# 台灣鳥類性狀資料集 <br>A traits database of 454 bird species in Taiwan
狀態：持續更新中
最後更新：2024-11-07
編寫者：Meng-Chieh (孟婕) FENG (馮)
## 說明
* 此檔案為推廣「台灣鳥類性狀資料集 (A traits database of 454 bird species in Taiwan) 」而建置，提供資料集、方法、欄位、相關資訊的中文說明和連結
* 資料論文已於 2024-10-03 發表於 *Scientific Data*: [Combining citizen science data and literature to build a traits dataset of Taiwan’s birds](https://www.nature.com/articles/s41597-024-03928-3?utm_source=rct_congratemailt&utm_medium=email&utm_campaign=oa_20241003&utm_content=10.1038/s41597-024-03928-3#Ack1)
* 此檔案為筆者自主發起建置，實際資料狀態請以 [A traits database of 454 bird species in Taiwan](https://www.gbif.org/zh-tw/dataset/02f3b527-d309-43ee-b964-9713a9ddcd6a) 最新版本與說明為主
* 以下呈現的表格，是為了示意資料內容而重新編排的格式，非原始資料狀態（詳見[資料集下載與轉換](##資料集下載與轉換)）
## 資料集說明
台灣鳥類性狀資料集 ([A traits database of 454 bird species in Taiwan](https://www.gbif.org/zh-tw/dataset/02f3b527-d309-43ee-b964-9713a9ddcd6a)) 彙整了來自學術文獻、博物館標本、繫放資料庫、專家意見、公民科學與社群平台等資料，建置了涵蓋 73 科 454 種、包含留鳥及各類候鳥的台灣鳥類性狀資料集。
性狀 (trait) 為影響生物生存表現的特徵，能一定程度地反映生物與環境的相互作用、生態系統的形成過程，以及可能的生態系服務，是生物多樣性的重要組成部分。本資料集彙整之性狀數據包含留遷狀態 (Migratory status) 、形態特徵 (Morphology) 、覓食生態 (Foraging) 、棲地與海拔分布 (Habitat and elevation distribution) 、領域行為 (Territoriality) 、繁殖特性 (Breeding characteristics) 及生態系調節服務 (Regulating eosystem services) 等 7 個面向。預期可應用於功能多樣性、以性狀為基礎的群聚生態學、生態系功能等領域，並作為保育決策的參考。
本資料集發布於全球生物多樣性資訊機構 [GBIF (Global Biodiversity Information Facility) ](https://www.gbif.org/zh-tw/)。GBIF 使用[資料標準 (data standards)](https://www.gbif.org/zh-tw/standards) 統一並標準化資料的描述、格式及交流方式，使龐雜、巨量且多來源的生物多樣性資料得以一致的方式被分享與利用。本資料集欄位名稱參照 GBIF 資料標準的[達爾文核心集辭彙 (Darwin Core Terms) ](https://gcube.wiki.gcube-system.org/gcube/Darwin_Core_Terms) ，呈現在下方各示意表格欄位名稱中。
## 資料來源與方法
本資料集地理範圍涵蓋台灣本島、金門、馬祖、澎湖、蘭嶼、綠島、小琉球、東沙島，及南沙群島；鳥類物種包含 454 種地理範圍內鳥種（排除遠洋性海鳥與迷鳥）；性狀資料考量了 7 個鳥類生態的面向，包含定性 (qualitative) 、定量 (quantitative) 及二元 (binary) 資料共 115 項性狀。
本資料集鳥類學名、英文俗名與系統分類參照 [eBird Clements Checklist of Birds of the World Version 2023](https://www.birds.cornell.edu/clementschecklist/introduction/updateindex/october-2023/download/) 並符合 [GBIF Backbone Taxonomy](https://www.gbif.org/dataset/d7dddbf4-2cf0-4f39-9b2a-bb099caae36c)。
### 1. 留遷狀態 (Migratory status) (6)
鳥類留遷狀態分為留鳥 (resident) 、冬候鳥 (winter visitor) 、夏候鳥 (summer visitor) 、過境鳥 (transient migrant) 、迷鳥 (vagrant) 與引進種 (introduced species) 共 6 項，以二元資料表示。一種鳥可能符合多種留遷狀態。
| id | scientificName | vernacularName | measurementType | measurementValue |
|-|-|-|-|-|
| 3df5dd03-b9d7-4544-a677-97770e4f93a3 | Hirundo rustica | Barn Swallow|家燕 | Resident | 0 |
| 3df5dd03-b9d7-4544-a677-97770e4f93a3 | Hirundo rustica | Barn Swallow|家燕 | Transient | 1 |
| 3df5dd03-b9d7-4544-a677-97770e4f93a3 | Hirundo rustica | Barn Swallow|家燕 | Winter | 1 |
| 3df5dd03-b9d7-4544-a677-97770e4f93a3 | Hirundo rustica | Barn Swallow|家燕 | Summer | 1 |
| 3df5dd03-b9d7-4544-a677-97770e4f93a3 | Hirundo rustica | Barn Swallow|家燕 | Vagrant | 0 |
| 3df5dd03-b9d7-4544-a677-97770e4f93a3 | Hirundo rustica | Barn Swallow|家燕 | Introduced | 0 |
鳥類中文俗名與留遷狀態參照[中華鳥會2023年台灣鳥類名錄](https://www.bird.org.tw/basicpage/87)。
