# Biyoinformatik eğitim içerik
## kitaplar (Turcademy)
1. uygulamalı biyoinformatik
* temeller
* veri tabanları
* dizi karşılaştırmaları
* genom çözümleme
* genom dizileme, karakterizasyon, genler
* bireysel farklılıklar
* ngs
* protein yapısı ve yapı temelli ilaç dizayn
* ilgili Galaxy Tutorial : "[Virtual screening of the SARS-CoV-2 main protease with rxDock and pose scoring](https://training.galaxyproject.org/training-material/topics/computational-chemistry/tutorials/covid19-docking/tutorial.html)"
* genom işlevsel analiz
* karşılaştırmalı genom analizi
2. biyoinfo temel ve uygulamaları (baloğlu)
* giriş
* veri tabanları
* veri tabanı üzerinden dizi karşılaştırma
* gen ve promotor analizi
* protein yapı analizi
* mol filogenetik analiz
* biyolojik ağlar
* genom proje ve gen aile analizi
* rna-seq mikroarray gen ifade
* gelecek
3. Genomik Analiz İçin Biyoinformatik Yöntemler
* bu kitaptan, software veya tool listesi alınabilir, ana kitapta işlenen konuyla ilgili olarak.
# Yapılacaklar
[ ] 1. kitabın ingilizcesinden slayt çıkarma (a.yilmaz)
[ ] 2. kitabın resimleri ve captionları markdown olarak hazırlanması (n.yonet)
[ ] galaxy sayfasına 1.kitabın alıştırmalarını taşıma
[ ] galaxy tutoriallarından bize/kitaba uygun olanlarının bulunup hazırlanması
[ ] galaxy'de hali hazırda bulunan tool ile kitapta kullanılan bir konuyu birleştirip alıştırma yapma. yani, ilk konuyu kullanan bir tutorial'dan sonra, ikinci konu için hem 1. hem de 2. konuları içeren bir Galaxy tutorial hazırlama. 4-5. konularda da geçmiş konuların olabildiğince hepsini içeren galaxy için senaryolar hazırlama
[ ] galaxy'de bir kaç tool birleştiren ve birden fazla input'a uygulanabilen workflow hazırlama