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title: Aula MNRJ - bases de dados em biodiversidade - 21 de outubro 2021
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tags: liibre
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# Aula MNRJ - bases de dados em biodiversidade - 21 de outubro 2021


Andrea Sánchez-Tapia

## Sumário
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## Antes da aula
  

### Instruções de instalação

Antes da aula, por favor instale R e RStudio. R é a linguagem de análise estatística e a plataforma "original" para executar ela, e RStudio é uma interface gráfica, ou seja um programa que consegue executar R. RStudio tem várias funções que facilitam o uso de R, mas não é a única opção. 

#### Download e instalação de R

Acesse: https://cran.r-project.org/index.html e siga o link dependendo de seu sistema operativo (windows, mac, linux)
  - Se você está em um computador com Windows faça download deste arquivo: <https://cran.r-project.org/bin/windows/base/release.htm>. Siga as instruções padrão de instalação. 
  - Em um Mac faça download deste arquivo: <https://cran.r-project.org/bin/macosx/R-latest.pkg>. Siga as instruções padrão de instalação. 
  - Em Linux faça download dos arquivos binários <https://cran.r-project.org/index.html> ou execute `sudo apt-get install r-base` em um sistema Debian/Ubuntu.

#### Download e instalação de RStudio

Faça download e instale RStudio desde <https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download>. Busque a versão mais adequada para seu sistema operativo (Windows, Mac ou Linux).

#### Para abrir o R abra o RStudio (não o R)

Clique no atalho do programa para checar a instalação
A janela de RStudio deve ser similar a esta:

<img src="https://raw.githubusercontent.com/datacarpentry/R-ecology-lesson/main/img/rstudio-screenshot.png" width="1280" />


Se tiver qualquer dúvida, entre em contato :slightly_smiling_face: 
<andreasancheztapia@gmail.com>


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## Durante a aula

### Aula teórica 

A aula teórica está aqui: https://www.youtube.com/watch?v=DGL0Yi4COms 

### Slides

Os slides da aula teórica se encontram aqui: https://liibre.gitlab.io/aula_mnrj/#1 - vocês podem acompanhar a aula, os links estão aí

Se tiverem qualquer pergunta fiquem à vontade
Quais bases de dados vocês usam para os grupos de interesse


### Se você não conseguiu instalar tem uma opção adicional, pode me perguntar :) <!--https://rstudio.cloud/project/3077450-->

### Uma introdução simples a R

The Carpentries https://datacarpentry.org/R-ecology-lesson/

### O script da parte prática


A gente criou um pad de notas colaborativas/script de teste para todo mundo ter acesso ao mesmo script durante a aula: https://hackmd.io/@andreasancheztapia/script_MNRJ/edit

Isto está sujo, incompleto e sem comentar! A boa prática é ajeitar e comentar para que fique claro o que foi feito e por quê. 


### O repositório final

### *Download* do material

Aqui: https://github.com/liibre/aula_pratica_MNRJ_out_2021 ficou o repositório de exemplo do que eu criei durante a aula. 

Você pode fazer o download do arquivo ZIP:

  - Clicando no botão verde “Code” e selecionando a última opção: **download\_zip** ou
  - Clicando neste link <https://github.com/liibre/aula_MNRJ_out_2021/archive/main.zip>.

Deszipe* o arquivo .zip e entre na pasta. Abra o projeto fazendo click em **aula_pratica_MN.Rproj**

(*Não esqueça de deszipar!)

O fato de ser um repositório de GitHub* faz com que eu consiga atualizar qualquer coisa e vocês tenham acesso a essas atualizações. Como está agora ([link](https://github.com/liibre/aula_pratica_MNRJ_out_2021/commit/3dd6e30cda4093994db3ee270598c23bbe808bb3)) é como ficou exatamente depois da aula, mas esse código precisa ser limpo e comentado. 

\* Sim, é um repositório similar ao repositório de onde instalamos CoordinateCleaner 