### 2. 形態特徵 (Morphology) (9)
鳥類的形態性狀 (morphological traits) 包含體長 (body length) 、嘴長 (bill length) 、頭長 (head length) 、翼長 (natural wing length) 、尾長 (tail length) 、跗蹠長 (tarsus length) 與重量 (weight) 等 7 項形質，以及雌雄體型二型性 (sexual size dimorphism) 與雌雄羽色二型性 (plumage dimorphism) 2 項二型性性狀。形質資料為數值資料；二型性資料為二元資料。
| id | scientificName | vernacularName | measurementType | measurementValue | measurementUnit | measurementDeterminedBy | measurementRemarks |
|-|-|-|-|-|-|-|-|
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Weight | 22.5 | g | Shiu et al. | 258 |
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Winglength | 73.6 | mm | Tsai et al. | - |
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Bodylength | 141 | mm | Tsai et al. | |
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Billlength | 11.9 | mm | Shiu et al. | 216 |
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Tarsuslength | 22.2 | mm | Shiu et al. | 257 |
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Headlength | 31 | mm | Tsai et al. | - |
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Taillength | 63.9 | mm | Tsai et al. | - |
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Dimorphism_Size | 0 | | | |
| 7317bb76-7d64-4524-b941-fd5f1dab61ad | Carpodacus formosanus | Taiwan Rosefinch|臺灣朱雀 | Dimorphism_Plumage | 1 | | | |
形質資料以在台灣地區紀錄、測量或發表的數據優先採納，來源包含已發表文獻 ([Shiu et al., 2005](https://www.researchgate.net/profile/Ruey-Shing-Lin/publication/241138718_Morphological_Characters_of_Bird_Species_in_Taiwan/links/5451a9e30cf24884d8870839/Morphological-Characters-of-Bird-Species-in-Taiwan.pdf); [Tsai et al., 2020](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7250946/); [臺灣野鳥手繪圖鑑](https://www.wbst.org.tw/news/366)) 、線上資料庫（[台灣鳥類繫放資訊網](https://www.birdband.org/)與 [MAPS Taiwan](https://maps.birdband.org/)）與博物館鳥類標本典藏，並以 [AVONET 資料集](https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ele.13898)補足仍空缺的鳥種資料（大多是台灣鮮有記錄的鳥種）。體長以《臺灣野鳥手繪圖鑑》中最大值和最小值的平均值計算。（`measurementDeterminedBy`為資料來源）
在排除幼鳥與異常值數據後，共匯集了 16465 筆測量數據，涵蓋了 67 科 330 種鳥（記錄中 63.3％ 資料量來自 26 種個體數為 165 以上的鳥種），大部分的數據 (n = 14712) 來自 1988 至 2021 年間的繫放資料，其餘數據 (n = 1753) 來自博物館橫跨 1905 至 2023 年的標本測量資料。（`measurementRemarks`註記測量個體的資料筆數）
體型二型性依據重量、自然翼長、尾長與喙長等形態特徵判定，只要其中一項的數據在公母鳥間具有明顯差異（通常在 8％ 至 30％ 之間），則視該鳥種具有雌雄體型二型性；羽色二型性的依據是成鳥羽毛顏色、斑紋或形狀具有公母差異者，若差異達整體 1/3 以上，或具明顯且與性擇相關之羽區（如野鴝喉部），則視該鳥種具有雌雄羽色二型性。
### 3. 覓食生態 (Foraging) (45)
鳥類的覓食性狀包含食性 (diet) 、覓食棲位 (foraging stratum) 、覓食行為 (foraging behavior) 、活動時間 (diel activity) 與群聚覓食 (foraging flocks) 等 5 個面向，共 45 項性狀。前三項資料以百分比呈現；後兩項為二元資料。食性、覓食棲位類別以 [EltonTraits](https://esajournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1890/13-1917.1) 為基礎，再進行細分，共列出 17 類食性種類、10 類覓食棲位；並定義 13 項覓食行為描述鳥類多樣的取食技巧。（下表未呈現`measurementValue`百分比為0之食性）
| id | scientificName | vernacularName | measurementType | measurementValue | measurementUnit | measurementRemarks |
|-|-|-|-|-|-|-|
