# Taller QIIME2 con valor 20 puntos # Bioinformática 2022-2 @ Bioingeniería FIAD UABC Ensenada #### Instructor: Dante Alberto Magdaleno Moncayo Link de descarga para metadata, clasificador y secuencias: [https://drive.google.com/drive/folders/1K9ftvKd5HR_QJuFZvfOsU4QnMXMk-X_B?usp=sharing] * Importar secuencias paired-end que se encuentran ya desmultiplexadas y generar el vizualizador. Evidencia: Comandos utilizados y describir los resultados de la gráfica Interactive quality Plot. * Generar los siguientes artefactos con sus vizualizadores: a)table .qza y .qzv b)secuencias representativas .qza y .qzv c)estadísticos del denoise .qza y .qzv Evidencia: Describir los resultados de cada .qzv obtenido * Generar árbol filogenético para análisis de diversidad taxonómica.** * Realizar el core-metrics-phylogenetic** **-Realizar gráfica de rarefacción.** Evidencia: Describir y explicar lo que se observa en la gráfica de rarefacción. **-Vizualizar las gráficas emperor UNIFRAC ponderado y no ponderado.** Evidencia: Discutir compararndo las dos gráficas **-Realizar asignación taxonómica con el clasificador greengenes y generar gráfica de abundancia relativa.** Evidencia: Comandos utilizados y print screen de la gráfica de abundancia y describir y discutir los resultados de la gráfica en los niveles 1, 2 y 3.