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title: 'Edição de árvores filogenéticas no Figtree'
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Edição de árvores filogenética no Figtree
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## Conteúdo

[TOC]

## Download do Figtree

1. Visite o site https://github.com/rambaut/figtree/releases
2. Baixe o arquivo **FigTreev.1.4.4.zip (Win)** ou **FigTree_v1.4.4.tgz (Linux)**


3. Descompacte o arquivo. Entre na pasta descompactada e execute o arquivo **FigTree.exe** (no Linux vá para lib>FigTree.jar). O programa executável se abrirá como abaixo.


## Edição de árvores 1

1. Abra o arquivo **.tre** resultado de sua análise filogenética.


2. No canto esquerdo há diversas ferramentas que podem ser utilizadas para edição das árvores. Em **Layout** é possível alterar o formato da árvore.


3. Em **Appeareance > line weight** é possível alterar a espessura das linhas, colorir ramos de acordo com bootstrap ou PP, etc.


4. Em **trees > transform branches** é possível homogeinizar o tamanho dos ramos.


5. Em **tip labels** é possível aumentar, trocar fonte e deixar em itálico o tamanho dos nomes dos terminais.


6. Em **branch labels** é possível observar os valores de bootstrap, caso a árvore seja resultante de uma análise de bootstrap. (*Veja mais em Edição de árvores 2 - Bootstrap*)

7. Em **scale bar** é possível aumentar o tamanho da escala, ou até mesmo retirá-la ao desmarcar a caixa.


8. Muitas outras opções de edição são possíveis no FigTree permitindo editar a árvore para publicação. É possível mudar o estilo da fonte, cores da fonte e ramos. Por exemplo, em **Layout > Curvature**, é possível suavizar a borda dos ramos, deixando mais curvos ou mais retos.


## Edição de árvores 2 - Bootstrap

1. Abra o arquivo **.tre** resultado de sua análise filogenética.

2. Abra também o arquivo resultante da sua análise de bootstrap. O Figtree perguntará qual nome você quer dar para os valores que estão embutidos na árvore. Insira um nome abreviado, p. ex. **"btp" ou "pp"** e dê ok.

3. Sua árvore de bootstrap será aberta.


4. Vá em **branch labels** e selecione a caixa. Em **display** selecione o nome abreviado dado anteriormente para o bootstrap. Os valores serão exibidos nos ramos.


**OBS.: ATENÇÃO, ESSA NÃO É A SUA ÁRVORE VERDADEIRA, ELA FOI CALCULADA SOMENTE PARA O BOOSTRAP. ESSES VALORES DE BOOTSTRAP DEVEM SER INSERIDOS NA SUA ÁRVORE RESULTANTE DA ANÁLISE FILOGENÉTICA.**

5. Para inserir os dados de boostrap na sua árvore verdadeira abra a mesma no Figtree.

6. Você precisará clicar em cada um dos ramos correspondentes que possuem suporte de boostrap.


7. Depois clique em **Annotate** na barra de tarefas superior. Uma nova janela se abrirá. Insira o valor de bootstrap correspondente para aquele ramo e dê ok.


8. Agora vá em **branch labels**, selecione a caixa e em **display** selecione **names**.


9. Aumente o tamanho da fonte, se necessário.


10. Repita o mesmo para cada ramo até que todos os valores de bootstrap sejam inseridos.

**O FIGTREE É UM PROGRAMA BÁSICO. PARA PROGRAMAS MAIS SOFISTICADOS COMO:**

Pacote P4 para o Python (http://p4.nhm.ac.uk/index.html)

TreeGraph2 www.treegraph.bioinfweb.info

Tree viewer www.etetoolkit.org/treeview/

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###### tags: `Sistemática Filogenética` `PPG Evolução e Diversidade`