# Uso do [MESQUITE](https://www.mesquiteproject.org/) para realizar a análise de "Character Tracing"
###### tags: `Trace_characters` `MESQUITE` `LSV` `Unesp`
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Você pode instalar o programa **Mesquite** usando o link: [Download](https://www.mesquiteproject.org/Installation.html)

## Antes de realizar as análises são necessários dois arquivos:
1. Arquivo **NEXUS** com a matriz de caracteres que poderá ser gerada usando o próprio Mesquite ou o NDE.
_ex: seu_alinhamento.nex_
2. Arquivo da árvore que deseja fazer a análise
_ex: sua_arvore.tre_

## Como realizar a análise de Character Tracing
Abra o programa Mesquite e no menu abaixo se encontra o menu que irá submeter sua matriz.


Para abrir o arquivo da matriz de caracteres você deve clicar no menu superior no botão **"File"** e selecionar a opção **"Open File..."**


Após selecionar a matriz, aparecerá na tela a matriz:


Para adicionar a árvore para como modelo para realizar as etapas seguintes se faz necessário que você clique no botão **"Taxa & Trees"** do menu superior e selecione a opção **"With Trees from Source"**


Que abrirá a janela que você indicará que você irá usar um arquivo de árvores externo para realizar as análises, portanto selecione a opção **"Use Trees from Separate NEXUS File"**.


Após selecionar a árvore, aparecerá na tela a árvore que carregou:


Para fazer a análise de "Character Tracing" você deve clicar no botão do menu superior **"Analysis Tree"** e selecionar a opçao **"Trace Character History"**.


Que abrirá a seguinte janela, em que você deverá selecionar a opção **"Parsimony Ancestral States"**


Após realizar esse procedimento, você poderá observar como se comporta cada característica em cada clado dos grupos que realizou a análise.


Para navegar nas diferentes características, clique nas setas < [ ] > no menu: