## 引入本機資料
在container內使用外部檔案，設定 `--volume` 或 `-v` 並指定在container可以access的路徑名稱，例如:

## my input file: /path/to/input/input.txt

docker run -v /path/to/input:/data my_container:latest -input /data/input.txt

singularity 也有相似指令 `--bind`

singularity exec --bind /path/to/input:/data,/path/to/other:/index my_sing.sif -input /data/input.txt -output /index 

## 修改寫入權限
有時遇到 docker 輸出檔案的權限為 **root** ，若以後要修改刪除等操作會不方便，使用 `--user $(id -u):$(id -g)` 來將輸出的owner, group 權限給下指令的使用者，例如:

docker run -it -rm -v /path/to/input:/data --user $(id -u):$(id -g) my_container:latest -input /data/input.txt -output /data/output.txt

若owner為使用者，之後還可通過linux `chgrp` 修改 group 權限

## container執行完一併刪除
加上 `--rm`

## 用 Dockerfile 建立 docker 並使用
前陣子使用某docker遇到bug無法執行成功，因此稍微修改他的dockerfile -> push至dockerhub -> pull 回來使用
註1: 以下有匿名處理 docker name 請參考code就好XD
註2: 需要註冊 https://hub.docker.com/ 才能push
註3: [my references](https://ithelp.ithome.com.tw/articles/10192824)

首先登入dockerhub 建立新專案

回到linux建立docker

## cd to dockerfile directory and build docker
docker build -t local/origin_docker_fixed:latest .

## need user login 
docker login

## rename docker tag (origin TAG is <none>)
## the image name may be the same as the repository we created
docker tag 53a8d0dbxxxx pxchen/origin_docker_fixed

## check 
docker image ls

## push to the existing repository
docker push pxchen112/msisensor-pro-fixed

回到 dockerhub，點進去看push的image 以及Dockerfile layer