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Guia rápida export/import bruker

Export desde consola vieja

Hay dos tipos de objetos que podemos exportar

  • Dataset: Un estudio completo. Incluye instrucciones de escaneo y los datos. Si tu estudio a exportar es muy grande considera exportar el protocolo. Extension .PvDatasets
  • Protocol. Incluye una serie de instrucciones de escaneo. Si tu escaneo lo realizas seguido conviene esta opción. De esta forma ya sólo jalas tu protocolo de la lista de protocolos a tu estudio a realizar. Extension .PvProtocol

Nota 1: Todos los protocolos ya fueron exportados de la consola vieja a la nueva. Sin embargo fueron exportados en masa del usuario nmrsu. Ahora que cada laboratorio tiene su cuenta les recomendamos adminsitrar sus propios protocolos (borrar los que no necesiten).

Nota 2: Pueden tener ambos paravision abiertos para el procedimiento, pero ha sucedio un par de veces que hay conflicto de licencia. Si esto sucede requieren reiniciar la máquina y abrir los paravision por separado.

Exportar dataset (Consola vieja)

1.- Buscamos nuestro estudio a exportar en Dataset Browser. Click derecho y damos click en Select in explorer. Automaticamente deberia seleccionar este estudio en la pestaña Workspace explorer

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2.- Click derecho en el estudio seleccionado y click en Export to file

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3.- Esto abre la ventana para exportar archivos. Apretar el icono / para empezar a navegar. En esta ventana debemos navegar a /mnt/sesamo8/ImportExport .
Este es un folder especial que permite escribir y leer cosas desde ambas consolas.

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Aquí podemos guardar nuestro archivo a exportar. Puedes cambiar el nombre para ubicarlo mas pronto
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Crear y exportar protocol

1.- Buscamos nuestro estudio a exportar en Dataset Browser. Damos click en Exam y posteriormente click en Read Only

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Esto abre nuestro estudio como si fueramos a escanear (Aunque como es read only no podemos hacerlo).
2.- Seleccionamos los escaneos que nos interesa integrar en un protocolo. en la foto de ejemplo se seleccionaron todos. Click derecho en cualquiera y damos click en Store Scan Program

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3.- Elegimos nombre y que tipo de protocolo es (Object, Region, Applicacion). Note que la elección de que tipo de protocolo influye en donde lo vamos a guardar/encontrar.


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Este protocolo lo vamos a encontrar en en la pestaña Palette con la opcion de Scan programs & protocols (y navegando al tipo de protocolo con lo que lo guardamos anteriormente).
Nota: Desde este menu es donde lo pueden encontrar para arrastrar los escaneos a algun estudio que vayan a realizar con este protocolo.
4.- Click derecho y elegimos Export to file y seguimos las instrucciones descritas en la sección pasada para guardarlo en /mnt/sesamo8/ImportaExport

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Import en consola nueva

Para importar en la consola nueva navegamos al menu File->Import y elegimos la opccón Datasets o Protocols dependiendo de que vayamos a importar.

Navegamos de vuela al folder /mnt/sesamo8/ImportExport con el mismo procedimiento anteriormente descrito. Ahí deberiamos encontrar nuestro dataset/protocol. Click en ok.

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Si todo salió bien (y no se ha ido la luz) la consola nueva ya debería tener tu dataset/protocol listo para cque podamos seguir trabajando.

Y recuerda salir de tu usuario cada que terminemos de escanear :)

Nota: Vistos desde el cluster los datos de la nueva consola se graban en /misc/bruker7/data01/user/MyUserLab