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Behavior_Glean | 90 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Behavior_Flycatch | 10 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Diet_Hexapod | 35 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Diet_Fruit | 50 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Diet_Nect | 5 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Diet_Seed | 10 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | ForStrat_Understory | 30 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | ForStrat_MidLayer | 30 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | ForStrat_Canopy | 30 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | ForStrat_Aerial | 10 | % | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | ActivityTime_Diurnal | 1 | | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | ActivityTime_Nocturnal | 0 | | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Flocks_ConspecificsBreedingSeason | 0 | | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Flocks_ConspecificsNonBreedingSeason | 1 | | |
| dce89fcb-89a2-4119-a145-506b9c53d477 | Alcippe morrisonia | Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | Flocks_Mixed.speciesNonBreedingSeason | 1 | | Cyanoderma ruficeps|Erpornis zantholeuca |
（下表呈現轉換為性狀矩陣 (traits matrix) 的資料）
| vernacularName | Behavior_Sally | Behavior_Glean | Behavior_Sweep | Behavior_Sticky | Behavior_Peck | Behavior_Suck | Behavior_Filter | Behavior_Dive | Behavior_Flycatch | Behavior_Stab | Behavior_SkyToWater | Behavior_Probe | Behavior_Fly | Diet_Plankton | Diet_Annelid | Diet_Mollus | Diet_Hexapod | Diet_Crustacean | Diet_Multipod | Diet_Spider | Diet_Mammal | Diet_Bird | Diet_Reptiles | Diet_Amphibian | Diet_Fish | Diet_CarrionTrash | Diet_Fruit | Diet_Nect | Diet_Seed | Diet_Leaf | ForStrat_WatBelowDeep | ForStrat_WatBelowShallow | ForStrat_Watsurf | ForStrat_Mud | ForStrat_Ground | ForStrat_Understory | ForStrat_MidLayer | ForStrat_Canopy | ForStrat_Aerial | ForStrat_Trunk | ActivityTime_Diurnal | ActivityTime_Nocturnal | Flocks_ConspecificsBreedingSeason | Flocks_ConspecificsNonBreedingSeason | Flocks_Mixed.speciesNonBreedingSeason |
|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|
| Morrison's Fulvetta|繡眼畫眉 | 0 | 90 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 10 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 35 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 50 | 5 | 10 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 30 | 30 | 30 | 10 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 |
食性、覓食棲位與覓食行為的資料來源包含學術文獻、碩博士論文、專家意見，及網路上的公民科學觀察記錄。後者主要來自臉書社團[鳥類食性](https://www.facebook.com/groups/1426365227395803)與[鳥類的羽毛與攝食](https://www.facebook.com/groups/587604787998175)，為確保數據的準確性，由研究員搜尋各物種覓食紀錄，確認照片內容與文字描述，並排除相同觀察者在同一日期的重複紀錄。
活動時間參考[鳥類誌 (The Avifauna of Taiwan) ](https://conservation.forest.gov.tw/0001888)等文獻及 [Birds of the World](https://birdsoftheworld.org/bow/home) 線上資料庫，分為白天（包括黃昏）和夜間，一些鳥種可能同時具有日行與夜行習性。
群聚覓食參考相關文獻，依據季節與組成鳥種分為三類：1.繁殖季單一鳥種群聚覓食；2.非繁殖季單一鳥種群聚覓食；3.非繁殖季不同鳥種混群覓食。（並於`measurementRemarks`註記了共同混群覓食的其他鳥種）
