# 論文筆記 plant
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## Computer Vision with Deep Learning for Plant Phenotyping in Agriculture: A Survey : 論文筆記
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[原文網址](https://arxiv.org/abs/2006.11391)
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## Introduction
人口成長導致食物需求的上升
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## Ground-based Remote Sensing for Plant Phenotyping
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## Unmanned Aircraft Vehicles for Plant Phenotyping
* 無人機比傳統人工好的特點:
* 更彈性
* 有效率
* 空間解析度更好
* 低成本
* 簡單操作
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* UAVs 用在精緻農業管理和監控作物的方式:
* 雜草偵測
* 排灌溉的時間
* 農業模式預測
* 灑農藥
* 牛群偵測
* 昆蟲偵測
* 資料收集
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## Satellites for Plant Phenotyping
* 不可預見的大自然和氣候變遷是影響農作物產量和管理的主要因素,而政府可以幫助人民的有:
* 提供人民天氣預報的關鍵訊息
* 土壤條件等
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### 衛星影像
* 降低農民自己觀察的成本
* 最佳化水資源的分配
* 關成土地利用率和基礎場地
* 印度目前自己擁有 7 顆衛星是用來幫助農作物生產
* 栽種面積
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* 光學衛星感測器可以觀察:
* 可見光
* 靠近地表的近紅外線光波幫助我們了解作物狀況
* 幫助作物生產的方法有:
* 預測作物產量
* 作物型號
* 土壤鹽度
* 土壤濕度
* 土壤酸鹼值
* 栽種面積
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## Plant Phenotyping with limited Labeled Data
* 植物表徵的瓶頸
* 需要大量 label 過的資料集還是一個瓶頸
* 其他資料集
* 整體環境的資料機
* 植物基因序列的資料集
* 小的資料集常常導致 models overfit
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* 深度神經網路應用於植物表徵的表現很好
* 對有限的資料集的表現很好
* 極大的幫助植物表徵的社群
* 使農夫更願意依靠植物表徵科技達到更好的產量
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### Data Augumentation
電腦視覺花了很大力氣增加資料,但有些限制 擴增資料只可以抓到可變的資料集(e.g. 如果資料集沒有包括特定顏色的水果,那特定的案例永遠學不到)
像這塊可以使用 GAN 來做新的圖片
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### Weakly Supervised Learning
* 做水果數量計算
* 傳統的 vision-based solution
* 要有很多 label 後的資料
* 也會有標注不準確的問題
* 而有些水果,也不好取得足夠的 label 資料
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* 有人應用 weakly supervised learning for plant phenotyping
* 對高粱的果實進行偵測
* 使用 label 的資料只要到 model 達到足夠的表現
* 透過些許的 loss 的增加
* 達到需要的 label data 指數性的下降
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* 作者也提出計算水果不用特別的 label
* e.g. 手動匡出特定的區域或是所有的數量
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### Transfer Learning
* 就是可以讓知識轉移
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### Active Learning
* 可以自動選出好的樣本讓機器學習
* 減少手動 label 的需求
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## Challenges and Open Problems
* 有哪些存在於 植物表徵 的挑戰
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### The Training Data Bottleneck
* 減少深度學習對於大量 label 資料的需求
* 還沒有很好減低人工 label 資料的工具
* 使用前述的方法可以有很好的解法,像是 unsupervised, self-supervised, weakly supervised, active and semi-supervised learning
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### Explainability
* 深度學習一直像是黑盒子,他產生預測而沒有足夠的公正性
* 使用 explainable ai
* 可以有方法對這個深度神經網路 debug
* 可以知道是什麼導致錯誤的預測
* 對作物進行預測也可以知道是什麼導致出來的結果不好
* 所以發展 explainable models 也是一個挑戰
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### Data collection
* 使用 vision based plant phenotyping 的問題
* 因為天氣改變導致收集到比較暗的圖片
* 因此建立強大的 tools 應對視覺改變是必要的
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### Conclusions
高產量的 植物表徵 的方法已經被保證在 有效率監控作物為了培育和管理作物
我們可以做的事發展前述的工具來觀察作物特徵
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* 高產量的 phenotyping 工具被一些問題限制:
* 在大資料集下的深度網路的相依關係,資料集很難組織
* 因為收集資料的場域變化所導致資料難以收集的情形
* 對發展中國家,資本和維護成本不能太貴
* 目前是一個很好時機用深度學習來研究 plant phenotyping
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