![](https://i.imgur.com/3mtdFLZ.jpg) --- Inferência Bayesiana no MrBayes - Computador === ## Rodar IB no MrBayes PS.: Para rodar a análise no servior do CIPRES, veja [aqui](https://hackmd.io/@ana-moraes/MrBayesCipres). 1. Abra o **Mrbayes.exe** (Ubuntu: pelo terminal, vá para a pasta MrBayes e digite src/mb) ![](https://i.imgur.com/k3cD3F0.png) 2. **Arraste o arquivo desejado para o MrBayes** para que ele exiba o caminho do arquivo, se preferir, digite manualmente. Remova as aspas simples. ![](https://i.imgur.com/sydIUlc.png) 3. Clique no botão **"home"** no teclado (isso fará o cursor ir para o início da linha de comando). Escreva o comando **"execute "** (com espaço) antes do diretório. Clique em **"Enter"** no teclado. ![](https://i.imgur.com/ELKQVzo.png) 5. A seguinte janela aparecerá, o que indica que a análise começou. ![](https://i.imgur.com/GlEgyBv.png) 6. Quando a análise terminar, aparecerá a janela abaixo com informação sobre o valor do desvio padrão e com uma pergunta se desejamos continuar a análise. O valor do **desvio padrão deve estar abaixo de 0.01**. Se estiver abaixo, digite "n". Caso o valor esteja superior, digite "yes" para que a análise continue e informe um valor adiconal de gerações. ![](https://i.imgur.com/NZJUxt6.png) 7. Para cortar 20% do início da cadeia MCMC digite o comando: **sump burnin=200000** (sempre confira o número de gerações correspondente a 20%) ![](https://i.imgur.com/E3Di0Gv.png) 8. Digite o comando **sumt** para sumarizar os resultados. ![](https://i.imgur.com/8c1EvwA.png) 9. O resultado estará na mesma pasta que seu arquivo input. Procure pelo arquivo **.tre** para abrir a árvore em um editor de árvores como FigTree (Veja o tutorial para o FigTree [aqui](https://hackmd.io/@7zDJK5KOTI2_fVCgeYVW9A/SyjqvG_eH/edit)). Para ajuda, consulte o manual do [MrBayes](http://nbisweden.github.io/MrBayes/manual.html). ###### tags: `Sistemática Filogenética` `PPG Evolução e Diversidade`