Concantenação de matrizes usando Mesquite
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Antes de começar, confira se todos os nomes estão iguais entre os diferentes arquivos! Isso é fundamental para que o programa possa reconhecer duas sequências como sendo do mesmo táxon.
Sugestão: use o [NotePad](https://notepad-plus-plus.org/) e para remover os códigos do GenBank use a função substituir tudo buscado pela **expressão regular ^>(...........)** para substituir por **>**. O número de pontos entre os parenteses indica quantos caracteres devem ser substituídos. Remova o final da descrição do GenBank e edite os nomes. Após essa checagem, siga o passo-a-passo:

1. Abra um dos arquivos de alinhamento no formato .nex no [Mesquite](https://www.mesquiteproject.org/). Vá em **file**> **open** > selecione o arquivo e abra.

2. O Mesquite irá abrir uma nova janela com os seus dados:


3. Nesta nova janela aberta com seus dados, vá em **File** > **Include File** para abrir o segundo arquivo em formato .nex.


4. Renomeie seus conjuntos de dados: assim ficará mais fácil na hora de concatenar as diferentes sequências


5. Quando tiveres feito o *up load* de todas as partições, vamos começar a concatenação. Clique em **Matrix** > **Utilities** > **Concatenate other matrix**. Abrirá uma janela mostrando as opções de matrizes para concatenar, selecione uma por vez.


7. A primeira matriz agora está concatenada.


8. Exporte o arquivo com uma extensão a escolher dependendo da análise. Na janela da matriz concatenada, clique em **File** > **Export** e selecione a extensão mais apropriada para a análise que desejas realizar. Por exemplo, exporte no formato **Nexus** ou **Phylip (DNA/RNA)** para realizar análise de ML ou selecione a opção **Export to MrBayes** para Inferência Bayesiana.


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