* Présentation Marc & Jean-François ## VM Test Marc But : identifier l'installation qui sera diffusée en docker (plugin util/important pour les WF d'utilisation que l'on va proposer) (**TODO** JFG voir tickets https://gitlab.univ-nantes.fr/BiRD/iaas-recherche-suivit/-/issues/24 ) Déploiement avec docker-compose https://gitlab.univ-nantes.fr/BiRD/iaas-recherche-suivit/-/issues/16 Création en cours aujour'hui pour les tests pas de dockerisation, workflow après Procédure associée etc... Eric ratamero (bundle de data test) et omero transfert Inastallation a mano pour l'installation de test **TODO** (Guillaume) trouver le lien doc de Marc pour le moment: https://gitlab.in2p3.fr/fbi-data/ImageDataManagementSoftware/-/blob/main/Useful_links * defrief CZI grant depot collaborative project RFA Lien vers le dossier soumis: https://drive.google.com/file/d/1756kurHgxG3rDHIFlMzGsLgspgBYLex7/view?usp=sharing * OMERO download/ réponse rené-marc mège verbabatz https://forum.image.sc/t/download-option-disable-for-images-coming-from-screen/70770/2 https://forum.image.sc/t/batch-omero-export-in-native-format/71191 -> info sur le besoin de télécharger VS API de traitement -> omero dowload (Eric Ratamero ) https://omero-guides.readthedocs.io/en/latest/download/docs/download.html https://github.com/ome/omero-downloader https://github.com/sukunis/OMERO.openlink -> accès direct serveur? pour les cas intranet : datacentre régulation montage windows + droits d'accès. import in place et montage samba. Seafile dans la config de l'IJM (pour le import in place). Elle restent disponible un temps. Faire des use cases uploader et download data Je veux télécharger petites donnbées etc:: Voir aussi les vidéos de Frederic et Sophie https://univ-cotedazur.fr/mica/%EF%BB%BF%EF%BB%BF%EF%BB%BFomero/trucs-astuces **TODO** compléter le doc ou eb faire un nouveau Use case https://gitlab.in2p3.fr/fbi-data/ImageDataManagementSoftware/-/blob/main/Useful_links **TODO** Faire un site pour les biologistes **TODO** Marc: faire une synthèse du problème (en markdown) Guillaume: Mettre en place le workflow de publication **TODO** Guillaume FWD les mails RMM * Groupe de Travail Gestion des données et des métadonnées du RTmfm Ça c'est bien passé CR à venir (**TODO** Guillaume faire le lien vers le CR ) AAP atelier de la donnée https://recherche.data.gouv.fr/fr/actualite/recherche-data-gouv-lance-son-deuxieme-appel-a-manifestation-dinteret-ateliers-de-la-donnee-presentez-vos-projets IFB Mudis4ls centre de réference thématique ie fait le lien avec les infras nationales du type de données * meeting avec Josh update sur les prtojets en cours, conclusion sur un blog. * blog SIte web organisé mais dicussion sur image.Sc. TODO GUILLAUME lance sur omero-fbi.fr * point iRODS Mise en contact sur omero irods / Github meeting WG imaging IRODS? 15 septembre 16h ( apriori ok) question irods: a) gestion des droits? (via omero ou via meso pour calcul) b) transfert de données de catalogue (point de recherche/entrée unique) meme si 2 mleiux de stockage dif a tester avec fuse (JF et Guillaume) https://github.com/irods-contrib/irods_working_group_imaging * Sotiris & metrologie réunion * meeting tt le monde Faire un meeting pendant le annual meeting le 13 matin ou 14 matin. * meeting annuel FBI 13 et 14 décembre > **TODO** s'inscrire au meeting FBI sur https://france-bioimaging.org/announcement/fbi-annual-meeting-2022/ RAPPEL: CR ont été déplacés sur https://gitlab.in2p3.fr/fbi-data/coordination/-/wikis/home OPEN PRojhect en court de migration , on abandonne.