### 4. 棲地與海拔分布 (Habitat and elevation distribution) (26)
棲地類別以 [IUCN Red List Habitat Classification Scheme](https://www.iucnredlist.org/resources/habitat-classification-scheme) 的建議為基礎，列出 22 類台灣鳥類棲息的環境；海拔則分為 0-100 m 平地 (plains) 、100-500 m 低海拔 (low elevation) 、500-2500 m 中海拔 (mid elevation) 、2500-3952 m高海拔 (high elevation) 4 類。棲地與海拔分布參考每個物種在 [eBird](https://ebird.org/home) 觀察清單的分布位置與[鳥類誌 (The Avifauna of Taiwan) ](https://conservation.forest.gov.tw/0001888)，定義為出現與否的二元資料。（下表未呈現`measurementValue`為 0 之棲地類別）
| id | scientificName | vernacularName | measurementType | measurementValue |
|-|-|-|-|-|
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Habitat_Forest | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Habitat_ForestEdge | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Habitat_Shrubland | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Habitat_DrylandFarming | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Habitat_UrbanParks | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Habitat_UrbanRuralArea | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Habitat_PaddyField | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Elevation_Plain | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Elevation_Low | 1 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul|烏頭翁 | Elevation_Middle | 0 |
| dcba0fb2-9d90-4bcf-adda-7ecc4676f725 | Pycnonotus taivanus | Styan's Bulbul烏頭翁 | Elevation_High | 0 |
（下表呈現烏頭翁與黑面琵鷺轉換為性狀矩陣 (traits matrix) 的資料）
| vernacularName | Habitat_Forest | Habitat_ForestEdge | Habitat_Shrubland | Habitat_Shortgrass | Habitat_Tallgrass | Habitat_MiddleUpperOfStream | Habitat_PermanentInlandDeltas | Habitat_FreshwaterLakesPools | Habitat_TallEmergentMarshes | Habitat_LowEmergentMarshes | Habitat_RockyArea | Habitat_SubtidalRockRockyReefs | Habitat_Pelagic | Habitat_RockyShoreline | Habitat_SandyPebbleShorelineBeaches | Habitat\_Mud\_shoreline\_intertidal\_mudflats | Habitat_DrylandFarming | Habitat_UrbanParks | Habitat_UrbanRuralArea | Habitat_AquaculturePonds | Habitat_SaltExploitationSites | Habitat_PaddyField | Elevation_Plain | Elevation_Low | Elevation_Middle | Elevation_High |
|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|
| Styan's Bulbul|烏頭翁 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| Platalea minor|黑面琵鷺 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
### 5. 領域性 (Territoriality) (2)
領域性的表現與強度在繁殖季 (breeding season) 和非繁殖季 (non-breeding season) 可能不同。本資料集針對203種在台灣繁殖的留鳥與夏候鳥，將領域性分為 4 種類型：1.A型 (Type A) 鳥類建立並保衛領域直到後代獨立，保衛的資源包含巢位、配偶關係和覓食區域；2.B型 (Type B) 鳥類主要保衛巢位和配偶關係，但不會保衛持覓食區域；3.C型 (Type C) 鳥類主要保衛巢位和小範圍周圍區域，通常是群居性鳥類；4.D型 (Type D) 鳥類保衛領域是出於性擇或食物資源（而非育雛），如杜鵑。繁殖季的領域性為上述四種類別資料；非繁殖季的領域性為二元資料（有或無）。
| id | scientificName | vernacularName | measurementType | measurementValue | measurementRemarks |
|-|-|-|-|-|-|
| 8b3e3b4c-bf50-4a4a-9d3f-6fe707ee4599 | Arborophila crudigularis | Taiwan Partridge|臺灣山鷓鴣 | Territoriality_BreedingSeason | 1 | Type A |
