Cluster ToDo

General

• Upgrade ubuntu 2022
• Generar cluster
  • SGE
  • NIS
  • NFS
• ssh con doble autentifacion
• Implementar modulos con Lmod
• Cosas nvidia para las que tienen tarjeta. (drivers, nvtop)
• Timeshift (lo de los respaldos)

Software

• Software general (apt-get, apt)

  • ssh
  • sshfs
  • htop
  • Byobu
  • x2go (x2goclient x2goserver)
  • terminator, tillix
  • parallel
  • gnome-tweaks gnome-shell-extensions
  • tree
  • build-essential (gcc,g++,make)
  • curl
  • wget
  • gdebi-core (instalar debs)
  • (run autoremove)
  • flatpack?
  • shutter
  • xvfb (algo para el x-server)
  • apcupsd (para los que tienen ups)

• ubuntu-drivers

• Software general (deb-get)

  • R-studio (probablemente falta R base)
  • VScode
  • Git-kraken
  • Rclone
  • zotero
  • pandoc
  • Zoom
  • Chrome
  • Chromium? (en todo caso brave)
  • brave
  • bitwarden o keepassx ?
  • sejda ?
  • rocketchat desktop?
  • bat, lsd, duf, fd

• Software general (con Flatpacks, para software grande)

  • Inskape (aunque el repositorio de 22.04 está actualizado)

• Software neurostuff

  • mrtrix
  • fsl
  • fsleyes
  • freesurfer
  • DSI studio
  • ants
  • afni
  • microGL?
  • slicer ?
  • itk-SNAP ?
  • dsistudio?
  • fiji?
  • EEGLAB?

• Matlab 2022 original

  • Brainstorm
  • Limpiar el caos de librerias inaccesibles en el path de matlab

• Habilitar containers: Docker y singularity

  • Centralizar repositorio de containers?
  • fmriprep
  • qsiprep
  • neurodesk

• Conda centalizado compatible con conda local (RIP)

  • Brkraw
  • Dipy
  • Nilearn

• Idear una forma para usar software de conda mediante bashes y scripts

• Script para actualizar software en server. Debs y flatpacks

Otras cosas

• Ganglia
• Clean homes!
• HAcer una entrada en la wiki con todo el software disponible
• Actualizar la wiki con todo esto jeje
• Rhesus con vmWAre para maquina virtual de paravision
• Buscar mas neuro software de neurodesktop
• cinnamon-desktop-environment plasma-desktop budgie-desktop lxde gnome-session
• exa (o lsd), bat, fd
• Julia, rust (?)
• latex?
  • pdflatex

Sueño guajiro

• Separar repositorios del doc: uno para sysadmin y otro para procesamiento, abrir repo para procesamiento y documentarla
• La comunidad lanirem acutaliza la wiki y el repo abierto jeje
• Espejear la visualizacion del ganglia de cimat
• Hackaton Don Clusterio

Legacy debs

Packs

libeigen3-dev zlib1g-dev libqt4-opengl-dev libgl1-mesa-dev
libfftw3-dev libtiff5-dev
libqt5opengl5 libqt5opengl5-dev
libcanberra-gtk3-module libcanberra-gtk-module
libmng-dev
libgtkglext1
libssl-dev libcurl4-openssl-dev \

Apps

Themes

numix-blue-gtk-theme numix-gtk-theme numix-icon-theme
papirus-icon-theme
moka-icon-theme \ arc-theme

don clusterio pendientes

Cosas que quedaorn pendientes en la wiki del software don clusterio
| app_name | App description |
–-CLI apps
tmux
tcsh
build-essential
cmake

modulos (http://modules.sourceforge.net/)
latex