，問題大致為 HAPI FHIR 已上傳 Snomed CT 的 Code 以及 IG Package，但是上傳範例上去時，ValueSet 會報找不到 Code 的錯誤 在經過一小番研究後，終於大致譜出 HAPI FHIR 的 ValueSet 尋找 Code 的方式，筆者認為這機制挺有意思的，必須記錄一下錯誤重現 (Error Reproduction) 以及目前找到的解決方法 錯誤重現 首先，準備一台完全乾淨的 HAPI FHIR Server (這裡使用的是 v7.2.0 版本，記憶體建議 16 gb 以上) 請記得在 application.yaml 先設定 hibernate.search.enabled: true 上傳 Terminology Code 以下的 Code 都是使用 HAPI FHIR 官方的 CLI 工具上傳

所需知識 FHIR Resource文件查看以及組成能力 基本的程式能力 JSON資料格式 使用工具 Weasis或RadiAnt DICOM Viewer (查看DICOM用) Visual Studio Code (撰寫程式用)

此篇將帶大家了解基本的FHIR Resource content、Data Types並組出第一個Patient JSON。 必備知識 JSON FHIR Data Types Primite Types 是最基本的(而且只有 Primive Type 是首字小寫)，以程式來看就是常見的string、int、float這種型態 其餘Types，都是以所有Types複合組成的Type，以程式來看就像是Class、Interface、Object

每次在使用burni FHIR Server時，都會跳出以下Warnings。 原本都不以為意，因為程式都可以正常運作，不過每次跳這些 warnings 心都很躁，所以這次來正視此問題。 Circular Dependency 會出現 Circular Dependency 的問題，是因為 module 之間互相 require。 這裡舉一項例子: //Identifier.js const mongoose = require('mongoose');

所需知識 MongoDB Sharding基本知識，可以參考此篇MongoDB Sharding with Docker docker-compose.yaml撰寫 撰寫環境 OS Windows 10

如果不太了解HAPI-FHIR的資料庫結構的朋友可以看看上一篇HAPI-FHIR Database 轉置資料 (一) - Database結構。 此篇將用Typescript實作從HAPI FHIR資料庫轉置資料到另一個FHIR Server。 使用語言 Typescript 使用到的套件 axios (用於API操作)

:::danger 注意此篇只研究Postgres，且只跟轉資料有關 ::: 由於出現了必須從HAPI-FHIR轉到另一個FHIR Server，且是完全不相同的結構。 小弟認為直接讀取HAPI-FHIR的Database應該會比FHIR WEB API還來得快，所以研究了一下HAPI-FHIR轉置資料所需要使用到的Data Tables。 環境配置 docker hapi-fhir-jpaserver-starter