| ec640ebf-5fbc-4853-9ab0-25fd48a8e7f1 | Aix galericulata | Mandarin Duck|鴛鴦 | Territoriality_BreedingSeason | 2 | Type B |
| be1d6155-425c-425b-94fa-40d340dbcef4 | Apus nipalensis | House Swift|小雨燕 | Territoriality_BreedingSeason | 3 | Type C |
| dd50c6d7-06b8-477c-8f5c-958009ad4e4e | Eudynamys scolopaceus | Asian Koel|噪鵑 | Territoriality_BreedingSeason | 4 | Type D |
| 8d914fe0-634f-4ca8-b912-e834133fdaf7 | Motacilla cinerea | Gray Wagtail|灰鶺鴒 | Territoriality_NonBreedingSeason | 1 | |
| 3c15c73c-3cd3-4008-90b7-dc8a72d15eb1 | Motacilla tschutschensis | Eastern Yellow Wagtail|東方黃鶺鴒 | Territoriality_NonBreedingSeason | 0 | |
### 6. 繁殖特性 (Breeding characteristics) (23)
鳥類的繁殖性狀包含托卵寄生 (brood parasitism) 、群聚繁殖 (colonial breeding) 、巢位 (nest site) 、巢型 (nest type) 與平均窩卵數 (mean clutch size)。前四項為二元資料，平均窩卵數為數值資料。（下表未呈現`measurementValue`為 0 之巢位與巢型類別）
| id | scientificName | vernacularName | measurementType | measurementValue |
|-|-|-|-|-|
| 69ab606f-45e7-44d2-8bb7-b9414530cdb8 | Yuhina brunneiceps | Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | BroodParasites | 0 |
| 69ab606f-45e7-44d2-8bb7-b9414530cdb8 | Yuhina brunneiceps | Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | ColonialBreeding | 0 |
| 69ab606f-45e7-44d2-8bb7-b9414530cdb8 | Yuhina brunneiceps | Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | Nestsite_WithinFoliages | 1 |
| 69ab606f-45e7-44d2-8bb7-b9414530cdb8 | Yuhina brunneiceps | Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | Nestsite_EpiphytesAroundTrunk | 1 |
| 69ab606f-45e7-44d2-8bb7-b9414530cdb8 | Yuhina brunneiceps | Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | Nestsite_Shrubs | 1 |
| 69ab606f-45e7-44d2-8bb7-b9414530cdb8 | Yuhina brunneiceps | Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | Nestsite_ThickTallgrass | 1 |
| 69ab606f-45e7-44d2-8bb7-b9414530cdb8 | Yuhina brunneiceps | Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | Neststructure_Cup | 1 |
| 69ab606f-45e7-44d2-8bb7-b9414530cdb8 | Yuhina brunneiceps | Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | ClutchSizeMean | 6 |
（下表呈現轉換為性狀矩陣 (traits matrix) 的資料）
| vernacularName | BroodParasites | ColonialBreeding | NestsiteCliffBanks | Nestsite_WithinFoliages | Nestsite_OnBranches | Nestsite_InCavity | Nestsite_EpiphytesAroundTrunk | Nestsite_Shrubs | Nestsite_SoilSlopeWithVegetation | Nestsite_SoilSlopeWithoutVegetation | Nestsite_ThickTallgrass | Nestsite_Ground | Nestsite_OnWaterbody | Nestsite_ArtificialStructures | Neststructure_Scrape | Neststructure_Platform | Neststructure_Cup | Neststructure_Dome | Neststructure_Bag | Neststructure_DomeWithTunnel | Neststructure_PrimaryCavity | Neststructure_SecondaryCavity | ClutchSizeMean |
|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|
| Taiwan Yuhina|冠羽畫眉 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 6 |
繁殖性狀資料來源為相關學術文獻。托卵寄生指鳥類將卵下在其他鳥種的巢中，子代從宿主上獲得資源；集體營巢指一鳥種由許多個體建立共同繁殖領域，領域內除了巢位之外無其他資源。
### 7. 生態系調節服務 (Ecosystem services) (4)
鳥類所能提供的生態系調節服務包含授粉 (pollination) 、散播種子 (seed dispersal) 、昆蟲控制 (insect control) 與捕食外來種 (consumption of invasive species) 。皆以二元資料表示。
