**加速基因體定序分析 – 使用NVIDIA Clara Parabricks 以及 RAPIDS加速套
件-Workshop**
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* **時間：2022/02/15 14:00~17:00**
* **地點：國立台灣大學智慧農業教學與研究發展中心 鄭江樓南棟5樓 R505電腦教室
(10617 臺北市大安區羅斯福路四段一號)**
* **活動描述：**
- **NVIDIA Clara Parabricks** 流程是一款可立即執行的 GPU 加速的軟體套件，以Broad Institute的基因體分析工具組(GATK)為基礎，適用於群體基因體的DNA生殖細胞變異偵測；癌症基因體與腫瘤突變負荷(TMB)的DNA體細胞變異偵測；從轉錄體到單細胞分析的RNA定序專案；Google的DeepVariant，能夠使用深度神經網路進行變異偵測。Clara Parabricks流程已針對速度、準確度和可擴充性進行最佳化，可執行 GATK 4.1最佳做法，並提供完整的設定彈性，讓使用者自行選擇要執行的步驟、參數設定和流程版本。
- **RAPIDS**是一系列應用於資料科學與機器學習的軟體函式庫和API，可在GPU上執行完整的資料科學流程，並將訓練時間從數天縮短為幾分鐘，現已在生物資訊領域廣泛被使用。參加此教育訓練您能認識此解決方案，知道國內外相關研究案例，更有機會能帶著您的資料親身體驗。

* 議程：

|時間|課程內容|
|:--:|:--:|
| 14:00~14:08 |開場 / 國網中心生技醫藥核心設施平台介紹|
| 14:08~14:25 |台灣杉3號生醫專用計算環境與排程系統介紹|
| 14:25~14:55 |可擴充基因體分析解決方案 – Parabricks 說明|
| 14:55~15:25 |Parabrick 效能與案例操作 Live Demo – WES germline variant calling|
| 15:25~15:40 |中場休息|
| 15:40~16:20 |資料科學加速套件 – RAPIDS 介紹及操作 Live Demo - RAPIDS for single cell RNA analysis |
| 16:20~16:50 |國內外相關研究題目分享|
| 16:50~17:00 |意見調查回饋及交流|

* 上課名額: 40人
* 報名已額滿/成功報名的信件會陸續寄出

* 主辦單位：
財團法人國家實驗研究院國家高速網路與計算中心，NVIDIA
科技部生科司生技醫藥核心設施平台，國家生醫數位資料與分析運算雲端服務平台
* 協辦單位：國立臺灣大學生物機電工程學系