# 額外軟體 ## VDM ### 參考網站 VMD(Visual Molecular Dynamics)教程 [VMD(Visual Molecular Dynamics)教程(1)](https://zhuanlan.zhihu.com/p/101565900) [VMD(Visual Molecular Dynamics)教程(2)](https://zhuanlan.zhihu.com/p/102216008) 輸入檔案主要為pdb檔 lammps配合使用可使用dump檔 也可將pdb檔轉成lammps input data file ## packmol ### 下載 [packmol-20.010-1.el7.x86_64.rpm](https://centos.pkgs.org/7/epel-x86_64/packmol-20.010-1.el7.x86_64.rpm.html) ### 基本介紹 [PACKMOL](http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/userguide.shtml) ## moltemplate ### 下載 [moltemplate from github](https://github.com/jewettaij/moltemplate) download and run a example ->[Install Moltemplate| Moltemplate installation| Butane-CH3-CH2-CH2-CH3 -creation & relaxation example](https://www.youtube.com/watch?v=rBHyWjWVyaA) ## material studio [计算材料学-裡面有蠻多介紹](https://www.zhihu.com/column/jisuancailiao)