| id | scientificName | vernacularName | measurementType | measurementValue | measurementRemarks |
|-|-|-|-|-|-|
| d3aae8dc-a14f-4506-8a0b-49a07215cb6a | Zosterops simplex | Swinhoe's White-eye|斯氏繡眼 | EcosystemServices_Pollination | 1 | |
| d3aae8dc-a14f-4506-8a0b-49a07215cb6a | Zosterops simplex | Swinhoe's White-eye|斯氏繡眼 | EcosystemServices_SeedDispersal | 1 | |
| d3aae8dc-a14f-4506-8a0b-49a07215cb6a | Zosterops simplex | Swinhoe's White-eye|斯氏繡眼 | EcosystemServices_InsectControl | 1 | |
| d3aae8dc-a14f-4506-8a0b-49a07215cb6a | Zosterops simplex | Swinhoe's White-eye|斯氏繡眼 | EcosystemServices_RegulationInvasiveSpecies | 1 | Tessaratoma papillosa |
授粉、散播種子與昆蟲控制參照食性性狀類別中的花蜜及花粉 (Nectar) 、果實 (Fruit) 與六足類 (Hexapod) 資料，若鳥類食性有超過 25% 來自於上述三類，則歸類於對應的生態系調節服務者。捕食外來種的資料包含學術文獻與網路觀察資訊，共記錄了台灣原生鳥類捕食 15 種外來物種的紀錄，包括 5 種魚類、3 種鳥類、2 種兩棲類、2 種腹足類、1 種甲殼類和 1 種昆蟲。（`measurementRemarks`註記了捕食之外來種學名）
## 資料集總覽
<table>
<tr>
<th colspan="2">性狀類別 Trait category</th>
<th>性狀 Traits（<code>measurementType</code>欄位中顯示之名稱）</th>
<th>資料形態 Data type</th>
</tr>
<tr>
<td colspan="2">留遷狀態<br>Migratory status (6)</td>
<td><code>Resident</code>留鳥 <code>Winter</code>冬候鳥 <code>Summer</code>夏候鳥 <code>Transient</code>過境鳥 <code>Vagrant</code>迷鳥 <code>Introduced</code>引入種
</td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td rowspan="5">覓食生態<br>Foraging (45)</td>
<td>食性<br>Diet (17)</td>
<td><code>Diet_Plankton</code>浮游生物 <code>Diet_Annelid</code>環節動物 <code>Diet_Mollus</code>軟體動物 <code>Diet_Hexapod</code>六足類 <code>Diet_Crustacean</code>甲殼類 <code>Diet_Multipod</code>多足類 <code>Diet_Spider</code>螯肢類 <code>Diet_Mammal</code>哺乳動物 <code>Diet_Bird</code>鳥類 <code>Diet_Reptiles</code>爬蟲類 <code>Diet_Amphibian</code>兩棲類 <code>Diet_Fish</code>魚類 <code>Diet_CarrionTrash</code>腐食及垃圾 <code>Diet_Fruit</code>果實 <code>Diet_Nect</code>花蜜及花粉 <code>Diet_Seed</code>種子 <code>Diet_Leaf</code>葉及其他植物部位 </td>
<td>百分比資料（各項加總為100）
<br>Proportional values, with a total of 17 categories adding up to 100.</td>
</tr>
<tr>
<td>覓食棲位<br>Foraging stratum (10)</td>
<td><code>ForStrat_WatBelowDeep</code>深水下 <code>ForStrat_WatBelowShallow</code>淺水下 <code>ForStrat_Watsurf</code>水表 <code>ForStrat_Mud</code>泥灘 <code>ForStrat_Ground</code>地表 <code>ForStrat_Understory</code>草本/灌叢 <code>ForStrat_MidLayer</code>樹木中層 <code>ForStrat_Canopy</code>樹冠層 <code>ForStrat_Trunk</code>樹幹 <code>ForStrat_Aerial</code>空中 </td>
<td>百分比資料（各項加總為100）
<br>Proportional values, with a total of 17 categories adding up to 100.</td>
</tr>
<tr>
<td>覓食行為<br>Foraging behavior (13)</td>
<td><code>Behavior_Sally</code>撲攫 <code>Behavior_Glean</code>覓啄/啄食 <code>Behavior_Sweep</code>掃 <code>Behavior_Sticky</code>黏食 <code>Behavior_Peck</code>啄木 <code>Behavior_Suck</code>吸食 <code>Behavior_Filter</code>濾食 <code>Behavior_Dive</code>潛水 <code>Behavior_Flycatch</code>飛擊 <code>Behavior_Stab</code>刺擊 <code>Behavior_SkyToWater</code>撈 <code>Behavior_Probe</code>探測 <code>Behavior_Fly</code>飛行中捕食 </td>
<td>百分比資料（各項加總為100）
