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# System prepended metadata

title: Taller QIIME2 con valor 20 puntos

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# Taller QIIME2 con valor 20 puntos 
# Bioinformática 2022-2 @ Bioingeniería FIAD UABC Ensenada
#### Instructor: Dante Alberto Magdaleno Moncayo



Link de descarga para metadata, clasificador y secuencias:
[https://drive.google.com/drive/folders/1K9ftvKd5HR_QJuFZvfOsU4QnMXMk-X_B?usp=sharing]



* Importar secuencias paired-end que se encuentran ya desmultiplexadas y generar el vizualizador.

Evidencia: Comandos utilizados y describir los resultados de la gráfica Interactive quality Plot.

* Generar los siguientes artefactos con sus vizualizadores:


a)table .qza y .qzv
b)secuencias representativas .qza y .qzv
c)estadísticos del denoise .qza y .qzv
Evidencia:
Describir los resultados de cada .qzv obtenido


* Generar árbol filogenético para análisis de diversidad taxonómica.**


* Realizar el core-metrics-phylogenetic**

**-Realizar gráfica de rarefacción.**

Evidencia: Describir y explicar lo que se observa en la gráfica de rarefacción.

**-Vizualizar las gráficas emperor UNIFRAC ponderado y no ponderado.**
Evidencia: Discutir compararndo las dos gráficas



**-Realizar asignación taxonómica con el clasificador greengenes y generar gráfica de abundancia relativa.**

Evidencia: Comandos utilizados y print screen de la gráfica de abundancia y describir y discutir los resultados de la gráfica en los niveles 1, 2 y 3.