<br>Proportional values, with a total of 17 categories adding up to 100.</td>
</tr>
<tr>
<td>覓食活動<br>Diel activity (2)</td>
<td><code>ActivityTime_Diurnal</code>日行性 <br><code>ActivityTime_Nocturnal</code>夜行性 </td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td>群聚覓食<br>Foraging flocks (3)</td>
<td><code>Flocks_ConspecificsBreedingSeason</code>繁殖季單一鳥種群聚覓食 <code>Flocks_ConspecificsNonBreedingSeason</code>非繁殖季一鳥種群聚覓食 <code>Flocks_Mixed.speciesNonBreedingSeason</code>非繁殖季不同鳥種混群覓食 <br>（<code>measurementRemarks</code>註記了共同混群覓食的其他鳥種）
</td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td rowspan="2">形態特徵 <br>Morphology (9)</td>
<td>形態性狀（形質）<br>Morphological characteristics (7)</td>
<td><code>Weight</code>重量 <code>Winglength</code>翼長 <code>Bodylength</code>體長 <code>Billlength</code>嘴長 <code>Tarsuslength</code>跗蹠長 <code>Headlength</code>頭長 <code>Taillength</code>尾長 </td>
<td>數值資料<br>Continuous</td>
</tr>
<tr>
<td>雌雄二型性<br>Sexual dimorphism (2)</td>
<td><code>Dimorphism_Size</code>雌雄體型二型性 <code>Dimorphism_Plumage</code>雌雄羽色二型性 </td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td rowspan="2">棲地與海拔分布<br>Habitat and elevation distribution (26)</td>
<td>棲地<br>Habitat (22)</td>
<td><code>Habitat_Forest</code>森林 <code>Habitat_ForestEdge</code>林緣 <code>Habitat_Shrubland</code>灌叢 <code>Habitat_Shortgrass</code>短草叢 <code>Habitat_Tallgrass</code>高草叢 <code>Habitat_MiddleUpperOfStream</code>溪流中上游 <code>Habitat_PermanentInlandDeltas</code>溪流下游 <code>Habitat_FreshwaterLakesPools</code>湖泊池塘 <code>Habitat_TallEmergentMarshes</code>高草澤 <code>Habitat_LowEmergentMarshes</code>短草澤 <code>Habitat_RockyArea</code>岩石區 <code>Habitat_SubtidalRockRockyReefs</code>礁岩 <code>Habitat_Pelagic</code>遠洋 <code>Habitat_RockyShoreline</code>岩岸 <code>Habitat_SandyPebbleShorelineBeaches</code>砂礫海岸 <code>Habitat_Mud_shoreline_intertidal_mudflats</code>泥灘潮間帶 <code>Habitat_DrylandFarming</code>旱田 <code>Habitat_UrbanParks</code>都會公園 <code>Habitat_UrbanRuralArea</code>都會/郊區 <code>Habitat_AquaculturePonds</code>魚塭 <code>Habitat_SaltExploitationSites</code>鹽田 <code>Habitat_PaddyField</code>水田 </td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td>海拔分布<br>Elevation (4)</td>
<td><code>Elevation_Plain</code>平地 (0~100m)<br> <code>Elevation_Low</code>低海拔 (100~500m)<br><code>Elevation_Middle</code>中海拔 (500~2,500m)<br> <code>Elevation_High</code>高海拔 (2,500~3,952m) </td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
<tr>
<td colspan="2">領域性<br>Territoriality (2)</td>
<td><code>Territoriality_BreedingSeason</code>繁殖季領域性 <br>（繁殖季領域性分為ABCD四型，詳見前文說明）<br><code>Territoriality_NonBreedingSeason</code>非繁殖季領域性 </td>
<td>繁殖季為類別資料；非繁殖季為二元資料<br>
Categorical/Binary</td>
</tr>
<tr>
<td rowspan="5">繁殖特性<br>Breeding characteristics (23)</td>
<td>托卵寄生<br>Brood parasitism (1)</td>
<td><code>BroodParasites</code>托卵寄生 </td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td>群聚繁殖<br>Colonial breeding (1)</td>
<td><code>ColonialBreeding</code>群聚繁殖 </td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td>巢位<br>Nest site (12)</td>
<td><code>Nestsite_CliffBanks</code>懸涯/石壁 <code>Nestsite_WithinFoliages</code>樹葉 <code>Nestsite_OnBranches</code>枝條 <code>Nestsite_InCavity</code>樹洞 <code>Nestsite_EpiphytesAroundTrunk</code>樹幹附生植物 <code>Nestsite_Shrubs</code>灌叢 <code>Nestsite_SoilSlopeWithVegetation</code>植被邊坡 <code>Nestsite_SoilSlopeWithoutVegetation</code>裸露土坡 <code>Nestsite_ThickTallgrass</code>濃密高草叢 <code>Nestsite_Ground</code>地面 <code>Nestsite_OnWaterbody</code>水體 <code>Nestsite_ArtificialStructures</code>人造物 </td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td>巢型<br>Nest type (8)</td>
<td><code>Neststructure_Scrape</code>淺坑 <code>Neststructure_Platform</code>圓盤 <code>Neststructure_Cup</code>杯狀 <code>Neststructure_Dome</code>圓頂 <code>Neststructure_Bag</code>袋狀 <code>Neststructure_DomeWithTunnel</code>有通道的巢室 <code>Neststructure_PrimaryCavity</code>原生巢洞 <code>Neststructure_SecondaryCavity</code>次級巢洞 </td>
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
<tr>
<td>平均窩卵數<br>Mean clutch size (1)</td>
<td><code>ClutchSizeMean</code>平均窩卵數 </td>
<td>數值資料<br>Continuous</td>
</tr>
<tr>
<td colspan="2">生態系調節服務<br>Regulating ecosystem services (4)</td>
<td><code>EcosystemServices_Pollination</code>授粉 <code>EcosystemServices_SeedDispersal</code>散播種子 <code>EcosystemServices_InsectControl</code>害蟲控制 <code>EcosystemServices_RegulationInvasiveSpecies</code>捕食外來種 <br>（<code>measurementRemarks</code>註記了捕食之外來種學名）
<td>二元資料<br>Binary</td>
</tr>
</table>
## 引用
[資料集／資料數據引用（請使用下載時資料版本的引用連結）](https://www.gbif.org/zh-tw/dataset/02f3b527-d309-43ee-b964-9713a9ddcd6a#citation)
資料論文引用：
>Fu, S. W., Feng, M. C., Chi, P. W., & Ding, T. S. (2024). Combining citizen science data and literature to build a traits dataset of Taiwan’s birds. Scientific Data, 11(1), 1076.
## 資料集下載與轉換
GBIF 支援四種[資料集類別](https://www.gbif.org/zh-tw/dataset-classes)，台灣鳥類性狀資料集為[物種名錄資料 (checklist data) ](https://www.gbif.org/zh-tw/data-quality-requirements-checklists)，以名錄資料為核心資料 (core)，性狀資料為延伸資料 (extension)，兩者內容由`id`欄位連接（GBIF 資料標準之細節請參閱[達爾文核心集 Darwin Core (DwC)](https://www.gbif.org/darwin-core)）。
從 [A traits database of 454 bird species in Taiwan](https://www.gbif.org/zh-tw/dataset/02f3b527-d309-43ee-b964-9713a9ddcd6a) 頁面中下載資料並解壓縮後會得到五個檔案：
* meta.xml 和 eml.xml 是資料集的詮釋資料／總體描述，紀錄資料集的提供者、發布日期、描述等等，讓使用者能快速瀏覽資料集的內容與來源
* taxon.txt 是這份資料集的物種名錄，即核心資料 (core)
* measurementorfacts.txt 是性狀資料，屬於延伸資料 (extension)
* extendedmeasurementorfact.txt 是計算形質資料所使用的繫放與鳥類標本個體數據，亦屬於延伸資料 (extension)，本說明暫不討論此項
### 使用 Excel 匯入資料檢視
為使資料便於檢視與整理，可先將下載的.txt文字檔匯入一個新建的 excel 資料表中：
1. 新建一個.xlsx檔，開兩個分頁（分別匯入 taxon.txt 和 measurementorfacts.txt，以下步驟相同）
2. 點選：資料 (Data) ＞從文字檔 (From Text) ＞選取下載的.txt檔案
3. 在匯入字串 (Text Import Wizard) 步驟中，檔案原始格式 (File origin) 請選 **65001: Unicode (UTF-8)** 以免中文俗名亂碼（選單拉到最下方再往上滑幾行可找到），然後連續點下一步至完成，選取表格第一欄 (A1) 即匯入完成
資料中的`id`欄位使用的是[通用唯一辨識碼 (UUID) ](https://zh.wikipedia.org/zh-tw/%E9%80%9A%E7%94%A8%E5%94%AF%E4%B8%80%E8%AF%86%E5%88%AB%E7%A0%81)，每一個`id`對應一鳥種
### 使用 R 載入線上資料、轉換為性狀矩陣
（待補）
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